VSE knjižnice (vzajemna bibliografsko-kataložna baza podatkov COBIB.SI)
  • Vrednotenje metode za določanje prisotnosti virusa SARS-CoV-2 na osnovi obratne transkripcije in multiple verižne reakcije s polimerazo v različno odvzetih vzorcih sline = Evaluation of multiplex reverse transcriptase - polymerase chain reaction for detection of SARS-CoV-2 virus in differently collected saliva samples : enoviti magistrski študij farmacije
    Pusser, Katarina
    Decembra 2019 so se v Wuhanu na Kitajskem prvič začele pojavljati okužbe z novim koronavirusom SARS-CoV-2, ki so se kmalu sunkovito razširile po svetu. Kužnost virusa je visoka, saj ena okužena oseba ... v povprečju okuži dve do tri zdrave osebe. Za namene diagnosticiranja okužbe poznamo več metod, med katerimi ostajajo zlati standard molekularni testi, ki temeljijo na RT-PCR metodi. Vzorci so najpogosteje pridobljeni iz enostavno dostopnih območij, kot je nosno-žrelni bris. Ti brisi so neprijetni za odvzem in predstavljajo veliko tveganje za prenos okužbe na zdravstveno osebje, zato se za namene množičnega testiranja raziskujejo dodatne možnosti vzorčenja. Slina predstavlja potencialni alternativni vzorec za detekcijo okužbe, zato se ji na področju razvijanja testov v zadnjem času namenja veliko pozornosti. Vzorčenje sline je neinvazivno, ugodnejše in predstavlja manjše tveganje za prenos okužbe na osebje. V namene proučevanja sline smo vzpostavili multiplo RT-qPCR metodo. Določili smo analizno občutljivost 3 kopij virusne RNA/reakcijo oz. 3000 kopij/mL. Naša metoda tako ustreza intervalu zaznavnosti odobrenih metod s strani Evropske komisije in je dovolj občutljiva, da zazna virus v slini pred pojavom simptomov. Metodo smo ovrednotili z različno odvzetimi vzorci sline. Primerjali smo vzorce pridobljene s slinjenjem, rejonsko in najlonsko palčko. Rezultate testiranja vzorcev smo primerjali z vzorci nosno-žrelnega brisa, ki jih je preiskovancem odvzelo zdravstveno osebje za namene splošnega testiranja na virus. Potrdili smo, da način odvzema vzorca sline vpliva na diagnostično občutljivost, ne vpliva pa na diagnostično specifičnost testa. Najboljše rezultate daje odvzem vzorca s slinjenjem s skupno občutljivostjo 85 % pri Cp < 30. Vzorci, pridobljeni s slinjenjem, imajo prav tako najboljše ujemanje z rezultati vzorcev nosno-žrelnega brisa, uradno potrjene metode iz NLZOH (90 % pri Cp < 30). Zbiranje sline s slinjenjem je torej primeren način pridobivanja vzorca. Nato smo primerjali klinično-diagnostične lastnosti naše metode za vzorce slinjenja s primerljivimi metodami, izvedenimi na Kemijskem inštitutu (KI) in Nacionalnem inštitutu za biologijo (NIB). Preverjali smo vpliv reakcijskega volumna na rezultate testiranja, saj smo na Fakulteti za farmacijo izvedli multiplo RT-qPCR z manjšimi reakcijskimi volumni kot na KI in NIB. S primerjavo smo potrdili, da je uporaba večjih volumnov primernejša. Pri manjših volumnih smo dobili več lažno negativnih rezultatov, kar se kaže v slabši občutljivosti.
    Vrsta gradiva - magistrsko delo ; neleposlovje za odrasle
    Založništvo in izdelava - Ljubljana : [K. Pusser], 2021
    Jezik - slovenski
    COBISS.SI-ID - 91838979

Knjižnica/institucija Kraj Akronim Za izposojo Druga zaloga
Fakulteta za farmacijo, Ljubljana Ljubljana FFALJ v čitalnico 1 izv.
loading ...
loading ...
loading ...

Vnos na polico