Produksi tomat dapat ditingkatkan melalui teknik pemuliaan tanaman dengan merancang vaeritas tomat adaptif pada dataran rendah dan melakukan seleksi pada genotipe-genotipe unggul menggunakan ...parameter genetik heritabilitas. Penelitian bertujuan mengevaluasi produksi dan heritabilitas karakter komponen hasil pada beberapa genotipe tomat. Kebun Percobaan Fakultas Pertanian Universitas Riau menjadi lokasi percobaan ini mulai September 2022 hingga Februari 2023. Rancangan acak kelompok (RAK) adalah metodologi penelitian yang digunakan. Sebanyak 30 unit percobaan diperoleh dengan mengulang setiap genotipe hingga tiga ulangan. Berdasarkan penelitian, diperoleh hasil bahwa genotipe F7 003008-1-12-10-10-6(1) (SG3), F7 078097D-9-7-2-21-13(1) (SG5), dan F7 097D078-2-2-2-10(19R)-4(3) (SG6) merupakan genotipe-genotipe yang memiliki berat buah per tanaman dan jumlah buah lebih baik dari varietas Ratna dan Intan. Karakter waktu panen pertama, diameter buah, panjang buah, berat buah, jumlah buah, dan berat buah per tanaman adalah karakter dengan heritabilitas tinggi, sedangkan karakter umur muncul bunga adalah karakter dengan heritabilitas sedang.
Penyakit busuk bulir padi oleh bakteri Burkholderia glumae perlu diwaspadai termasuk di Jawa Barat sebagai salah satu sentra produksi padi nasional. Penelitian ini bertujuan untuk menentukan ...insidensi penyakit, identitas dan keragaman bakteri B. glumae pada beberapa varietas padi di Provinsi Jawa Barat. Pengamatan insidensi penyakit dan pengambilan sampel dilakukan di 9 kabupaten. Bakteri diisolasi dari bulir padi yang bergejala busuk bulir kemudian dilakukan uji biokimia dan fisiologi yang meliputi uji Gram serta uji pertumbuhan pada pH 4.8, dan NaCl 2%. Variasi fenotipik diamati dari warna koloni pada medium S-PG, produksi toksofalvin, respons hipersensitivitas pada daun tembakau, dan uji patogenisitas pada tanaman padi. Primer spesifik JLBgF/JLBgR dan primer universal 16S rRNA, yaitu 27F/1492R digunakan untuk menentukan identitas bakteri secara molekuler. Insidensi penyakit di lapangan berkisar antara 0–73.3%, tertinggi di Kecamatan Dawuan (Karawang) pada var. Mekongga. Berdasarkan uji biokimia dan fisiologi diperoleh 29 isolat terkonfirmasi sebagai B. glumae. Hasil pengamatan fenotipik menunjukkan 10 isolat tergolong koloni tipe A, 19 isolat tipe B; 25 isolat menghasilkan toksoflavin; 29 isolat menimbulkan respons hipersensitivitas pada daun tembakau dan gejala hawar pada tanaman padi. Identifikasi menggunakan primer spesifik dan universal membuktikan 29 isolat adalah B. glumae. Analisis keragaman genotip menunjukkan bahwa isolat KRCH-2 (Karawang) dan INCH-6 (Indramayu) memiliki hubungan kekerabatan yang dekat dengan B. glumae asal Cina dan Amerika
MOTIVATION: Psychiatric disorders have a great impact on morbidity and mortality. Genotype-phenotype resources for psychiatric diseases are key to enable the translation of research findings to a ...better care of patients. PsyGeNET is a knowledge resource on psychiatric diseases and their genes, developed by text mining and curated by domain experts. RESULTS: We present psygenet2r, an R package that contains a variety of functions for leveraging PsyGeNET database and facilitating its analysis and interpretation. The package offers different types of queries to the database along with variety of analysis and visualization tools, including the study of the anatomical structures in which the genes are expressed and gaining insight of gene's molecular function. Psygenet2r is especially suited for network medicine analysis of psychiatric disorders. AVAILABILITY AND IMPLEMENTATION: The package is implemented in R and is available under MIT license from Bioconductor (http://bioconductor.org/packages/release/bioc/html/psygenet2r.html).
This work was supported by ISCIII-FEDER PI13/00082, CP10/00524, CPII16/00026, MICINN MTM2015-68140-R, IMI-JU under grants agreements no. 115191 (Open PHACTS), no. 115372 (EMIF), no. 115735 (iPiE), resources of which are composed of financial contribution from the EU-FP7 FP7/2007–2013 and EFPIA companies in kind contribution, and the EU H2020 Programme 2014–2020 under grant agreements no. 634143 (MedBioinformatics) and no. 676559 (Elixir-Excelerate). The Research Programme on Biomedical Informatics (GRIB) is a member of ELIXIR-ES and the Spanish National Bioinformatics Institute (INB), PRB2-ISCIII and is supported by grant PT13/0001/0023, of the PE I + D+i 2013-2016, funded by ISCIII and FEDER. A.G.S. acknowledges financial support from the Spanish Ministry of Economy and Competitiveness, through the ‘María de Maeztu’ Programme for Units of Excellence in R&D MDM-2014-0370.
Rotavirusi su jedni od najvažnijih uzročnika akutnog gastroenteritisa kod ljudi i životinja, a između devet prepoznatih vrsta rotavirusA se posebno ističe zbog velike proširenosti i patogenosti. I ...danas, uz visoki pobol i hospitalizaciju oboljele djece u zemljama s visokimhigijenskim standardom, u zemljama u razvoju uzrokuju značajnu smrtnost. Takav je učinak posebno vidljiv kada dostupna cjepivanisu dio nacionalnog imunizacijskog programa. Zbog prirode svoga genoma rotavirusi izrazito brzo evoluiraju, prvenstveno zahvaljujućiučestaloj pojavi točkastih mutacija i genomskog preslagivanja. Stoga nije iznenađujuća visoka genetska heterogenost, patako danas poznajemo ukupno 36 genotipova G i 51 genotip P rotavirusa A. Kada izravno prijeđu vrsnu barijeru, rotavirusi uglavnomnisu sposobni učinkovito inficirati ili se širiti u novom domaćinu. No baš pojava genomskog preslagivanja omogućuje nastanaknovih, potencijalno emergentnih humano-animalnih reasortanata. Stoga je potreban stalni nadzor životinjskih sojeva rotavirusakako bi se dobila točna slika o životinjskim rezervoarima koji u budućnosti mogu biti odgovorni za unos novih rotavirusa uljudsku populaciju ili rotavirusnih gena u genetsku osnovu humanih sojeva. Sustavno praćenje molekularnih značajki rotavirusa kojicirkuliraju u određenom području od posebne je važnosti prije uvođenja nacionalnog imunizacijskog programa, ali i dok je aktivnaimunizacija u tijeku. Opsežnije istraživanje rotavirusa A u ekosustavu Republike Hrvatske je u tijeku, a omogućit će otkrivanje životinjskihrezervoara te pridonijeti boljem razumijevanju zoonotskog potencijala ovih virusa.
Karnozin (β-alanil-L-histidin) i anserin (β-alanil-1-metil-L-histidin) su dipeptidi koji imaju značajnu ulogu u fiziološkim funkcijama kod ljudi. Prisutni su u skeletnim mišićima i moždanom tkivu ...mnogih kralježnjaka. Dizajniranjem krmnih smjesa s povećanim sadržajem aminokiselina L-histidina i β-alanina njihova se koncentracija u mesu tovnih pilića može povećati. Cilj ovog rada bio je ispitati utjecaj genotipa brojlera i vrste mišićnog tkiva na boju mesa i sadržaj karnozina i anserina. Istraživanje je obavljeno na pilićima genotipova Cobb 500 i Ross 308. Ukupno je utovljeno 400 pilića, podijeljenih u dvije pokusne skupine (200 komada Cobb 500 i 200 komada Ross 308). Tov je trajao 42 dana. U tovu su korištene tri komercijalne krmne smjese, starter (21,02 % proteina, do 21. dana), grover (19 % proteina, od 22.-35. dana) i finišer (18,05 % proteina od 36. do 42. dana tova). Nakon klanja i obrade trupova izmjerena je boja mesa prsa i zabataka (CIE L *, CIE a *, CIE b *). Rezultati istraživanja pokazali su da vrsta mišićnog tkiva ima statistički značajan utjecaj na boju mesa (P<0,05), dok genotip ima utjecaja samo na CIE b* vrijednost (P<0,001). Rezultati analize sadržaja karnozina i anserina u uzorcima mesa prsa i zabataka pokazuju da genotip nema utjecaj na sadržaj navedenih dipeptida u mesu (P>0,05), dok vrsta mišićnog tkiva ima značajan utjecaj (P<0,001) na njihovo deponiranje. Ustanovljen je značajno veći sadržaj karnozina (P<0,05) i anserina (P<0,001) u mesu prsa u odnosu na meso zabataka kod oba genotipa pilića.
Carnosine (β-alanyl-L-histidine) and anserine (β-alanyl-1-methyl-L-histidine) are dipeptides that play a significant role in physiological functions in humans. They are present in the skeletal muscles and brain tissue of many vertebrates. By designing feed mixtures with an increased content L-histidine the amino acids and β-alanine, their concentration in the meat of broilers can be increased. The aim of this study was to examine the influence of broiler genotype and type of muscle tissue on meat color and carnosine and anserine content. The research was conducted on chickens of the Cobb 500 and Ross 308 genotypes. A total of 400 chickens were fattened, divided into two experimental groups (200 pieces of Cobb 500 and 200 pieces of Ross 308). The fattening lasted 42 days. Three commercial fodder mixtures were used for fattening, starter (21.02% protein, until day 21), grover (19% protein, from days 22-35) and finisher (18.05% protein, from days 36 to 42 days of fattening). After slaughtering and processing the carcasses, the color of the breast and thigh meat was measured (CIE L*, CIE a*, CIE b*). The research results show that the type of muscle tissue has a statistically significant influence on the meat color (P<0.05), while the genotype has an influence only on the CIE b* value (P<0.001). The results of the analysis of the content of carnosine and anserine in the samples of breast and thigh meat indicate that the genotype has no influence on the mentioned dipeptides content in the meat (P>0.05), while the type of muscle tissue has a significant influence (P<0.001) on their deposition. A significantly higher carnosine (P<0.05) and anserine (P<0.001) content was found in breast meat compared to thigh meat in both genotypes of chickens.
Tujuan dari penelitian untuk mengetahui genotipe tanaman yang terseleksi dan nilai kemajuan heterosis genetik dari hasil persilangan tetua pada genotipe generasi F3. Penelitian ini dilakukan di ...lapangan Balitkabi Malang. Penelitian ini menggunakan lengkap random Rancangan dengan 16 genotipe, terdiri dari 4 orang tua (1) Dering, (2) Rajabasa, (3) Polije 2, (4) Polije 4 dan 12 genotipe berbakti 1.2; 1.3; 1.4; 2.1; 2.3; 2.4; 3.1; 3.2; 3.4; 4.1; 4.2 dan 4.3. Parameter terdiri dari umur bunga, usia panen, bobot 100 butir kedelai, berat biji masing-masing tanaman, dan produksi per Ha. Hasil penelitian ini menunjukkan bahwa peningkatan hasil genetik tanaman yang lebih tinggi termasuk kategori tinggi dari hasil seleksi respon dari parameter tinggi tanaman, cabang tanaman, dan jumlah bibit. Dari hasil seleksi ini metode silsilah menunjukkan genotipe 2.4 dan 4.2 memiliki karakter panen cepat dan produksi yang tinggi. Hasil genotipe yang telah pilihan menunjukkan lebih baik dari tetua yang digunakan hasil heterosis.
Recitind Parabolele din Noul Testament, autorii prezentului studiu găsesc elemente pe baza cărora se poate clădi interpretarea acestor istorii în lumina evoluționismului—un concept de o profunzime ...considerabilă. Dacă sînt percepute ca un întreg și dacă lăsăm la o parte orice reflecție mistică asupra lor, parabolele afirmă existența unui sistem care generează și guvernează toate principiile și entitățile, care, în consecință, îi împărtășesc natura, adică ordinea, echilibrul și vitalitatea.Entitățile dețin forța vitală generată de un dat genetic entelehic, fundamental pozitiv, însă care se poate menține, dezvolta și evolua ca atare numai ca urmare a devenirii epigenetice, în acea direcție.În mod firesc pentru el însă, omul religios subordonează spiritului și împlinirii voinței lui Dumnezeu datul genetic, dobînditul epigenetic, precum și instrumentele de natură comportamentală și ideologică.
The genetic and amelioration researches found that the morphobiological, phytotechical features of cowpea correspond to the pedoclimatic requirements of Moldova and this culture can be introduced ...with efficiency in agriculture. For the diversification of valuable crops, their use in food and canning industry, we propose the cultivation of Dina and Ina introductions varieties developed within the Institute of Genetics, Physiology and Protection of Plants. Successful of amelioration of the cowpea requires the use of high heritability characters: the growing season, the plant’s size, the number of branches per plant, the length of the pods and hundred seed weight.
Cilj: Cilj ovog rada je molekularna analiza radi utvrđivanja genotipova toksigenih sojeva C. difficile.
Ispitanici i metode: Istraživanje je provedeno na uzorcima stolice bolničkih pacijenata ...Sveučilišne kliničke bolnice Mostar. U stolicama je ELFA tehnikom (engl. Enzyme Linked Fluorescent Assay), dokazana produkcija A i B toksina. Izolirana C. difficile je umnožena PCR reakcijom (engl. polymerase chain reaction), a hibridizacijskom metodom detektirani su: C. difficile specifični gen (tpi), geni za produkciju A i B (tcdA, tcdB) te binarnog toksina (cdtA i cdtB), delecija u tcdC genu na pozicijama 18 bp, 39 bp i 117 bp te dvije različite mutacije u gyrA genu.
Rezultati: U svih ispitivanih sojeva C. difficile prisutni su geni za toksin A i B (tcdA/tcdB). Zastupljenosti mutacije gena za rezistenciju na moksifloksacin (gyrA) u ispitivanih sojeva C. difficile dokazana je u 96.66 % sojeva C. difficile. U istih je sojeva dokazana i produkcija binarnog toksina, čime je potvrđeno da ti sojevi pripadaju hipervirulentnom ribotipu 027.
Zaključci: U Sveučilišnoj bolnici Mostar, među toksigenim sojevima C. difficile, dominantan je moksifloksacin rezistentni, hipervirulentni ribotip 027.
Objectives: Familial Mediterranean Fever (FMF) is a self-limiting autoinflammatory disease. In order to better understand the prognosis of diseases, disease severity scores are used. The aim of this ...study is to determine the effect of genetic mutations on disease severity scores in children with FMF.
Methods: 303 patients between the ages of 0-18, who were diagnosed with FMF according to Yalçınkaya-Özen diagnostic criteria and whose gene analysis was studied, were evaluated retrospectively. Pras et al's scoring system, Mor et al's scoring system and International severity score of FMF (ISSF) scoring system were applied to all patients. Genotypes were compared according to disease severity scores.
Results: When the patients were divided into 4 groups as M694V homozygous, heterozygous, M694V/other allele combined heterozygous and other mutations, according to the score of Pras et al., the frequency of mild disease tended to be less in the M694V homozygous group. When the patients divided as homozygous M694V, heterozygous M694V, heterozygous E148Q, heterozygous M694V/M680I combined mutations, according to the score of Pras et al., mild disease was found to be less common in the homozygous M694V group. When patients were divided into homozygous and heterozygous M694V groups, the disease was more severe in the homozygous M694V group according to the three scoring systems.
Conclusions: Based on the scoring system described by Pras et al., the rate of severe disease was higher in patients with homozygous M694V allele, whereas the rate of mild disease was statistically significantly higher in the heterozygous group compared with homozygous group.
Amaç: Ailevi Akdeniz Ateşi (AAA) kendi kendini sınırlayan otoinflamatuar bir hastalıktır. Hastalıkların prognozunu daha iyi anlamak için çeşitli klinik kriterlerin bir kombinasyonuna göre puanlanan hastalık şiddeti skorları kullanılır. Bu çalışmanın amacı, AAA’lı çocuklarda genetik mutasyonların hastalık şiddeti skorlarına etkisini belirlemektir.
Gereç ve Yöntemler: Yalçınkaya-Özen tanı kriterlerine göre FMF tanısı konan ve gen analizi yapılan 0-18 yaş arası 303 hasta retrospektif olarak değerlendirildi. Tüm hastalara Pras ve arkadaşlarının skorlama sistemi, Mor ve arkadaşlarının skorlama sistemi ve Uluslararası FMF şiddet skoru (ISSF) skorlama sistemi uygulandı. Genotipler hastalık şiddeti skorlarına göre karşılaştırıldı.
Bulgular: Hastalar Pras ve ark. skoruna göre M694V homozigot, heterozigot, M694V/diğer allel kombine heterozigot ve diğer mutasyonlar olarak 4 gruba ayrıldığında M694V homozigot grubunda hafif hastalık sıklığı daha az olma eğilimindeydi. Pras ve ark.'nın skoruna göre hastalar homozigot M694V, heterozigot M694V, heterozigot E148Q ve heterozigot M694V/M680I kombine mutasyonlar olarak ayrıldığında, homozigot M694V grubunda hafif hastalık daha az yaygın olarak bulundu. Hastalar homozigot M694V grubu ve heterozigot M694V grubu olarak ikiye ayrıldığında, üç skorlama sistemine göre homozigot M694V grubunda hastalık daha şiddetliydi.
Sonuçlar: Pras ve ark. tarafından tanımlanan skorlama sistemine göre, homozigot M694V alleli olan hastalarda şiddetli hastalık oranı, homozigot grupla karşılaştırıldığında heterozigot grupta istatistiksel olarak anlamlı derecede daha yüksekti.
PDF
