Metabarcoding potentially offers a rapid and cheap method of monitoring biodiversity, but real-world applications are few. We investigated its utility in studying patterns of litter arthropod ...diversity and composition in the tropics. We collected litter arthropods from 35 matched forest-plantation sites across Xishuangbanna, southwestern China. A new primer combination and the MiSeq platform were used to amplify and sequence a wide variety of litter arthropods using simulated and real-world communities. Quality filtered reads were clustered into 3,624 MOTUs at ≥97% similarity and the taxonomy of each MOTU was predicted. We compared diversity and compositional differences between forests and plantations (rubber and tea) for all MOTUs and for eight arthropod groups. We obtained ~100% detection rate after in silico sequencing six mock communities with known arthropod composition. Ordination showed that rubber, tea and forest communities formed distinct clusters. α-diversity declined significantly between forests and adjacent plantations for more arthropod groups in rubber than tea, and diversity of order Orthoptera increased significantly in tea. Turnover was higher in forests than plantations, but patterns differed among groups. Metabarcoding is useful for quantifying diversity patterns of arthropods under different land-uses and the MiSeq platform is effective for arthropod metabarcoding in the tropics.
Restoration and reforestation of montane forests (sholas) constitute a major challenge in open, degraded and plantation areas in the upper Nilgiri Mountains, southern India. Recent studies have ...reported that exotic and tea plantations enhance natural regeneration of native species. In this study, we selected three treatments (thinned, unthinned and control) and established four 40 x 40 m (0.16 ha) plots as follows: one in a Thinned treatment (TP), two in an Unthinned treatment (UNT1 and UNT2) and one in a control treatment. The thinned and unthinned treatments were established in tea plantations while the control treatment was in a nearby shola nature reserve. Overall, a total of 635 sapling individuals belonging to 38 species, 31 genera and 22 families were recovered in all four plots. Species richness and stem density were lower while mean sapling height was higher in the thinned and unthinned treatments than in the control. The thinned and unthinned treatments shared only eight (21 %) species, indicating low spatial turnover. Berberis tinctoria Lesch. Daphniphyllum neilgherrense(Wight) K. Rosenthal., Neolitsea cassia(L.) Kosterm and Ligustrum perrottetii A. DC. were the most dominant species in the thinned and unthinned treatments. Litsea glabrata Gamble was the most dominant species in the control plot. Among the pioneers, most species (74 %) were shade tolerant while 26 % of the species were light tolerant. Bird dispersal (39 + or - 12.02 %) was significantly higher than Mammal/Anemochory/ Autochory. Random spatial distribution (58 %) was higher than clumped distribution (48 %) but the difference was not significant. Species diversity was significantly correlated among treatment plots. We, therefore, concluded that proper management of tea plantations facilitates regeneration of woody species of sholas and good recruitment of their seedlings into saplings were influenced by biotic dispersal. In addition, our results suggest that shola woody saplings growing in active tea plantations might be early successional species, thus making these species more effective for restoration of shola ecosystems.Original Abstract: La restauracion y la reforestacion de los bosques montanos (sholas) son un gran reto en areas degradadas y de plantacion en las Montanas Nilgiri, sur de la India. Estudios recientes reportaron que las plantaciones de te y de especies exoticas promueven la regeneracion natural de especies nativas. En este estudio seleccionamos tres tratamientos (con y sin aclareo, y control) y establecimos cuatro parcelas de 40 x 40 m (0.16 ha) de esta manera: una en un tratamiento con aclareo (TP), dos en un tratamiento sin aclareo (UNT1 y UNT2) y una con el control. Los tratamientos con y sin aclareo se establecieron en plantaciones de te, y que el tratamiento control lo fue en una reserva natural cercana de shola. En las cuatro parcelas se registraron en total 635 individuos de brinzales de 38 especies, 31 generos y 22 familias. La riqueza de especies y la densidad de tallos fueron menores, mientras que la altura promedio de los brinzales fue mayor en los tratamientos con y sin aclareo que en el control. Solo se compartieron ocho especies (21 %) entre los tratamientos con y sin aclareo, lo que indica un recambio espacial bajo. Berberis tinctoria Lesch., Daphniphyllum neilgherrense(Wight) K. Rosenthal, Neolitsea cassia(L.) Kosterm. y Ligustrum perrottetii A. DC. fueron las mas dominantes en los tratamientos con y sin aclareo. Litsea glabrata Gamble fue la especie dominante en la parcela control. Entre las pioneras, la mayoria de las especies (74 %) fueron tolerantes a la sombra, mientras que 26 % de ellas fueron tolerantes a la luz. La dispersion por aves (39 + or - 12.02 %) fue significativamente mas alta que la mamalocoria/anemocoria/autocoria. La distribucion espacial aleatoria (58 %) fue mayor que la distribucion agregada (48 %), pero la diferencia no fue significativa. La diversidad de especies estuvo significativamente correlacionada entre las parcelas de los tratamientos. Concluimos que el manejo adecuado de las plantaciones de te facilita la regeneracion de especies lenosas de los sholas y que el buen reclutamiento de sus plantulas a la etapa de brinzales estuvo influenciado por la dispersion biotica. Ademas, los resultados sugieren que la buena regeneracion natural de especies lenosas caracteristicas de las sholas y la colonizacion de sus brinzales en plantaciones activas de te hacen de ellas especies ideales pioneras o sucesionales tempranas efectivas para la restauracion de los ecosistemas de te.
We used a large dataset from permanent monitoring plots across four sites to examine whether liana composition, stem density and basal area were influenced by moderate level disturbance. Vegetation ...data were collected from four sampling sites that cover 13.58 ha in the southern montane evergreen forests (sholas) of the Western Ghats. All liana individuals with diameter at breast height (dbh) > or =1 cm were tagged, counted, mapped and identified to species level. A total of 1658 individuals belonging to 18 families, 24 genera and 33 species were recorded. Species richness did not differ significantly between disturbed and undisturbed sholas in Amaggal (AG), Kukkal (KK) and Upper Bhavani (UB) sites, but it differed significantly in Korakundah (KR) site (P < 0.05). Species composition of lianas responded to disturbance at lower percentage (9 %) among four sites. Density of lianas was significantly higher in disturbed than in undisturbed sholas across all four sites.Original Abstract: Se ha mostrado que las lianas responden a los disturbios naturales y antropogenicos en muchos bosques tropicales de todo el mundo. Sin embargo, poco se sabe acerca de como eldisturbio afecta la composicion, la densidad y el area basal de las lianas en los bosques perennifolios tropicales montanos (sholas) de los Ghats Occidentales, India. Usamos una base de datos grande de parcelas de monitoreo permanente en cuatro sitios para examinar si la composicion, la densidad de tallos y el area basal de las lianas estaban influenciados por un disturbio de nivel moderado. Se obtuvieron datos de vegetacion de cuatro sitios de muestreo que cubren 13.58 ha en los bosques montanos perennifolios (sholas) surenos de los Ghats Occidentales. Todos los individuos de lianas con diametro a la altura del pecho (DAP) = 1 cm fueron marcados, contados, mapeados e identificados a nivel de especie. Se registro un total de 1658 individuos pertenecientes a 18 familias, 24 generos y 33 especies. La riqueza de especies no difirio significativamente entre sholas perturbados y no perturbados en los sitios Amaggal (AG), Kukkal (KK) y Upper Bhavani (UB), pero si difirio en el sitio Korakundah (KR). La composicion de especies de lianas respondio aldisturbio en menor proporcion (9 %) entre los cuatro sitios. La densidad de lianas fue significativamente mayor en sholasperturbados que en los inalteradas los cuatro sitios. Las densidades medias fueron 5.69 + or - 6.10 y 10.19 + or - 3.35 en bancos perturbados y no perturbados, respectivamente, mientras que las proporciones de la densidad de tallos fueron de 66 % y 34 % en sholas perturbados y no perturbados, respectivamente. Sorprendentemente, el area basal mostro tendencias contrastantesen sholas perturbados y no perturbados. En los sitios KR y UB, el area basal promedio fue significativamente mayor en sholas no perturbados que en los perturbados, mientras que en los sitios AG y KK el area basal media fue significativamente mayor en los sholasperturbados que en los inalteradas. Los hallazgos del estudio indican que el disturbio humano de nivel moderado afecta la composicion, la abundancia y el area basal de las lianas en la region de estudio.