Urolitijaza iz molekularne perspektive Opačak-Bernardi, Teuta; Babić-Ivančić, Vesna; Marić, Ivana
Medicinski vjesnik,
12/2009, Letnik:
41, Številka:
1-2
Journal Article
Odprti dostop
Urolitijaza se javlja u relativno velikom udjelu europskoga stanovništva, ali unatoč povećanom zanimanju za temeljna istraživanja i sve većoj prisutnosti molekularne biologije u medicini, njena ...molekularna osnova i uzroci nisu otkriveni. U radu se pokušalo dati uopćeni pregled glavnih interesnih područja molekularnih biologa koji se bave istraživanjem urolitijaze, uz napomenu da još podosta toga ostaje istražiti i daje to tek početni korak.
Frontotemporalne demencije (FTD) druga su po učestalosti grupa presenilnih demencija, koja se kliničkim simptomima i patologijom razlikuje od Alzheimerove demencije (AD). FTD se razlikuje od AD ...budući da je gubitak memorije rijetko prvi simptom bolesti. Umjesto toga, FTD karakteriziraju smetnje u ponašanju i govoru, a mogu se javiti i simptomi bolesti motornog neurona (BMN). Frontotemporalna lobarna degeneracija (FTLD) s ubikvitin-pozitivnim, tau-negativnim inkluzijama (FTLD-U) najučestalija je patološka slika s BMN-om ili bez njega. Glavni patološki protein FTLD-U s BMN-om ili bez njega je protein 43 vezan s DNA (TDP-43), kodiran od gena TARDBP, čija prisutnost je već dovoljna za nastanak neurodegenerativnih promjena. Glede genetike, FTLD je kompleksna bolest. Dio bolesnika s patološkom slikom FTLD-U pokazuje različite patološke mutacije progranulin (GRN) gena. Ostali FTLD-U entiteti s TDP-43-proteinopatijama uključuju: FTLD-U proteinom vezanim s valozinom i FTLD s BMN-om vezanim uz kromosom 9p. Nasuprot tomu, demencija vezana na kromosom 3, FTLD-U s CHMP2B-mutacijom, sadržava TDP-43-negativne inkluzije. Stoga, TDP-43-protein defi nira novu grupu neurodegenerativnih bolesti koje nazivamo TDP-43-proteinopatije. Ova novija otkrića pridonijet će točnijoj dijagnozi i ubrzati razvoj dijagnostike i terapije.
Metanogene arheje imaju neobične seril-tRNA-sintetaze (SerRS), evolucijski udaljene od SerRS koje se mogu naći u drugih arheja, eukariota i bakterija. Naša nedavna analiza kristalne strukture SerRS ...iz metanogene arheje Methanosarina barkeri otkrila je karakterističnu N-terminalnu domenu i katalitički ion cinka na aktivnom mjestu. Da bi se rasvijetlio način na koji metanogeni tip SerRS diskriminira supstrate, autori su istraživali in vivo interakciju metanogenog tipa SerRS s pripadnim molekulama tRNA u bakteriji Escherichia coli ili kvascu Saccharomyces cerevisiae. Ekspresija raznih SerRS metanogenoga tipa bila je toksična za bakteriju E. coli, te je rezultirala sintezom proteina s greškama u aminokiselinskom sastavu, što se vidi iz testa stabilnosti β-galaktozidaze. Iako je SerRS iz metanogenih arheja mogla prepoznati tRNASer iz sve tri domene života in vitro, vjerojatno je toksičnost zasjenila komplementaciju funkcije endogene SerRS u bakteriji E. coli i kvascu S. cerevisiae. Međutim, unatoč toksičnosti, koekspresija metanogenoga tipa SerRS s pripadnom tRNA suprimirala je bakterijsku amber mutaciju.
Zadatak podjednako znanstvenika i filozofa je da sumnjaju, dovode u pitanje pretpostavljene istine i pokušavaju osporiti znanstvene tvrdnje. Ovaj rad ispunjava taj zadatak iskušavanjem tvrdnje ...(neo-darwinističke) teorije evolucije o slučajnoj naravi genskih mutacija. Neo-darwinistička inačica teorije biološke evolucije vidi preoblikovanje živih oblika kroz stadije slučajne mutacije i neslučajnog prirodnog odabira. Prema definiciji slučajnosti mutacije nisu prouzročene niti imaju cilj u dobrobiti organizma u kojem se pojavljuju. Ipak, neki pokusi dovode u pitanje slučajnost mutacija tvrdeći njihovu neslučajnu narav, a pojmovna analiza ukazuje na dvosmislenosti pojmova slučajnosti i korisnosti. Uz to, nije opravdana primjena pojmovnih i metodoloških alata fizike u biologiji (osim u molekularnoj biologiji), koja ima vlastito područje s posebnim pojmovima, načelima i metodologijom. Usklađivanje pojmovnog značenja ukazuje da je neslučajna narav mutacijskog procesa posvjedočena specifičnom ekonomijom biološke evolucije. Implikacija neslučajne naravi mutacijskog procesa pretpostavlja svijet u kojem je postanak biološke raznolikosti vrlo vjerojatan.
U radu je prikazano optimiranje razmještaja kondenzatorskih baterija u stacionarnoj električnoj mreži primjenom genetskog algoritma. Razmještanje kondenzatorskih baterija obavljeno je s obzirom na ...najmanje djelatne gubitke u vodovima mreže za slučaj postojećih kondenzatorskih baterija, tj. za slučaj kada nema troška nabave kondenzatorskih baterija. Predloženi genetski algoritam prilagođen je navedenom problemu optimiranja. Prilagodba genetskog algoritma obavljena je učinkovitijim definiranjem kodiranja jedinki, jednostavnijim izborom načina selekcije i sinergijom genetskih operatora križanja i mutacije.
Uvod. Učestalost i smrtnost od karcinoma debelog crijeva u stalnom je porastu i zato je ova bolest vodeći
zdravstveni problem u svijetu i u Hrvatskoj. Nastaje složenim procesom tijekom kojeg dolazi ...do uzastopnih
promjena u tumor supresorskim genima, onkogenima i genima za popravak krivo sparenih baza. Karcinom
debelog crijeva može se pojaviti sporadično ili kao nasljedni oblik; u oba slučaja radi se o vrlo heterogenoj
skupini zloćudnih tumora. Geni KRAS i BRAF spadaju u skupinu onkogena. Njihovi produkti posreduju u
prijenosu signala od receptora za epidermalni čimbenik rasta (EGFR) na unutarstanične mitogenom aktivirane
protein kinaze (MAPK), te na taj način sudjeluju u kontroli staničnog ciklusa. Najčešće promjene ovih gena su
točkaste mutacije. Događaju se u dobroćudnoj fazi nastanka karcinoma debelog i završnog crijeva i odgovorne
su za klinički značajan rast tumora. Cilj ovog rada je odrediti učestalost i vrstu mutacija gena KRAS i BRAF u
uzorcima karcinoma debelog i završnog crijeva te ispitati da li postoji povezanost mutacija s patohistološkim
pokazateljima lošije prognoze bolesti. Materijali i metode. U istraživanje je uključeno 113 arhivskih uzoraka
(tkiva fiksirana u formalinu i uklopljena u parafin) karcinoma debelog i završnog crijeva osoba koje boluju od te
bolesti, operiranih u razdoblju od 2009. do 2011. godine u KBC-u Zagreb. Za izdvajanje DNA korišteno je 6-10
rezova debljine 10 mikrometara svakog pojedinog tkiva. Sedam najčešćih točkastih mutacija gena KRAS
(p.G12A, p.G12D, p.G12V, p.G12R, p.G12C, p.G12S, p.G13D) određeno je metodom kvantitativnog PCR u
stvarnom vremenu, a jedna mutacija gena BRAF (p.V600E) metodom PCR u stvarnom vremenu uz analizu
krivulje taljenja. Za svakog bolesnika prikupljeni su podaci o dobi, spolu, veličini tumora, histološkom gradusu
tumora, stadiju po Dukes'u, angioinvaziji i smještaju tumora. Usporedba učestalosti mutacija u uzorcima
podijeljenim po skupinama učinjena je Fisherovim testom, statističkom obradom podataka u programu MedCalc
v9.3.2.0. Rezultati. Mutacije gena KRAS dokazane su u 39,8% uzoraka, a najčešće je dokazana mutacija p.G12V
(42,2% uzoraka). Tranzicije i transverzije bile su podjednako zastupljene. Mutacija p.V600E gena BRAF
dokazana je u 8,8% uzoraka i to isključivo u uzorcima s nemutiranim genom KRAS. Učestalost mutacija gena
BRAF bila je viša u loše diferenciranim tumorima i tumorima klasificiranim u stadij bolesti Dukes'C (p = 0,04).
Sve mutacije gena BRAF dokazane su u karcinomima debelog crijeva (p = 0,01). Zaključak. Učestalost mutacija
gena KRAS i BRAF u populaciji bolesnika s karcinomom debelog i završnog crijeva iz Hrvatske nalazi se unutar
granica prijavljene učestalosti istih mutacija u drugim populacijama svijeta. Ističe se visok udio mutacije p.G12V
koja se povezuje s najlošijom prognozom bolesti, što bi se moglo povezati s kontinuirano visokom smrtnošću od
ove bolesti u Hrvatskoj. Viša učestalost mutacija gena BRAF u tumorima lošije prognoze upućuje na njihovu
ulogu u napredovanju bolesti.
Introduction. Incidence and mortality of colorectal cancer are on constant increase and represent one of the
major health problems in the world as well as in Croatia. The development of colon cancer is a multistep process
which involves successive genetic alterations of tumor supressor genes, oncogenes and mismatch repair genes.
Colon cancer can arise as sporadic or familial hereditary colon cancer, representing in both cases a very
heterogeneous group of malignant tumors. KRAS and BRAF genes are oncogenes. Their products mediate and
control cellular responses through mitogen activating protein kinase signal pathway (MAPK), downstream of
epidermal growth factor receptor (EGFR). The most common activating mutations of these oncogenes are point
mutations. They arise early during the development of colorectal cancer and are associated with the clinically
significant tumor growth. The aim of this study was to determine the incidence of KRAS and BRAF gene
mutations in colorectal cancer patients in Croatia and to assess whether they are linked with clinicopathological
features of poor prognosis. Materials and methods. A total of 113 consecutive colorectal cancer patients were
included in this research. They were operated on 2009-2011 period at University Hospital Center Zagreb.
Resected tumor samples were formalin fixed and paraffin embedded and prepared for DNA extraction as four to
six 10-μm sections. Seven common point mutations of KRAS gene (p.G12A, p.G12D, p.G12V, p.G12R, p.G12C,
p.G12S, p.G13D) were identified using quantitative real-time PCR, and the most common mutation of BRAF
gene (p.V600E) was detected using real-time PCR by fluorescence melting curve analysis. Clinical and
pathological data such as age, sex, tumor size, histologic grade, Dukes’stage, angioinvasion and tumor position
were collected for each patient. Differences in clinical and pathological variables between the groups of patients
with and without BRAF and KRAS mutations were analyzed using Fisher exact tests performed using MedCalc
v9.3.2.0. Results. KRAS gene mutations were detected in 39.8% samples, and the most frequent mutation was
p.G12V detected in 42.2% positive samples. Transitions and transversions were equally present. BRAF gene
mutation p.V600E was detected in 8.8% samples, exclusively in tumors without KRAS mutations. Incidence of
BRAF gene mutation was higher in poor differentiated and Dukes'C tumors (p = 0.04). All BRAF gene mutations
were detected in colon cancers (p = 0.01). Conclusion. The incidence of KRAS and BRAF gene mutations in
colorectal cancer patients from Croatia is within commonly accepted limits. High percentage of p.G12V
aggressive mutation can be related to high mortality from colorectal cancer in Croatia. High incidence of BRAF
gene mutations in tumors with poor prognostic markers shows that BRAF mutations play a role in the
progression of this disease.
Cilj: Istražiti kliničke osobitosti, patohistološke karakteristike tumora, način i ishode liječenja bolesnica s nasljednim karcinomom dojke i jajnika koje su dijagnosticirane, liječene i praćene u ...Kliničkom bolničkom centru Split od listopada 1999. do travnja 2021. godine.
Metode: Podatci su prikupljeni retrospektivno iz povijesti bolesti 15 bolesnica. Uključivali su dob bolesnica kod dijagnoze bolesti, obiteljsku anamnezu za zloćudne bolesti, histološki podtip, gradus, imunofenotip karcinoma dojke, stadij bolesti, status i tip BRCA mutacija, osobitosti kirurškog i onkološkog liječenja, specifičnosti metakrono nastalih bilateralnih karcinoma dojke, specifičnosti sinkrono nastalih karcinoma dojke i jajnika te ishod liječenja kroz ukupno preživljenje.
Rezultati: Medijan dobi bolesnica u trenutku dijagnoze raka dojke bio je 53 godine, a za karcinom jajnika 56 godina. Pozitivna obiteljska anamneza potvrđena je u 13 (87%) bolesnica. Karcinom jajnika je kod svih bolesnica bio seroznog papilarnog histološkog podtipa visokog gradusa i najčešće dijagnosticiran u FIGO stadiju III i IV. Karcinom dojke je najčešće dijagnosticiran u stadiju IA i IIA, jednake zastupljenosti trostruko negativnog i luminalnog imunofenotipa. Najčešća mutacija je bila BRCA1 c.5266dup. Medijan ukupnog preživljenja naših bolesnica nije dosegnut.
Zaključak: Kliničke osobitosti bolesnica, patohistološke karakteristike tumora kao i ishodi liječenja u našoj studijskoj populaciji su usporedivi s izvješćima iz literature, respektirajući specifičnosti različitih naroda i rasa.
Analizirane su aktivnost i kinetika arilsulfataze A (ASA, EC 3.1.6.8) u leukocitnim homogenatima osoba oboljelih od cerebralne paralize. Spektrofotometrijskim određivanjem aktivnosti ASA prema ...kromogenom supstratu p-nitrokatehol sulfatu (p-NCS) utvrđene su manje aktivnosti enzima u leukocitima oboljelih osoba. Kinetički parametri, Km i vmax, leukocitne ASA određeni su iz ovisnosti početne brzine reakcije o koncentraciji p-NCS. Utvrđena je manja razlika između Km vrijednosti enzima zdravih (0,21 mmol L-1) i oboljelih osobal (0.26 mmol L-1), dok je vrijednost vmax enzima iznosila 58% vrijednosti vmax enzima zdravih osoba. Također je u svih ispitanika s dijagnozom cerebralne paralize utvrđeno prisustvo najčešći mutacija povezanih s ASA pseudodeficijencijom (N350S, 1524+95 A>G) i metakromatskom leukodistrofijom (P426L). promjene aktivnosti i kinetičkih parametara leukocitne ASA u cerebralnoj parealizi najvjerojatnije su posljedica snižene koncentracije enzima; moguće je da nađene mutacije barem djelomično doprinose zapaženim promjenama.
PDF
