Polymorphism of MUC1 gene in sheep [Mucin 1] Sartore, S. (Turin Univ. (Italy). Dipartimento di Produzioni Animali, Epidemiologia ed Ecologia); Sacchi, P. (Turin Univ. (Italy). Dipartimento di Produzioni Animali, Epidemiologia ed Ecologia); Maione, S. (Turin Univ. (Italy). Dipartimento di Produzioni Animali, Epidemiologia ed Ecologia) ...
Italian journal of animal science,
(2005), Volume:
4
Journal Article
Peer reviewed
MUC1 gene encodes a mucin of membrane of milk fat globules and contains a hyper-variable repeated region. The MUC1 sequence is well known in cattle and goats, not in sheep. A preliminary analysis of ...repetitive region, carried out by PCR on 23 animals of Tacola breed using a couple of oligonucleotides designed on goat sequence, showed the length polymorphism known for MUC1 of humans, cattle and goats. The analysis of sequence of a fragment showed that the repetitive region of MUC1 gene in sheep is an array of 60 bp units tandemly repeated, as in the other species. The obtained results represent the first contribution to the knowledge of the structure of sheep MUC1 gene and allow to investigate its polymorphism in sheep breeds.
Il gene MUC1 esprime una mucina della membrana dei globuli di grasso del latte e contiene una regione ripetitiva ipervariabile. La sequenza di MUC1 è nota nel bovino e nella capra, ma non nella pecora. Un´analisi preliminare della regione ripetitiva, eseguita mediante PCR su 23 soggetti di razza Tacola utilizzando una coppia di oligonucleotidi disegnati sulla sequenza di capra, ha evidenziato il polimorfismo di lunghezza già noto per MUC1 di uomo, bovino e capra. L´analisi della sequenza di un frammento ha dimostrato l´esistenza di una regione ripetitiva formata da un´unità di 60 bp ripetuta in successione, caratteristica in comune con il gene MUC1 delle altre specie. I risultati ottenuti sono il primo contributo alla conoscenza di MUC1 di pecora e consentono di avviare indagini sul suo polimorfismo nelle razze ovine
Do sada su svojstva meda bila definirana isključivo na temelju sadržaja komponenti nektara određene biljke. Mi smo pokazali da je apalbumin1, glavni protein matične mliječi, izvoran i uobičajeni ...sastojak meda. Apalbumin1, ostali proteini matične mliječi i peptidi odgovorni su za imunostimulatorna svojstva i antibiotsko djelovanje meda. Korištenjem poliklonalnog anti-apalbumin 1 protutijela osmišljen je imunoenzimski test (ELISA) za kvantifikaciju apalbumina 1. Metoda je ne samo prikladna za utvrđivanje izvornosti meda nego i korisna za detekciju meda, peluda i matične mliječi u medicinskim, farmaceutskim, kozmetičkim i prehrambenim proizvodima na kojima je naznačena prisutnost pčelinjih proizvoda. Rezultati analize prisutnosti i količine apalbumina 1 koristit će se za probir velike količine uzoraka meda diljem svijeta. Na temelju naših eksperimenata, koji pokazuju da su proteini matične mliječi uobičajene i fiziološki aktivne komponente meda, predlažemo izmjenu definicije meda (na temelju Direktive EU-a o medu 2001/110/EC): Med je prirodna slatka tvar koju pčele proizvode od nektara ili izlučevina biljaka ili izlučevina insekata koji sišu biljke. Nju pčele skupljaju, pretvaraju kombinacijom glavnih proteina matične mliječi i ostalih vlastitih specifičnih tvari, polažu, dehidriraju, pohranjuju i ostavljaju u saću da sazrije.
Effect of syringopeptin on stomata hole Di Giorgio, D; Camoni, L; Ballio, A. (Universita La Sapienza, Rome (Italy). Dipartimento di Scienze Biochimiche)
Petria (Italy),
(Sep 1992), Volume:
2, Issue:
3
Journal Article
Hipoalergeni antibakterijski peptidi male molekularne mase proizvedeni su iz nemasne sojine sačme u membranskom bioreaktoru. U prvom su koraku proteini sojine sačme razgrađeni pomoću tripsina u ...šaržnom bioreaktoru. Optimalni uvjeti za razgradnju tripsinom bili su: koncentracija sojine sačme od 75 g/L, temperatura od 40 °C i pH=9. Nakon toga su peptidi male molekularne mase pročišćeni pomoću „cross-flow“ membrane (veličina pora 100 μm), a zatim pomoću keramičke cjevaste membrane (veličine pora koja ne propušta molekule veće od 5 kDa). Ispitan je utjecaj transmembranskog pritiska i primjene statičkih promotera turbulencije na smanjenje koncentracijske polarizacije blizu površine ultrafiltracijske membrane, te je potvrđen njihov pozitivan učinak. Transmembranski pritisak od 3•105 Pa i diskontinuirana dijafiltracija provedena u tri koraka bili su optimalni za filtraciju pomoću ultrafiltracijske membrane. Distribucija molekularne mase peptida pročišćenih pomoću ultrafiltracijske membrane utvrđena je pomoću metode LC-ESI-Q-TOF-MS. Više od 96 % peptida (izraženih kao relativna frekvencija) iz permeata ultrafiltracijske membrane imalo je molekularnu masu manju od 1,7 kDa, a najveća je molekularna masa bila 3,1 kDa. Smanjenje alergenih svojstava proteina za više od 99,9 % nakon obrade tripsinom i membranske filtracije utvrđeno je imunoenzimskim testom. Također je zaključeno da peptidi pročišćeni pomoću ultrafiltracijske membrane pozitivno djeluju na rast bakterije Pediococcus acidilactici HA6111-2, te sprečavaju rast bakterije Bacillus cereus.
Služeći se teorijom molekularnih grafova istraživali smo vezivanje NSFRY-NH2 i 12 srodnih pentapetidnih amida za Cu(II) kao modelnog sustava za interakciju bakra s peptidnom molekulom atrijalnog ...natriuretičkog faktora (ANF). Modeli linarne regresije temeljeni na valencijskom indeksu povezanosti trećega reda (3χv) reproducirali su eksperimentalnu konstantu stabilnosti (log β) za komplekse koordinacije 1N, 2N, 3N i 4N sa standardnom pogreškom u rasponu od 0,30 do 0,39 log β jedinica. Razvili smo odvojene modele za sedam tirozinskih (N=28) i pet netirozinskih (N=20) peptida te skupni model s indikatorskom varijablom za obje vrste peptida (N=48). Rezultati upućuju na dodatnu aromatsku stabilizaciju u kompleksima vrste 4N zbog interakcija kationa s π-orbitalama tirozinskog ostatka, ali ne i fenilalaninskoga. Ispravili smo i pogrešne vrijednosti log K i log K* nastale omaškom u radu Anne Janicka-Klos i sur. 2013.
Iako su mehanizmi preddisocijacije, disocijacije i postdisocijacije iona izučavani dugi niz godina, postoji još cijeli niz mehanizama raspada iona koji se mogu korisno upotrijebiti u modernoj ...spektrometriji masa, proteomici i bioanalizama. Nedvojbena aminokiselinska analiza spektrometrijom masa počiva na ideji da samo jedan i kontinuirani slijed iona u tandemnom spektru masa može potpuno potvrditi cjelovitu aminokiselinsku sekvenciju i na taj način zadovoljiti zahtjeve nedvojbene analize peptida. Niz pravila kojima se definira cjelovita i nedvojbena analiza peptida tandemnom spektrometrijom masa u konačnici može unaprijediti iščitavanje rezultata analize i pouzdanost dobivenih podataka. Na teorijskim zasadama disocijacije iona u plinskoj fazi u ovom je radu prikazana cjelovita analiza peptida. Na modelnim farmaceutskim peptidima bivalirudinu i eksenatidu pokazano je kako se i bez raširene upotrebe derivatizacijskih tehnika (SPITC i Lys-tag) može ostvariti nedvojbena analiza, iako se modifikacije cisteina akrilacijom, metilacijom ili karboksimetilacijom pri tome ne mogu izbjeći.
Bioinformatičke metode postale su jedan od najvažnijih alata u području istraživanja peptida. Sve je veći broj dostupnih baza podataka o peptidima, a i „online” programa koji obradom aminokiselinskih ...sljedova daju informacije o strukturi peptida te njihovim fizikalno-kemijskim i biološkim svojstvima. Mnogi od tih programa dizajnirani su za obradu aminokiselinskih sljedova proteina, ali nemaju ugrađenu restrikciju njihove primjene na oligopeptide koji sadrže manje od 20 aminokiselinskih ostataka. Radovi o takvim programima ne mogu se pronaći u bazama publikacija uporabom ključnih riječi „peptid” ili „peptidi”, u kombinaciji s pojmom „bioinformatika” ili sličnim terminima. Stoga je važno sažeti rezultate objavljenih radova u jednom izvoru. U ovom je radu dan kratak pregled baza podataka o bioaktivnim peptidima i programima za analizu aminokiselinskoga slijeda koji omogućuju: pronalazak peptidnih motiva; određivanje fizikalno-kemijskih svojstava aminokiselinskih ostataka; predviđanje strukture peptida, pojave posttranslacijske glikozilacije i imunogenosti; te programsku podršku za dizajn peptida. Također su prikazani programi i baze podataka o proteolitičkim enzimima. Svi navedeni programi i baze razvijeni su i ažurirani od rujna 2007. do prosinca 2008.
Cilj ove studije bio je ocijeniti ulogu osteoprotegerina (OPG) kao biljega u bolesnika sa stenozom aortnog srčanog za-liska u odnosu na prisutne simptome kao i stupanj srčanog zatajenja. U studiju je ...bio uključen 51 bolesnik s aortnom steno-zom (AS) i 39 kontrolnih ispitanika. Prije uključenja u studiju uzeta je detaljna anamneza, učinjen je fizikalni pregled, ren-tgenska snimka srca i pluća te ehokardiografija. OPG je određen u svih ispitanika, a N-terminalni nastavak pro b-tipa natriu-retskog peptida (NT pro BNP) bio je određen u bolesnika s AS. OPG je bio povišen u bolesnika s AS u odnosu na kontrolne ispitanike (p=0,001). Bolesnici sa srčanim zatajenjem zbog AS imali su povišene razine OPG-a u odnosu na bolesnike bez srčanog zatajenja (p=0,001). Značajna korelacija između OPG-a i simptomatskog statusa bila je zapažena u svih bolesnika s AS (p<0,001), ali to nije bio slučaj u bolesnika bez srčanog zatajenja (p=0.425). Zabilježena je i pozitivna korelacija između koncentracije OPG-a i NT pro BNP-a s objektivnim znakovima srčanog zatajenja na rentgenskoj snimci srca i pluća (p<0,001). Također je opažena negativna korelacija OPG-a i areje aortnog zaliska (p<0,040) te istisne frakcije lijeve klijetke (p<0,001). OPG bi mogao predstavljati vrijedan biljeg u procjeni težine kalcificirane AS te bi mogao poslužiti kao dodatni indikator prilikom odlučivanja o kirurškom liječenju ili zamjeni aortnog zaliska, naravno, uz kliničku prezentaciju i ehokardiografiju.
Analiza peptida iz hrane Minkiewicz, Piotr; Dziuba, Jerzy; Darewicz, Małgorzata ...
Food technology and biotechnology,
03/2008, Volume:
46, Issue:
1
Journal Article
Peer reviewed
Open access
Ovaj revijalni prikaz razmatra definiciju pojma „food peptidomics“, tj. istraživanje peptida iz hrane i njihovu ulogu u prehrambenoj tehnologiji i nutricionizmu. Slično živim organizmima, „peptidome“ ...hrane obuhvaća sve peptide u prehrambenom proizvodu ili sirovini, a i one proizvedene tijekom prerade i/ili njihova skladištenja. Ova grana znanosti obuhvaća istraživanje podrijetla peptida, dinamičnosti njihove promjene pri preradi i/ili skladištenju, utjecaja peptida, njihova sastava i promjene sastava na svojstva prehrambenih proizvoda i sirovina, te metode istraživanja. To uključuje ispitivanje njihove biološke aktivnosti, funkcionalnih, alergenskih i senzorskih svojstava, informacije o autentičnosti i porijeklu proizvoda ili izvora, te povijesni razvoj i odnose. U radu su opisane metode istraživanja peptida, s posebnim naglaskom na računske metode.
PDF
