Narodna in univerzitetna knjižnica, Ljubljana (NUK)
Naročanje gradiva za izposojo na dom
Naročanje gradiva za izposojo v čitalnice
Naročanje kopij člankov
Urnik dostave gradiva z oznako DS v signaturi
  • Protein solubility classification in biomedical concept space : doktor of philosophy thesis = Klasifikacija topnosti proteinov v prostoru biomedicinskih konceptov tekstovne analize : doktorska disertacija
    Kocbek, Simon
    Proteini so pomemben del vsakega organizma in imajo številne pomembne funkcije, katere so v veliki meri odvisne od strukture proteina. Zadnja je mnogokrat predmet raziskav, kjer strokovnjaki ... izolirajo posamezen protein in proučijo njegove strukturne lastnosti. Na proces izolacije proteina v veliki meri vpliva njegova topnost, saj je protein z nizko stopnjo topnosti zelo težko izolirati. Prav tako so netopni proteini razlog za nekatere pomembne bolezni. Zaradi teh razlogov želijo strokovnjaki velikokrat vnaprej vedeti, kateri proteini imajo več možnosti za visoko stopnjo topnosti. Posledično so se razvile številne metode, ki uporabljajo tehnike nadzorovanega strojnega učenja za klasifikacijo topnosti proteinov. Te metode klasificirajo proteine vtopne in ne-topne ter se uporabljajo za napovedovanje topnosti za nove primerke. V disertaciji predlagamo novo metodo za klasifikacijo topnosti proteinov, ki s pomočjo tehnik tekstovnega rudarjenja izlušči medicinsko znanje iz strokovne literature in ga predstavi v obliki atributov. Te atributepoimenujemo atributi biomedicinskih konceptov in predstavljajo novost na področju klasifikacije topnosti proteinov. Do sedaj uporabljene metode so namreč omejene z uporabo atributov, ki so večinoma izpeljani le iz sekvence proteina. V okviru disertacije tako podamo številne znanstvene prispevke. Predlagana je metoda za ekstrakcijo atributov biomedicinskih konceptov iz strokovne literature na podlagi imena oziroma identifikacijske številke proteina. Nadalje ponudimo originalno primerjavo metod, ki uporabljajo nove atribute, z metodami, ki ponujajo že uveljavljene atribute izpeljane iz sekvence proteina. Kot se pokaže v disertaciji, novi atributi doprinesejo k uspešnosti klasifikacije topnosti proteinov. Podan je tudi algoritem za implementacijo najuspešega klasifikatorja z atributi biomedicinskih konceptov.Zadnji prispevek vključuje novo medicinsko znanje, ki ponudi indice o tem, katere skupine besed in besednih zvez iz strokovne literature so najbolj povezane s topnostjo proteinov. Disertacija je sestavljena iz skupno osem poglavij, katera podrobno predstavijo teoretično ozadje področij, kot so nadzorovano strojno učenje, tekstovno rudarjenje ter struktura in topnost proteinov. Obsežen del disertacije je namenjen opisu proteinskih podatkovnih baz, ki ponujajo informacije o topnosti proteinov ter opisu razvite metode in njene primerjave z do sedaj uporabljanimi metodami. Izvedena je empirična primerjava dvajsetih baz sekvenčnih atributov, ki jim postopoma dodajamo nove atribute in spremljamo doprinose k uspešnosti treh pogosto uporabljanih klasifikacijskih metod.
    Vrsta gradiva - disertacija ; neleposlovje za odrasle
    Založništvo in izdelava - [Maribor : S. Kocbek], 2011
    Jezik - angleški
    COBISS.SI-ID - 15496470

Rezervirajte gradivo na želenem mestu prevzema.

Mesto prevzema Status gradiva Rezervacija
Časopisna čitalnica
prosto - za čitalnico
Velika čitalnica
prosto - za čitalnico
Signatura – lokacija, inventarna št. ... Status izvoda
GS II 0000712802 glavno skladišče GS II 712802 glavno skladišče prosto - za čitalnico
loading ...
loading ...
loading ...