We present a new set of 11 polymorphic microsatellite primer sequences for use with Humulus lupulus. Microsatellite‐enriched libraries for GAn and GTn types of repeats were produced. Sequencing of 72 ...clones revealed 42 unique inserts containing microsatellites, out of which 19 primer pairs were designed and microsatellite amplification was tested on 39 wild hops and cultivars. Eleven primer pairs showed single locus amplification with 2–13 alleles, average 7.2, of which 17 unique alleles were discovered. One primer pair amplified too strong stutter bands, one locus was monomorphic and multilocus amplification was obtained with the remaining six primer pairs.
Smeđa trulež plodova, koju uzrokuje plijesan Monilinia laxa (Aderh. & Ruhl.) Honey, važan je patogen koštičavog i jabučastog voća što raste u Europi. U radu je provedena proteomička analiza te ...plijesni, izolirane iz plodova jabuka i marelica, da bi se dokazala njezina specifičnost za infekciju domaćina, te odredila ekspresija proteina odgovornih za njezinu specifičnost i patogenost. Također su određeni proteini koji se mogu upotrijebiti kao dijagnostički markeri. Proteini izolirani iz micelija plijesni, molekularne mase od 14 do 116 kDa, odijeljeni su 2-D elektroforezom (2-DE) i određeni bojanjem Coomassie bojom u nelinearnom pH području od 3 do 11. Za analizu dobivenoga grafičkog prikaza upotrijebljena je 2-DE referentna mapa plijesni M. laxa, te određeno 800 točaka što prikazuju proteine. Prosječni tehnički koeficijent varijacije od 13 % pokazuje da ekstrakcija proteina i 2-DE PAGE elektoroforeza imaju odličnu ponovljivost, a prosječni biološki koeficijent varijacije od 23 % omogućio je proteomičku analizu izolata. Multivarijantnom statističkom analizom glavnih komponenata (PCA) razdvojeni su izolati iz dvaju domaćina, što potvrđuje da postoji specijalizirani oblik M. laxa f. sp. mali koji uzrokuje smeđu trulež jabuke. Pomoću LC-MS/MS metode ispitano je 50 eksprimiranih proteina, od kojih je 41 pokazao podudarnost. Identificirani proteini micelija funkcionalno su razdvojeni u 6 skupina: proteini što sudjeluju u metabolizmu aminokiselina i proteina, proizvodnji energije, mehanizmu otpornosti na stres, metabolizmu masnih kiselina, te ostali proteini. Neki proteini izolirani iz plijesni s plodova jabuka djeluju kao virulentni faktori na ostale plijesni. Izolati plijesni specifični za jabuku sadržavali su približno 11 puta više enzima acetolaktat sintaze od onih izoliranih s marelica, što znači da je M. laxa specifična za domaćina. Deset proteina identificiranih samo u izolatima s jabuka mogu se upotrijebiti za razvoj dijagnostičkih markera za specifičnu M. laxa.
Three pairs of universal primers were used for PCR amplification of three non-coding regions of chloroplast DNA, followed by restriction fragment analysis of amplified fragments in order to study the ...variation among eight species and two subspecies of the genus Fagopyrum. Three length mutations were identified, which divided the analysed species into two distinct groups. Subsequent restriction fragment analysis revealed 15 different restriction patterns, which allowed further differentiation among some species. Phenetic analysis of the length and restriction pattern variation revealed genetic relationships that are consistent with the previous taxonomic arrangements of these species. The present study demonstrates the usefulness of this simple and low-cost technique for resolving genetic relationships in Fagopyrum.
U različitim genetičkim istraživanjima biljaka sve se više koriste mikrosateliti kao najpogodniji molekularni marker. U četrnaest analiziranih lokusa otkriveno je ukupno 96 alela, što omogućava vrlo ...veliku razlikovnost pri identifikaciji pojedinih sorta. Tipiziranjem genoma različitih sorta masline pomoću mikrosatelita dobivene su vrlo korisne informacije koje se mogu dopuniti uporabom dodatnih markera. Tom se metodologijom mogu karakterizirati i nove sorte maslina, a i obavljati pouzdane međulaboratorijske usporedbe rezultata. Dobiveni podaci mogu se koristiti pri izradbi baze podataka za identifikaciju pojedinih sorta i njihovu rasprostranjenost na području Slovenije. Oni također omogućavaju da se agronomske značajke i kakvoća različitih vrsta maslina dopune dodatnim genetičkim informacijama.
PDF
