(UL)
-
Priprava podatkovne zbirke izvencelične mikro RNA v serumu in plazmi = Design of extracellular micro RNA database in serum and plasma : enoviti magistrski študij farmacijaPraznik, Ajda, farmacevtkaMikro RNA (miRNA) so endogene, enoverižne RNA, ki uravnavajo izražanje genov in so pomembne pri številnih fizioloških in patoloških procesih (1,2). Kljub temu, da so miRNA v serumu oziroma plazmi ... privlačne kot obetavni diagnostični biooznačevalci, velik problem predstavlja njihova številčnost, tkivna nespecifičnost in posledično slaba korelacija med profilom mikro RNA in neko določeno boleznijo. Na podlagi sistematičnega pregleda objav o diagnostični uporabnosti miRNA v serumu in plazmi, smo pripravili zbirno tabelo miRNA s pripadajočo diagnostično uporabnostjo, diagnostičnimi parametri kot so specifičnost, občutljivost, natančnost in površina pod ROC krivuljo. Te smo nadalje statistično ovrednotili z metaanalizo, pri čemer smo uporabili programsko opremo Metadisc 1.40. Na osnovi ključnih besed smo oblikovali iskalni profil: ("microRNA"[All Fields] OR "miRNA"[All Fields]) AND ("diagnosis"[All Fields] OR "biomarker"[All Fields]) AND ("serum"[All Fields] OR "plasma"[All Fields]) NOT Review[ptyp] in v njem zajeli 2588 objav. Na osnovi predhodno oblikovanih vključitvenih in izključitvenih kriterijev smo delo nadaljevali s 437 objavami. V teh raziskavah smo preučevali skupno 467 miRNA in njihovih kombinacij. V pripravo ocene diagnostične uporabnosti smo vključili 290 posameznih in 177 kombinacij miRNA. Nadalje smo pridobljene podatke razdelili v štiri podskupine: rak dojke, rak debelega črevesa, nevrodegenerativne bolezni in mišično-skeletne bolezni in jih ločeno ovrednostili z metaanalizo. Metaanaliza podskupin je pokazala, da so skupne vrednosti občutljivosti in specifičnosti, kot merilo učinkovitosti diagnostičnega testa, pri odkrivanju raka dojke znašale 82,8 % in 77,5 %, pri raku debelega črevesja 77,8 % in 78,3 %, pri nevrodegenerativnih boleznih 81,1% in 78,4 % ter pri odkrivanju mišično-skeletnih bolezni 82,4 % in 81,2 %. Površina pod ROC krivuljo, ki klasifikatorje razvršča na osnovi njihovih sposobnosti napovedovanja bolezni, je znašala 0,9108 za napovedovanje raka dojke, 0,8734 za napovedovanje raka debelega črevesja, 0,9015 za napovedovanje nevrodegenerativnih bolezni in 0,8951 pri napovedi mišično-skeletnih bolezni. Posebej natančno smo ovrednotili povezanost mikro RNA za diagnosticiranje Alzheimerjeve bolezeni. MiRNA iz naše podatkovne zbirke smo primerjali s podatki o izražanju miRNA pri bolnikih z Alzheimerjevo boleznijo in pri zdravih kontrolah. S statističnim t testom smo ugotovili, da so štiri miRNA: miRNA-125b(p = 0,05), miRNA-142-3p (p = 0,0002), miRNA-483-3p (p = 0,05) in miRNA-483-5p (p = 0,04) diagnostično učinkovite pri prepoznavanju bolnikov z Alzheimerjevo boleznijo. Na podlagi rezultatov lahko zaključimo, da so miRNA iz podatkovne zbirke diagnostično uporabne. Za namen širše rabe zbirke podatkov smo pripravili tudi spletno aplikacijo, ki bo omogočala lažje iskanje in dostop do podatkov o vrsti ter uporabnosti miRNA v diagnostične namene.Type of material - master's thesis ; adult, seriousPublication and manufacture - Ljubljana : [A. Praznik], 2019Language - slovenianCOBISS.SI-ID - 4861809
Author
Praznik, Ajda, farmacevtka
Other authors
Marc, Janja |
Kranjc, Tilen
Topics
Ribonukleinska kislina |
Diagnostika |
Metapodatki |
mikro RNA |
biooznačevalci |
diagnosticiranje |
metaanaliza |
sistematičen pregled |
podatkovna zbirka |
pomožne snovi
Library | Call number – location, accession no. ... | Copy status |
---|---|---|
Faculty of Pharmacy, Lj. | Knjižnica emšf 543 PRAZNIK AJDA Priprava 802 IN: 0016425 |
available - reading room |
Shelf entry
Permalink
- URL:
Impact factor
Access to the JCR database is permitted only to users from Slovenia. Your current IP address is not on the list of IP addresses with access permission, and authentication with the relevant AAI accout is required.
Year | Impact factor | Edition | Category | Classification | ||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
JCR | SNIP | JCR | SNIP | JCR | SNIP | JCR | SNIP |
Select the library membership card:
If the library membership card is not in the list,
add a new one.
DRS, in which the journal is indexed
Database name | Field | Year |
---|
Links to authors' personal bibliographies | Links to information on researchers in the SICRIS system |
---|---|
Praznik, Ajda, farmacevtka | |
Marc, Janja | 12189 |
Kranjc, Tilen | 33053 |
Source: Personal bibliographies
and: SICRIS
Select pickup location:
Material pickup by post
Delivery address:
Address is missing from the member's data.
The address retrieval service is currently unavailable, please try again.
By clicking the "OK" button, you will confirm the pickup location selected above and complete the reservation process.
By clicking the "OK" button, you will confirm the above pickup location and delivery address, and complete the reservation process.
By clicking the "OK" button, you will confirm the address selected above and complete the reservation process.
Notification
Automatic login and reservation service currently not available. You can reserve the material on the Biblos portal or try again here later.
Subject headings in COBISS General List of Subject Headings
Select pickup location
The material from the parent unit is free. If the material is delivered to the pickup location from another unit, the library may charge you for this service.
Pickup location | Material status | Reservation |
---|
Reservation in progress
Please wait a moment.
Reservation was successful.
Reservation failed.
Reservation...
Membership card:
Pickup location: