Faculty of Pharmacy, Lj. (FFALJ)
-
Vloga proteina MPP7 pri diferenciaciji celične linije človeških osteoblastov MG63 = The role of MPP7 protein in human osteoblast cell line MG63 differentiation : magistrski študijski program Laboratorijska biomedicinaDragar, BrinaVsegenomske študije (GWAS; angl. Genome Wide Association Study) imajo pomembno vlogo pri iskanju novih terapevtskih tarč. S primerjavo pojavnosti genetskih variant pri zdravih in obolelih nam ta ... način preiskovanja omogoča lokalizacijo mest v genomu in prepoznavo genov (posredno tudi proteinov), ki vplivajo na opazovano lastnost. S pomočjo te metode so ugotovili, da obstaja močna povezava med kostno gostoto in variantami membranskega palmitoiranega proteina 7 (MPP7; angl. Membrane Palmitoylated Protein 7). Kljub temu pa še vedno ni povsem znano, kakšna je njegova vloga pri diferenciaciji in aktivaciji kostnih celic. V sklopu magistrske naloge smo želeli potrditi vlogo proteina MPP7 pri diferenciaciji osteoblastov. Kot celični model smo uporabili celice osteosarkoma MG-63. Primerjali smo stopnjo diferenciacije med celicami z izbitim genom za protein MPP7 (MMP7 KO) in kontrolnimi nespremenjenimi celicami MG-63, ki imajo ohranjeno sposobnost izdelave omenjenega proteina. Pri ocenjevanju stopnje razvitosti osteoblastov smo si pomagali z več različnimi metodami. Stopnjo razvoja smo ocenjevali na podlagi izražanja kazalnih genov, značilnih za diferenciacijo osteoblastov, pri čemer smo uporabili metodo kvantitative verižne reakcije s polimerazo (RT-qPCR). Določili smo izražanje gena za z RUNT povezanim transkripcijskim dejavnikom 2 (RUNX2; angl. Runt-Related Transcription Factor 2), gena za alkalno fosfatazo (ALP; angl. Alkaline Phosphatase), gena za kolagen tipa I alfa 1 verige (COL1A1; angl. Collagen Type I Alpha 1 Chain ) in gena za kostni gama karboksglutamat protein oziroma osteokalcin (BGLAP oz. OC; angl. Bone Gamma-Carboxyglutamate Protein). Izražanje posameznih kazalcev smo nato normalizirali glede na izražanje referenčnega gena za TATA-vezavni protein (TBP, angl. TATA-Box Binding Protein). Določili smo tudi kako se s potekom razvoja osteoblastov spreminja aktivnost encima ALP v celicah in celokupno koncentracijo proteinov v celičnih lizatih v različnih časovnih točkah razvoja. Rezultati so pokazali, da je bilo izražanje genov RUNX2 in COL1A1 značilno višje v MMP7 KO in izražanje gena ALP značilno nižje kot v kontrolnih celicah MG-63. Izražanje gena OC se je bilo obeh celičnih kulturah podobno. Prav tako smo opazili manjšo aktivnost ALP pri celicah z izbitim genom za protein MPP7. Med celičnima linijama ni bilo opaznih razlik v celokupni količini proteinov. Glede na pridobljene rezultate lahko sklepamo, da ima protein MPP7 vpliv na razvoj osteoblastov, saj je v celicah osteosarkoma MG-63 MPP7 KO prišlo do počasnejše diferenciacije celic, kot pri celicah, ki so izražale gen MPP7 (KC). Da bi ugotovili natančen mehanizem, preko katerega je protein MPP7 vpleten v celično diferenciacijo, bo potrebno izvesti dodatne raziskave funkcijske genomike.Type of material - master's thesis ; adult, seriousPublication and manufacture - Ljubljana : [B. Dragar], 2021Language - slovenianCOBISS.SI-ID - 75296771
Author
Dragar, Brina
Other authors
Marc, Janja |
Lojk, Jasna
Topics
Genomika |
Osteartroza |
osteoporoza |
osteoblasti |
diferenciacija |
membranski palmitoirani protein 7 (MPP7) |
alkalna fosfataza (ALP) |
gensko izražanje
![loading ... loading ...](themes/default/img/ajax-loading.gif)
Call number – location, accession no. ... |
Copy status | Reservation |
---|---|---|
Knjižnica mlab 575.111 DRAGAR BRINA Vloga 0000000270 IN: 0017028 Knjižnica mlab 575.111 DRAGAR BRINA Vloga 270 IN: 0017028 |
available - reading room
|
![loading ... loading ...](themes/default/img/ajax-loading.gif)
![loading ... loading ...](themes/default/img/ajax-loading.gif)
![loading ... loading ...](themes/default/img/ajax-loading.gif)
Shelf entry
Permalink
- URL:
Impact factor
Access to the JCR database is permitted only to users from Slovenia. Your current IP address is not on the list of IP addresses with access permission, and authentication with the relevant AAI accout is required.
Year | Impact factor | Edition | Category | Classification | ||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
JCR | SNIP | JCR | SNIP | JCR | SNIP | JCR | SNIP |
Select the library membership card:
If the library membership card is not in the list,
add a new one.
DRS, in which the journal is indexed
Database name | Field | Year |
---|
Links to authors' personal bibliographies | Links to information on researchers in the SICRIS system |
---|---|
Dragar, Brina | ![]() |
Marc, Janja | 12189 |
Lojk, Jasna | 34385 |
Source: Personal bibliographies
and: SICRIS
Select pickup location:
Material pickup by post
Delivery address:
Address is missing from the member's data.
The address retrieval service is currently unavailable, please try again.
By clicking the "OK" button, you will confirm the pickup location selected above and complete the reservation process.
By clicking the "OK" button, you will confirm the above pickup location and delivery address, and complete the reservation process.
By clicking the "OK" button, you will confirm the address selected above and complete the reservation process.
Notification
Automatic login and reservation service currently not available. You can reserve the material on the Biblos portal or try again here later.
Subject headings in COBISS General List of Subject Headings
Select pickup location
The material from the parent unit is free. If the material is delivered to the pickup location from another unit, the library may charge you for this service.
Pickup location | Material status | Reservation |
---|
Reservation in progress
Please wait a moment.
Reservation was successful.
Reservation failed.
Reservation...
Membership card:
Pickup location: