ALL libraries (COBIB.SI union bibliographic/catalogue database)
-
Vrednotenje vezave bisfenolov na estrogenski receptor alfa s farmakofornimi modeli in virtualnim rešetanjem = Evaluation of bisphenol binding to estrogen receptor alpha by pharmacophore models and virtual screening : enoviti magistrski študijski program FarmacijaIskra, AnamarijaBisfenol A ali BPA je najbolj znan predstavnik skupine bisfenolov. Mehanizem njegovega vpletanja v delovanje endokrinega sistema preko estrogenskega receptorja alfa (ER[alfa]) je dobro raziskan in ... predstavlja osnovo številnih regulatornih omejitev uporabe BPA. V industriji plastike zato narašča uporaba analogov BPA, ki so veliko manj raziskani ter jih regulatorne omejitve zajemajo zgolj v manjši meri. Na podlagi strukturne podobnosti spojin z BPA imajo njegovi analogi potencial tudi za podobne toksične učinke na endokrini sistem. V okviru magistrske naloge smo s pomočjo metod virtualnega rešetanja s farmakofornimi modeli ter molekulskega sidranja proučevali vezavo 38 izbranih analogov BPA v ER[alfa]. V programu LigandScout smo pripravili farmakoforne modele na podlagi strukture ligandov in na podlagi strukture vezavnih mest ER[alfa] izbranih PDB kristalnih struktur ter jih ovrednotili z virtualnim rešetanjem s knjižnicami aktivnih ter neaktivnih spojin na ER[alfa]. Modeli, ki temeljijo na strukturi vezavnega mesta, so pričakovano pokazali večjo napovedno vrednost vezave preiskovanih spojin v ER[alfa]. Molekulsko sidranje smo izvedli s pomočjo programskega orodja AutoDock Vina v vezavnih žepih štirih izbranih kristalnih struktur 3UU7, 3UUA, 3UUC in 3UUD. Za rezultate ovrednotenja farmakofornih modelov v obliki vrednosti ujemanja s farmakofornim modelom (VUFM), ki opisuje ujemanje interakcij spojine s farmakofornimi elementi, ter rezultate sidranja v obliki internega parametra afinitete (kcal/mol), smo preverili korelacijo z biološkimi literaturnimi vrednostmi o jakosti vezave spojin ter in vitro pridobljenimi vrednostmi na Fakulteti za farmacijo. Omenjene vrednosti ne nakazujejo dobre korelacije, ocena slednje je težavna in nezanesljiva zaradi majhnega razpona ter pomanjkanja literaturnih podatkov o jakosti vezave spojin na ER[alfa]. V drugem delu naloge smo pripravljene farmakoforne modele in molekulsko sidranje uporabili za analizo spojin, ki so povezane s proizvodnjo plastike. Podatki o spojinah so povzeti po članku z naslovom: Overview of known plastic packaging-associated chemicals and their hazards. Oba uporabljena pristopa analize, molekulsko sidranje in rešetanje s farmakofornimi modeli, sta se pri identifikaciji bisfenolov in spojin s podobno strukturo enakovredno izkazala. Večina spojin iz strukturnih razredov bisfenolov in sorodnih spojin se glede na zbrane podatke iz članka uvršča med motilce endokrinega sistema (EDC). Izmed spojin, ki smo jim z molekulskim sidranjem in tudi s farmakofornimi modeli napovedali potencialno aktivnost na ER[alfa] ter hkrati še niso identificirane kot EDC, smo pripravili seznam spojin, ki so zanimive za nadaljnje raziskovanje zaradi njihovega potenciala, da delujejo kot EDC.Type of material - master's thesis ; adult, seriousPublication and manufacture - Ljubljana : [A. Iskra], 2021Language - slovenianCOBISS.SI-ID - 83473411
Author
Iskra, Anamarija
Other authors
Peterlin-Mašič, Lucija |
Toplak, Žan
Topics
Farmacevtska kemija |
bisfenoli |
motilci endokrinega sistema |
virtualno rešetanje |
farmakoforni modeli |
molekulsko sidranje |
bisfenol A |
molekulsko modeliranje
Library/institution |
City | Acronym | For loan | Other holdings |
---|---|---|---|---|
Faculty of Pharmacy, Ljubljana | Ljubljana | FFALJ |
reading room 1 cop.
|
Shelf entry
Permalink
- URL:
Impact factor
Access to the JCR database is permitted only to users from Slovenia. Your current IP address is not on the list of IP addresses with access permission, and authentication with the relevant AAI accout is required.
Year | Impact factor | Edition | Category | Classification | ||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
JCR | SNIP | JCR | SNIP | JCR | SNIP | JCR | SNIP |
Select the library membership card:
If the library membership card is not in the list,
add a new one.
DRS, in which the journal is indexed
Database name | Field | Year |
---|
Links to authors' personal bibliographies | Links to information on researchers in the SICRIS system |
---|---|
Iskra, Anamarija | |
Peterlin-Mašič, Lucija | 19317 |
Toplak, Žan | 52375 |
Source: Personal bibliographies
and: SICRIS
Select pickup location:
Material pickup by post
Delivery address:
Address is missing from the member's data.
The address retrieval service is currently unavailable, please try again.
By clicking the "OK" button, you will confirm the pickup location selected above and complete the reservation process.
By clicking the "OK" button, you will confirm the above pickup location and delivery address, and complete the reservation process.
By clicking the "OK" button, you will confirm the address selected above and complete the reservation process.
Notification
Automatic login and reservation service currently not available. You can reserve the material on the Biblos portal or try again here later.
Subject headings in COBISS General List of Subject Headings
Select pickup location
The material from the parent unit is free. If the material is delivered to the pickup location from another unit, the library may charge you for this service.
Pickup location | Material status | Reservation |
---|
Reservation in progress
Please wait a moment.
Reservation was successful.
Reservation failed.
Reservation...
Membership card:
Pickup location: