Genetske spremembe, povezane z orofacialnimi shizami v slovenski populaciji = Genetic variants associated with orofacial clefts in the Slovenian population : doktorska disertacija
Slavec Janev, Lara, farmacevtka
Orofacialne shize (OFS) oziroma razcepe ustnice, čeljustnega grebena in/ali neba štejemo med najpogostejše prirojene razvojne nepravilnosti. Delimo jih na nesindromske OFS, katerih etiologija je po ...navadi večfaktorska, in sindromske OFS, ki imajo pogosto znan monogenski vzrok nastanka. Namen doktorskega dela je bil identificirati genetske dejavnike tveganja za nastanek OFS v slovenski populaciji in odkriti optimalne laboratorijske diagnostične pristope za njihovo detekcijo. Najprej smo naredili sistematični pregled literature in metaanalizo, da bi identificirali gene, ki so povezani z nesindromskimi OFS, v kavkazijskih populacijah evropskega izvora. Vključili smo 84 populacijskih študij primerov in kontrol na kandidatnih genih, ki so proučevale več kot 700 genetskih sprememb, porazdeljenih po celotnem genomu. Na podlagi pridobljenih informacij smo izbrali 74 kandidatnih genov za proučevanje etiologije OFS v slovenski populaciji. V nadaljevanju smo izvedli študijo družin. Vključili smo 34 družin z dvema ali več člani z domnevno nesindromskimi OFS. Najprej smo s sekvenciranjem po Sangerju ali sekvenciranjem celotnega eksoma analizirali IRF6, GRHL3 in TBX22, da bi identificirali družine s sindromom Van der Woude (VWS1/VWS2) in X-vezanim razcepom neba z/brez ankiloglosije (CPX). Te sindrome je včasih namreč težko ločiti od nesindromskih OFS. V petih družinah smo odkrili štiri različne vzročne spremembe v IRF6 (NM_006147.4:c.134G>A; c.622C>T; c.687delG; c.1234C>T) (VWS1), v eni družini verjetno vzročno spremembo v GRHL3 (NM_198173.3:c.1285G>T) (VWS2) in v eni družini delecijo vseh kodirajočih eksonov TBX22 (CPX). Tri od omenjenih genetskih sprememb smo odkrili prvi. Nato smo v preostalih družinah pregledali še kandidatne gene, povezane z nesindromskimi OFS, ki smo jih izbrali s sistematičnim pregledom literature. V teh družinah smo odkrili še pet genetskih sprememb, toda njihove povezave z OFS nismo mogli zanesljivo opredeliti na podlagi razpoložljivih informacij. Naš pristop sekvenciranja je tako uporaben za razlikovanje med sindromskimi in nesindromskimi OFS. Nasprotno, s tem pristopom v slovenski populaciji nismo uspeli odkriti genetskega vzroka nastanka nesindromskih OFS.
Type of material - dissertation
; adult, serious
Publication and manufacture - Ljubljana : [L. Slavec Janev], 2023
Knjižnica dr 616 SLAVEC LARA Genetske 371 IN: 0017835
available - reading room
Shelf entry
Adding material to shelf was successful.
Adding material to shelf failed.
It was not necessary to add the material to the shelf.
Bibliographic material was successfully added on shelf.
Adding bibliographical material on shelf was not successful.
Material is already on the shelf.
Permalink
URL:
Impact factor
Access to the JCR database is permitted only to users from Slovenia. Your current IP address is not on the list of IP addresses with access permission, and authentication with the relevant AAI accout is required.
Year
Impact factor
Edition
Category
Classification
JCR
SNIP
JCR
SNIP
JCR
SNIP
JCR
SNIP
Select the library membership card:
DRS,
in which the journal is indexed
Database name
Field
Year
Links to authors' personal bibliographies
Links to information on researchers in the SICRIS system
Subject headings in COBISS General List of Subject Headings
Select pickup location
The material from the parent unit is free. If the material is delivered to the pickup location from another unit, the library may charge you for this service.
