VSE knjižnice (vzajemna bibliografsko-kataložna baza podatkov COBIB.SI)
-
Correlating protein hot spot surface analysis using ProBiS with simulated free energies of protein-protein interfacial residuesCarl, Nejc ...A protocol was developed for the computational determination of the contribution of interfacial amino acid residues to the free energy of protein-protein binding. Thermodynamic integration, based on ... molecular dynamics simulation in CHARMM, was used to determine the free energy associated with single point mutations to glycine in a protein-protein interface. The hot spot amino acids found in this way were then correlated to structural similarity scores detected by the ProBiS algorithm for local structural alignment. We find that amino acids with high structural similarity scores contribute on average -3.19 kcal/mol to the free energy of protein-protein binding and are thus correlated with hot spot residues, while residues with low similarity scores contribute on average only -0.43 kcal/mol. This suggests that the local structural alignment method provides a good approximation of the contribution of a residue to the free energy of binding and is particularly useful for detection of hot spots in proteins with known structures but undetermined protein-protein complexes.Vir: Journal of chemical information and modeling. - ISSN 1549-9596 (VOl. 52, issue 10, 2012, str. 2541-2549)Vrsta gradiva - članek, sestavni delLeto - 2012Jezik - angleškiCOBISS.SI-ID - 5069594
Avtor
Carl, Nejc |
Hodošček, Milan |
Vehar, Blaž |
Konc, Janez |
Brooks, Bernard R. |
Janežič, Dušanka, 1952-
Teme
analizna kemija |
proteini |
simulacije
vir: Journal of chemical information and modeling. - ISSN 1549-9596 (VOl. 52, issue 10, 2012, str. 2541-2549)
Vnos na polico
Trajna povezava
- URL:
Faktor vpliva
Dostop do baze podatkov JCR je dovoljen samo uporabnikom iz Slovenije. Vaš trenutni IP-naslov ni na seznamu dovoljenih za dostop, zato je potrebna avtentikacija z ustreznim računom AAI.
Leto | Faktor vpliva | Izdaja | Kategorija | Razvrstitev | ||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
JCR | SNIP | JCR | SNIP | JCR | SNIP | JCR | SNIP |
Baze podatkov, v katerih je revija indeksirana
Ime baze podatkov | Področje | Leto |
---|
Povezave do osebnih bibliografij avtorjev | Povezave do podatkov o raziskovalcih v sistemu SICRIS |
---|---|
Carl, Nejc | 28560 |
Hodošček, Milan | 02287 |
Vehar, Blaž | 30286 |
Konc, Janez | 25435 |
Brooks, Bernard R. | |
Janežič, Dušanka, 1952- | 06734 |
Vir: Osebne bibliografije
in: SICRIS
Izberite prevzemno mesto:
Prevzem gradiva po pošti
Naslov za dostavo:
Med podatki člana manjka naslov.
Storitev za pridobivanje naslova trenutno ni dostopna, prosimo, poskusite še enkrat.
S klikom na gumb "V redu" boste potrdili zgoraj izbrano prevzemno mesto in dokončali postopek rezervacije.
S klikom na gumb "V redu" boste potrdili zgoraj izbrano prevzemno mesto in naslov za dostavo ter dokončali postopek rezervacije.
S klikom na gumb "V redu" boste potrdili zgoraj izbrani naslov za dostavo in dokončali postopek rezervacije.
Obvestilo
Trenutno je storitev za avtomatsko prijavo in rezervacijo nedostopna. Gradivo lahko rezervirate sami na portalu Biblos ali ponovno poskusite tukaj kasneje.
Gesla v Splošnem geslovniku COBISS
Izbira mesta prevzema
Gradivo iz matične enote je brezplačno. Če je gradivo na mesto prevzema dostavljeno iz drugih enot, lahko knjižnica to storitev zaračuna.
Mesto prevzema | Status gradiva | Rezervacija |
---|
Rezervacija v teku
Prosimo, počakajte trenutek.
Rezervacija je uspela.
Rezervacija ni uspela.
Rezervacija...
Članska izkaznica:
Mesto prevzema: