Fakulteta za informacijske študije v Novem mestu (FIS)
-
Graphlet-based measures are suitable for biological network comparisonHayes, Wayne ; Sun, Kai ; Pržulj, Nataša, 1973-Motivation: Large amounts of biological network data exist for many species. Analogous to sequence comparison, network comparison aims to provide biological insight. Graphlet-based methods are ... proving to be useful in this respect. Recently some doubt has arisen concerning the applicability of graphlet-based measures to low edge density networksin particular that the methods are unstableand further that no existing network model matches the structure found in real biological networks. Results: We demonstrate that it is the model networks themselves that are unstable at low edge density and that graphlet-based measures correctly reflect this instability. Furthermore, while model network topology is unstable at low edge density, biological network topology is stable. In particular, one must distinguish between average density and local density.Whilemodel networks of low average edge densities also have low local edge density, that is not the case with protein protein interaction (PPI) networks: real PPI networks have low average edge density, but high local edge densities, and hence, they (and thus graphlet-based measures) are stable on these networks. Finally, we use a recently devised non-parametric statistical test to demonstrate that PPI networks of many species are well-fit by several models not previously tested. In addition, we model several viral PPI networks for the first time and demonstrateVir: Bioinformatics. - ISSN 1367-4803 (Vol. 29, no. 4, 2013, str. 483-491)Vrsta gradiva - članek, sestavni del ; neleposlovje za odrasleLeto - 2013Jezik - angleškiCOBISS.SI-ID - 2048186643
Avtor
Hayes, Wayne |
Sun, Kai |
Pržulj, Nataša, 1973-
Teme
sistemska biologija |
biološke mreže |
primerjava bioloških mrež |
računalniška biologija |
bioinformatika |
metode |
grafi |
systems biology |
biological networks |
computational biology |
bioinformatics |
graphlet-based measures |
biological networks data
Vnos na polico
Trajna povezava
- URL:
Faktor vpliva
Dostop do baze podatkov JCR je dovoljen samo uporabnikom iz Slovenije. Vaš trenutni IP-naslov ni na seznamu dovoljenih za dostop, zato je potrebna avtentikacija z ustreznim računom AAI.
Leto | Faktor vpliva | Izdaja | Kategorija | Razvrstitev | ||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
JCR | SNIP | JCR | SNIP | JCR | SNIP | JCR | SNIP |
Baze podatkov, v katerih je revija indeksirana
Ime baze podatkov | Področje | Leto |
---|
Povezave do osebnih bibliografij avtorjev | Povezave do podatkov o raziskovalcih v sistemu SICRIS |
---|---|
Hayes, Wayne | |
Sun, Kai | |
Pržulj, Nataša, 1973- | 34728 |
Vir: Osebne bibliografije
in: SICRIS
Izberite prevzemno mesto:
Prevzem gradiva po pošti
Naslov za dostavo:
Med podatki člana manjka naslov.
Storitev za pridobivanje naslova trenutno ni dostopna, prosimo, poskusite še enkrat.
S klikom na gumb "V redu" boste potrdili zgoraj izbrano prevzemno mesto in dokončali postopek rezervacije.
S klikom na gumb "V redu" boste potrdili zgoraj izbrano prevzemno mesto in naslov za dostavo ter dokončali postopek rezervacije.
S klikom na gumb "V redu" boste potrdili zgoraj izbrani naslov za dostavo in dokončali postopek rezervacije.
Obvestilo
Trenutno je storitev za avtomatsko prijavo in rezervacijo nedostopna. Gradivo lahko rezervirate sami na portalu Biblos ali ponovno poskusite tukaj kasneje.
Gesla v Splošnem geslovniku COBISS
Izbira mesta prevzema
Gradivo iz matične enote je brezplačno. Če je gradivo na mesto prevzema dostavljeno iz drugih enot, lahko knjižnica to storitev zaračuna.
Mesto prevzema | Status gradiva | Rezervacija |
---|
Rezervacija v teku
Prosimo, počakajte trenutek.
Rezervacija je uspela.
Rezervacija ni uspela.
Rezervacija...
Članska izkaznica:
Mesto prevzema: