Fakulteta za farmacijo, Ljubljana (FFALJ)
-
Vpliv prekomernega izražanja strukturnih proteinov M, N, S in E ter pomožnega proteina ORF6 virusa SARS-CoV-2 na izražanje genov iz družine APOBEC v človeških celičnih linijah HuH-7 in HeLa = The effect of SARS-CoV-2 virus structural proteins M, N, S, E and accessory protein ORF6 overexpression on the APOBEC gene family expression in human HuH-7 and HeLa cell lines : magistrska naloga laboratorijska biomedicinaLevačič, PatrikProteini APOBEC so citidinske deaminaze, skupina encimov, ki deaminirajo citidine v uridine na enojnoverižnih polinukleotidih. Njihova osnovna funkcija je urejanje RNA molekul, vendar lahko nekateri ... od teh proteinov urejajo tudi DNA molekule in s tem sodelujejo v procesih, ki vplivajo na genomsko variabilnost. Proteini APOBEC so protivirusni proteini in preprečijo razmnoževanje različnim RNA virusom, DNA virusom in retroelementom. Povezava med proteini APOBEC in virusom SARS-CoV-2 izhaja iz raziskav, ki so razkrile, da ti proteini lahko vplivajo na genom virusa. Med virusno okužbo se lahko izražanje APOBEC genov spremeni, kar lahko privede do nastanka mutacij v genomu SARS-CoV-2. Te mutacije lahko vplivajo na lastnosti virusa, kot je npr. sposobnost razmnoževanja, izmikanje imunskemu sistemu ali odpornost na zdravila. Poleg tega mutacije v genomu virusa prispevajo k njegovi evoluciji in pospešijo nastanek novih sevov ter s tem vplivajo na razširjenost virusa v populaciji. Izražanje genov iz družine APOBEC je običajno povišano med virusno okužbo, vendar ni popolnoma jasno, kakšen je vpliv na izražanje teh genov pri virusu SARS-CoV-2. Zato smo se v nalogi osredotočili na preučevanje vpliva prekomernega izražanja proteinov SARS-CoV-2 na izražanje genov APOBEC. V ta namen smo uporabili sesalski celični liniji, Huh-7 (izvorno izhaja iz hepatocelularnega tumorja) in HeLa (izvorno izhaja iz raka materničnega vratu). Sesalske celice smo transfecirali z različnimi plazmidnimi vektorji, ki so vsebovali zapis za strukturne proteine M, N, S, E in pomožni protein ORF6 virusa SARS-CoV-2 in s kvantitativno verižno reakcijo s polimerazo v realnem času (qPCR) izmerili nivo izražanja genov A1, A3A, A3B, A3C, A3D, A3F in A3G. Pri celični liniji Huh-7 je pri prekomernem izražanju strukturnega proteina N in pomožnega proteina ORF6 prišlo do znižanja izražanja gena A1, pri ostalih genih vpliv prekomernega izražanja proteinov SARS-CoV-2 na izražanje genov APOBEC nismo uspeli dokazati. Pri celični liniji HeLa vpliv prekomernega izražanja proteinov SARS-CoV-2 na izražanje genov iz družine APOBEC prav tako nismo uspeli dokazati. Rezultati raziskovalnega dela so pokazali, da prekomerno izražanje strukturnega proteina N in pomožnega proteina ORF6 zniža izražanje gena A1 in so v nasprotju s pričakovanji, saj naj bi se izražanje genov APOBEC med virusno okužbo zvišalo. Za boljše razumevanje vpliva na izražanje teh genov so potrebne nadaljnje raziskave.Vrsta gradiva - magistrsko delo ; neleposlovje za odrasleZaložništvo in izdelava - Ljubljana : [P. Levačić], 2023Jezik - slovenskiCOBISS.SI-ID - 165966851
Avtor
Levačič, Patrik
Drugi avtorji
Lovšin, Nika
Teme
COVID-19 |
SARS-CoV-2 |
proteini APOBEC |
HeLa |
Huh-7 |
virusni proteini
![loading ... loading ...](themes/default/img/ajax-loading.gif)
Signatura – lokacija, inventarna št. ... |
Status izvoda | Rezervacija |
---|---|---|
Knjižnica mlab 0000000616 LEVAČIČ PATRIK Vpliv 0000000343 IN: 0017810 Knjižnica mlab 616 LEVAČIČ PATRIK Vpliv 343 IN: 0017810 |
prosto - za čitalnico
|
![loading ... loading ...](themes/default/img/ajax-loading.gif)
![loading ... loading ...](themes/default/img/ajax-loading.gif)
![loading ... loading ...](themes/default/img/ajax-loading.gif)
Vnos na polico
Trajna povezava
- URL:
Faktor vpliva
Dostop do baze podatkov JCR je dovoljen samo uporabnikom iz Slovenije. Vaš trenutni IP-naslov ni na seznamu dovoljenih za dostop, zato je potrebna avtentikacija z ustreznim računom AAI.
Leto | Faktor vpliva | Izdaja | Kategorija | Razvrstitev | ||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
JCR | SNIP | JCR | SNIP | JCR | SNIP | JCR | SNIP |
Baze podatkov, v katerih je revija indeksirana
Ime baze podatkov | Področje | Leto |
---|
Povezave do osebnih bibliografij avtorjev | Povezave do podatkov o raziskovalcih v sistemu SICRIS |
---|---|
Levačič, Patrik | ![]() |
Lovšin, Nika | 19649 |
Vir: Osebne bibliografije
in: SICRIS
Izberite prevzemno mesto:
Prevzem gradiva po pošti
Naslov za dostavo:
Med podatki člana manjka naslov.
Storitev za pridobivanje naslova trenutno ni dostopna, prosimo, poskusite še enkrat.
S klikom na gumb "V redu" boste potrdili zgoraj izbrano prevzemno mesto in dokončali postopek rezervacije.
S klikom na gumb "V redu" boste potrdili zgoraj izbrano prevzemno mesto in naslov za dostavo ter dokončali postopek rezervacije.
S klikom na gumb "V redu" boste potrdili zgoraj izbrani naslov za dostavo in dokončali postopek rezervacije.
Obvestilo
Trenutno je storitev za avtomatsko prijavo in rezervacijo nedostopna. Gradivo lahko rezervirate sami na portalu Biblos ali ponovno poskusite tukaj kasneje.
Gesla v Splošnem geslovniku COBISS
Izbira mesta prevzema
Gradivo iz matične enote je brezplačno. Če je gradivo na mesto prevzema dostavljeno iz drugih enot, lahko knjižnica to storitev zaračuna.
Mesto prevzema | Status gradiva | Rezervacija |
---|
Rezervacija v teku
Prosimo, počakajte trenutek.
Rezervacija je uspela.
Rezervacija ni uspela.
Rezervacija...
Članska izkaznica:
Mesto prevzema: