Molekulsko biološka označitev in prepoznavanje bakterij rodu Salmonella v vzorcih živil : doktorska disertacija = Molecular biological characterization and detection of the genus Salmonella in food samples : dissertation thesis
Trkov, Marija
Odkrivanje bakterij vrste Salmonella enterica je temeljilo na pomnoževanju dela gena za 16S rRNK. Razvita sta bila začetna oligonukleotida MINF in MINR. Specifičnost metode je bila preskušena na 91 ...sevih rodu Salmonella in 32 salmonelam sorodnih sevih iz družine Enterobacteriaceae. Razvita metoda omogoča prepoznavanje vrste S. enterica, ne pa tudi vrste S. bongori. Za iskanje vrstno ali rodovno specifičnih regij, primernih za začetne oligonukleotide ali pa oligonukleotidne sonde je bila uporabljena tudi metoda diferencialnega prikaza genoma. Po reverzni transkripciji in verižni reakciji s polimerazo je bil iz agaroznega gela izoliran pomnožek, skupen vsem salmonelam. Primerjava sekvence omenjenega pomnožka je pokazala, da gre za del gena za 16S rRNK, ki se ga pomnoži tudi z razvitima začetnima oligonukleotidoma MINF in MINR. Za odkrivanje salmonel v vzorcih živil je bil razvit hiter postopek s pred-bogatitvijo, imuno magnetnim ločevanjem, bogatitvijo, izolacijo DNK, pomnoževanjem z verižno reakcijo s polimerazo in gelsko elektroforezo. Metoda omogoča odkrivanje ene celice salmonel v 25 gramih vzorca živila v manj kot 30 urah. Sorodnost med bakterijami rodu Salmonella in drugimi enterobakterijami je bila raziskana s primerjavo genov za 16S rRNK in medgenskih regij 16S-23S. Slednja omogoča enostavno ločevanje med preiskanimi salmonelami in drugimi enterobakterijami. Začetna oligonukleotida MINF in MINR sta bila označena z različnimi fluorokromi in uporabljena kot oligonukleotidni sondi v hibridizaciji in situ, fluorescentni signal sond pa odkrivan z epifluorescentno mikroskopijo in pretočno citometrijo. Oba začetna oligonukleotida sta bila uporabljena tudi v kompetitivni verižni reakciji s polimerazo (c-PCR), ki omogoča štetje mikrobnih celic. S primerno redčenim notranjim standardom DNK je mogoče v mikrobioloških vzorcih hitro in natančno odkrivati in ugotoviti število celic vrste Salmonella enterica.
Type of material - dissertation
Publication and manufacture - Ljubljana : [BF, Oddelek za živilstvo] : [M.Trkov], 1999
It was not necessary to add the material to the shelf.
Bibliographic material was successfully added on shelf.
Adding bibliographical material on shelf was not successful.
Material is already on the shelf.
Permalink
URL:
Impact factor
Access to the JCR database is permitted only to users from Slovenia. Your current IP address is not on the list of IP addresses with access permission, and authentication with the relevant AAI accout is required.
Year
Impact factor
Edition
Category
Classification
JCR
SNIP
JCR
SNIP
JCR
SNIP
JCR
SNIP
Select the library membership card:
DRS,
in which the journal is indexed
Database name
Field
Year
Links to authors' personal bibliographies
Links to information on researchers in the SICRIS system
Subject headings in COBISS General List of Subject Headings
Select pickup location
The material from the parent unit is free. If the material is delivered to the pickup location from another unit, the library may charge you for this service.
