Fakulteta za farmacijo, Ljubljana (FFALJ)
-
Vpliv sprememb G-kvadrupleksa v promotorju gena TNFSF11 na njegovo aktivnost = The study of G-quadruplex changes in TNFSF11 gene promoter on its activity ; magistrska naloga : enoviti magistrski študij farmacijeBorovnik, Rebeka, 1993-Obnavljanje kostnega tkiva je uravnano z različnimi mehanizmi in dejavniki, med katerimi ima pomembno vlogo sistem RANK/RANKL/OPG. V primeru neustreznega uravnavanja tega sistema se lahko poveča ... izražanje proteina RANKL in s tem neposredno zveča nastajanje in aktivnost osteoklastov, kar poveča razgradnjo kostnine in lahko vodi v nastanek kostnih bolezni, npr. osteoporoze. Pri uravnavanju izražanja gena za protein RANKL (TNFSF11) ima pomembno vlogo promotorska regija, saj v svojem zapisu vsebuje regulatorne elemente. Ti omogočajo vezavo različnih transkripcijskih faktorjev in tako pospešijo ali zavrejo izražanje RANKL. V promotorski regiji gena TNFSF11 se nahaja tudi struktura, imenovana G-kvadrupleks, za katero je bilo že v številnih študijah ugotovljeno, da ima velik vpliv na izražanje različnih genov. Namen magistrske naloge je bil ugotoviti, kakšen je vpliv G-kvadrupleksa in sprememb v njegovem zaporedju na aktivacijo promotorske regije v genu za RANKL (TNFSF11). Dodatno smo želeli proučiti vpliv SNP-jev rs2296533 in rs9533157, ki se nahajata v bližini G-kvadrupleksa in ugotoviti, ali imajo tudi spremembe na tem mestu vpliv na aktivacijo promotorja. Za analizo vpliva G-kvadrupleksa na aktivnost promotorja gena TNFSF11 smo naredili mutacijsko analizo promotorske regije in izmerili aktivnost mutiranega in nemutiranega promotorja s pomočjo dvojnega luciferaznega testa v treh sesalskih celičnih linijah % HeLa, A549 in HOS. Pri delu smo uporabljali plazmidne vektorje pGL3, ki so vsebovali del zapisa promotorske regije gena TNFSF11. Z mutagenezo smo v promotorju gena TNFSF11 ustvarili mutacije na različnih delih G-kvadrupleksa, mutirali smo tudi polimorfna mesta rs2296533 in rs9533157. Pripravljene plazmidne vektorje smo nato s postopkom transfekcije vnesli v vse tri sesalske celične linije. Sledilo je merjenje njihovega vpliva na aktivacijo promotorske regije gena TNFSF11 s pomočjo dvojnega luciferaznega testa. Vnesene mutacije so povečale (RANGdel, RANG1T, RANG4T, RANG1234T ter posamezna SNP-ja rs2296533 in rs9533157) oz. zmanjšale aktivnost (RANG2713T in dvojna mutacija rs2296533, rs9533157) promotorja v sesalskih celičnih linijah HeLa in A549, v celicah HOS pa njihov vpliv ni bil tako izrazit. Naši rezultati so pokazali, da G-kvadrupleks z normalnim zaporedjem nukleotidov znižuje aktivnost promotorja in že najmanjša sprememba v zaporedju močno spremeni njegovo delovanje. Z analizo SNP-jev (rs2296533 in rs9533157) smo ugotovili, da tudi ta dva polimorfizma vplivata na aktivnost promotorja za RANKL. Naše ugotovitve potrjujejo, da je tudi tridimenzionalna struktura nukleotidnih zaporedij pomembna za aktivnost promotorja in lahko doprinese k boljšemu genetskemu odkrivanju posameznikov s povečano kostno razgradnjo oziroma s povečanim tveganjem za osteoporozo.Vrsta gradiva - magistrsko delo ; neleposlovje za odrasleZaložništvo in izdelava - Ljubljana : [R. Borovnik], 2018Jezik - slovenskiCOBISS.SI-ID - 4544625
Avtor
Borovnik, Rebeka, 1993-
Drugi avtorji
Marc, Janja |
Lovšin, Nika
Teme
Osteoporoza |
polimorfizem posameznega nukleotida |
TNFSF11 |
G-kvadrupleks |
mutageneza |
RANKL
Signatura – lokacija, inventarna št. ... |
Status izvoda | Rezervacija |
---|---|---|
Knjižnica emšf 0000000616 BOROVNIK REBEKA Vpliv 0000000573 IN: 0015812 Knjižnica emšf 616 BOROVNIK REBEKA Vpliv 573 IN: 0015812 |
prosto - za čitalnico
|
Vnos na polico
Trajna povezava
- URL:
Faktor vpliva
Dostop do baze podatkov JCR je dovoljen samo uporabnikom iz Slovenije. Vaš trenutni IP-naslov ni na seznamu dovoljenih za dostop, zato je potrebna avtentikacija z ustreznim računom AAI.
Leto | Faktor vpliva | Izdaja | Kategorija | Razvrstitev | ||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
JCR | SNIP | JCR | SNIP | JCR | SNIP | JCR | SNIP |
Baze podatkov, v katerih je revija indeksirana
Ime baze podatkov | Področje | Leto |
---|
Povezave do osebnih bibliografij avtorjev | Povezave do podatkov o raziskovalcih v sistemu SICRIS |
---|---|
Borovnik, Rebeka, 1993- | |
Marc, Janja | 12189 |
Lovšin, Nika | 19649 |
Vir: Osebne bibliografije
in: SICRIS
Izberite prevzemno mesto:
Prevzem gradiva po pošti
Naslov za dostavo:
Med podatki člana manjka naslov.
Storitev za pridobivanje naslova trenutno ni dostopna, prosimo, poskusite še enkrat.
S klikom na gumb "V redu" boste potrdili zgoraj izbrano prevzemno mesto in dokončali postopek rezervacije.
S klikom na gumb "V redu" boste potrdili zgoraj izbrano prevzemno mesto in naslov za dostavo ter dokončali postopek rezervacije.
S klikom na gumb "V redu" boste potrdili zgoraj izbrani naslov za dostavo in dokončali postopek rezervacije.
Obvestilo
Trenutno je storitev za avtomatsko prijavo in rezervacijo nedostopna. Gradivo lahko rezervirate sami na portalu Biblos ali ponovno poskusite tukaj kasneje.
Gesla v Splošnem geslovniku COBISS
Izbira mesta prevzema
Gradivo iz matične enote je brezplačno. Če je gradivo na mesto prevzema dostavljeno iz drugih enot, lahko knjižnica to storitev zaračuna.
Mesto prevzema | Status gradiva | Rezervacija |
---|
Rezervacija v teku
Prosimo, počakajte trenutek.
Rezervacija je uspela.
Rezervacija ni uspela.
Rezervacija...
Članska izkaznica:
Mesto prevzema: