Fakulteta za farmacijo, Ljubljana (FFALJ)
-
Raziskovanje vpliva ciklizacije peptida GSYWYNVWF na njegovo afiniteto do človeških imunoglobulinov G = Investigating the effect of GSYWYNVWF peptide cyclization on its affinity for human immunoglobulins G : univerzitetni študijski program Industrijska farmacijaNabernik, UršaPeptidi so skupina molekul, sestavljenih iz dveh ali več aminokislinskih ostankov, povezanih s peptidno vezjo. So vsestransko uporabni, med drugim igrajo pomembno vlogo afinitetnih ligandov ... imunoglobulinov (Ig) in so dobra alternativa naravnim Ig-vezavnim proteinom. Ker imajo bolj preprosto zgradbo v primerjavi s proteini, so bolj odporni na ostre pogoje čiščenja afinitetne kromatografske kolone, hkrati pa je njihovo pridobivanje cenejše. Peptidni afinitetni ligandi se selektivno in razmeroma močno vežejo na različne biološke molekule. Zlasti ciklični peptidi izkazujejo veliko selektivnost in afiniteto vezave, saj imajo manj dostopnih konformacij. Zaradi svoje togosti so lahko boljši ligandi od njihovih linearnih različic (če je vezavna konformacija podobna tisti, ki jo ciklični peptid zavzame v raztopini, pride namreč ob interakciji z vezavnim partnerjem do manjšega znižanja entropije, kar je termodinamsko ugodno). Vendar vsaka ciklizacija ne privede nujno do izboljšane afinitete. Nasprotno, lahko celo zelo poslabša afiniteto, če konformacija ob ciklizaciji postane neugodna. Zato je pri načrtovanju takih peptidnih različic smiselno postopno preverjati, kako določene spremembe v strukturi peptida vplivajo na afiniteto. Pri identifikaciji peptidov z visoko afiniteto večkrat uporabljamo tehniko predstavitve na bakteriofagu. To je robustna tehnika, ki olajša identifikacijo močnih in selektivnih peptidnih ligandov za ciljno tarčno makromolekulo. V magistrskem delu smo raziskali vpliv ciklizacije peptida GSYWYNVWF na njegovo afiniteto vezave. Na osnovi linearnega peptida, pridobljenega v pretekli razskavi, smo načrtovali nove ciklične peptidne različice, ki bi bile zmožne še močnejše vezave na regijo Fc IgG v primerjavi z linearnim peptidom. Zasnovane peptide smo predstavili na bakteriofagu ter ovrednotili njihovo vezavno afiniteto s testom ELISA. S takšnim pristopom smo uspešno odkrili peptid 6,11 Cys z aminokislinskim zaporedjem GSYWYCVWFGC (kjer sta cisteinska ostanka povezana z disulfidno vezjo), ki je izkazoval višjo afiniteto do IgG v primerjavi z njegovo linearno različico. Ugotovili smo, da sprememba mesta ciklizacije za samo eno mesto zelo vpliva na konformacijo peptida, ki postane neugodna in ima velik vpliv na vezavo. Ker je načrtovanje peptidov zamudno in ne obljublja želenih rezultatov, smo za lažje iskanje cikličnih peptidov z visoko afiniteto do IgG predlagali delno degeneriran oligonukleotid za pripravo kombinatorične knjižnice. S takim pristopom ohranjamo določene aminokisline na mestih, ki so pomembne za afiniteto peptida, vsa ostala mesta pa so popolnoma randomizirana. Na podlagi rezultatov smo za namen prihodnjih testiranj predlagali oligonukleotid, ki kodira peptidno zaporedje GXYWYCVWFXC, pri čemer X predstavlja randomizirani mesti, na katerih se lahko pojavi katerakoli od proteinogenih aminokislin.Vrsta gradiva - magistrsko delo ; neleposlovje za odrasleZaložništvo in izdelava - Ljubljana : [U. Nabernik], 2022Jezik - slovenskiCOBISS.SI-ID - 122486531
Avtor
Nabernik, Urša
Drugi avtorji
Bratkovič, Tomaž, farmacevt |
Bozovičar, Krištof
Teme
Peptidi |
Imunoglobulini |
ciklični peptidi |
ligandi |
afiniteta vezave |
predstavitev na bakteriofagu |
ELISA
![loading ... loading ...](themes/default/img/ajax-loading.gif)
Signatura – lokacija, inventarna št. ... |
Status izvoda | Rezervacija |
---|---|---|
Knjižnica mind 0000000543 NABERNIK URŠA Raziskovanje 0000000252 IN: 0017373 Knjižnica mind 543 NABERNIK URŠA Raziskovanje 252 IN: 0017373 |
prosto - za čitalnico
|
![loading ... loading ...](themes/default/img/ajax-loading.gif)
![loading ... loading ...](themes/default/img/ajax-loading.gif)
![loading ... loading ...](themes/default/img/ajax-loading.gif)
Vnos na polico
Trajna povezava
- URL:
Faktor vpliva
Dostop do baze podatkov JCR je dovoljen samo uporabnikom iz Slovenije. Vaš trenutni IP-naslov ni na seznamu dovoljenih za dostop, zato je potrebna avtentikacija z ustreznim računom AAI.
Leto | Faktor vpliva | Izdaja | Kategorija | Razvrstitev | ||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
JCR | SNIP | JCR | SNIP | JCR | SNIP | JCR | SNIP |
Baze podatkov, v katerih je revija indeksirana
Ime baze podatkov | Področje | Leto |
---|
Povezave do osebnih bibliografij avtorjev | Povezave do podatkov o raziskovalcih v sistemu SICRIS |
---|---|
Nabernik, Urša | ![]() |
Bratkovič, Tomaž, farmacevt | 23598 |
Bozovičar, Krištof | 53738 |
Vir: Osebne bibliografije
in: SICRIS
Izberite prevzemno mesto:
Prevzem gradiva po pošti
Naslov za dostavo:
Med podatki člana manjka naslov.
Storitev za pridobivanje naslova trenutno ni dostopna, prosimo, poskusite še enkrat.
S klikom na gumb "V redu" boste potrdili zgoraj izbrano prevzemno mesto in dokončali postopek rezervacije.
S klikom na gumb "V redu" boste potrdili zgoraj izbrano prevzemno mesto in naslov za dostavo ter dokončali postopek rezervacije.
S klikom na gumb "V redu" boste potrdili zgoraj izbrani naslov za dostavo in dokončali postopek rezervacije.
Obvestilo
Trenutno je storitev za avtomatsko prijavo in rezervacijo nedostopna. Gradivo lahko rezervirate sami na portalu Biblos ali ponovno poskusite tukaj kasneje.
Gesla v Splošnem geslovniku COBISS
Izbira mesta prevzema
Gradivo iz matične enote je brezplačno. Če je gradivo na mesto prevzema dostavljeno iz drugih enot, lahko knjižnica to storitev zaračuna.
Mesto prevzema | Status gradiva | Rezervacija |
---|
Rezervacija v teku
Prosimo, počakajte trenutek.
Rezervacija je uspela.
Rezervacija ni uspela.
Rezervacija...
Članska izkaznica:
Mesto prevzema: