Fakulteta za farmacijo, Ljubljana (FFALJ)
  • Vrednotenje vsebnosti fosfatov in aminov v bakterijskem peptidoglikanu po različnih postopkih čiščenja in označevanje peptidoglikana = Evaluation of phosphate and amine content in bacterial peptidoglycan following various purification procedures and labeling of peptidoglycan : enoviti magistrski študijski program Farmacija
    Ristić, Slađana
    Peptidoglikan predstavlja ključno komponento bakterijske celične stene in se nahaja skoraj v vseh bakterijah. Sodeluje v številnih življenjsko pomembnih celičnih procesih za mikroorganizem in ima ... tudi pomembno zaščitno vlogo. Številni encimi, ki sodelujejo v biosintezi in razgradnji peptidoglikana predstavljajo pomembno tarčo v razvoju antibiotikov, ki lahko z zaviranjem teh encimov povzročijo lizo bakterijske celice. Namen magistrske naloge je bil ovrednotiti peptidoglikan z vidika vsebnosti fosfata, ki sovpada z vsebnostjo tehojske kisline in prostih aminskih skupin, ki pa odražajo poškodbe na peptidoglikanu. Vzorce peptidoglikana, ki smo jih vrednotili, so izolirali iz treh različnih sevov bakterij (S. aureus, B. subtilis, [delta]SagB S. aureus) in nato liofilizirali, mi pa smo jih tretirali oz. očistili pod različnimi pogoji. Vsebnost fosfatov smo določali s priročnim enostopenjskim reagentom za določanje prostih fosfatov - reagentom BIOMOL GREEN. Proste aminske skupine pa smo detektirali s pomočjo ninhidrinske reakcije. Testirali smo dve seriji vzorcev peptidoglikana. Po vrednotenju prve serije vzorcev smo ugotovili, da tisti, ki so bili tretirani s HF, vsebujejo najmanj fosfatov in prostih aminskih skupin. Tako so v drugi seriji vzorcev vse očistili s HF; razlika med njimi je bila v času tretiranja. Pri vzorcih, ki so jih tretirali 24 h, smo ugotovili najmanjše poškodbe peptidoglikana. V drugem delu eksperimentalnega dela smo se lotili označevanja peptidoglikana s fluorescenčno sondo (barvilom). Za označevanje smo izbrali najprimernejši peptidoglikan, tj. peptidoglikan z najnižjo vsebnostjo fosfatnih skupin in prostih aminskih skupin obenem. Označeni peptidoglikan je namreč substrat za encimski test na osnovi fluorescenčne detekcije, s katerim vrednotimo kinetiko izbranih encimov, ki razgrajujejo peptidoglikan. Najvišjo aktivnost smo določili pri encimu AtlA-gl, saj je najuspešneje cepil naš substrat. Pri ostalih dveh encimih (AtlE in SagB) je bila aktivnost komaj zaznavna. Spoznanje, da je najoptimalnejša metoda za čiščenje peptidoglikana 24 h tretiranje s HF, predstavlja pomembno izhodišče za pripravo vzorcev peptidoglikana, ki bi jih želeli v prihodnosti uporabiti za merjenje aktivnosti različnih encimov, ki sodelujejo v biosintezi oz. razgrajevanju te življenjsko pomembne komponente bakterijske celične stene.
    Vrsta gradiva - magistrsko delo ; neleposlovje za odrasle
    Založništvo in izdelava - Ljubljana : [S. Ristić], 2020
    Jezik - slovenski
    COBISS.SI-ID - 25163011

    Povezava(-e):

    https://repozitorij.uni-lj.si/IzpisGradiva.php?id=117208

Signatura – lokacija, inventarna št. ... Status izvoda Rezervacija
Knjižnica
emšf 0000000615 RISTIĆ SLAĐANA Vrednotenje 0000000860
IN: 0016648 Knjižnica
emšf 615 RISTIĆ SLAĐANA Vrednotenje 860
IN: 0016648 		prosto - za čitalnico
loading ...
loading ...
loading ...

Vnos na polico