Polimorfizem kromosomske in mitohondrijske DNA lipana (Thymallus thymallus) in filogenetski odnosi med njegovimi geografsko ločenimi populacijami : doktorska disertacija
Sušnik Bajec, Simona
Lipan (Thzmallus thzmallus L. 1785) naseljuje hitro tekoče vode vseh glavnih evropskih porečij. Srednje tokove rek z veliko vsebnostjo kisika in nizkimi temperaturami, ki so značilni za življenjsko ...okolje lipana, je v zadnjih letih zelo prizadelo onesnaženje, kar je povzročilo zmanjšanje velikosti populacij lipana in je zato ohranjanje ogroženih populacij mogoče le s konstantnim vlaganjem. Za lipana je značilen interpopulacijski fenotipski polimorfizem, za katerega pa ni znano, ali je genetsko ali okoljsko pogojen. Za ohranitev morfološkega in genetskega interpopulacijskega polimorfizma bi morali biti vloženi lipani kar najbolj sorodni prizadeti populaciji. Potreben je torej razvoj molekularnih orodij, ki bi omogočala ločevanje med populacijami lipana in določanje njihove sorodnosti. V ta namen smo izolirali prve mikrosatelitne markerje, specifične za lipana in uporabili mtDNA kot genetski marker za ugotavljanje genetskega polimorfizma pri lipanu. V raziskavo smo vključili lipane iz vseh štirih glavnih evropskih povodij, posebno pozornost pa smo namenili populaciji lipana iz soškega porečja in primerjavi te populacije z donavsko. Iz lastne genomske knjižnice lipana smo izolirali preko 100 mikrosatelitov, od katerih smo jih 15 uporabili za populacijsko analizo. Kljub nizkemu ugotovljenemu številu alelov na posameznih lokusih pa so bile vrednosti obeh parametrov za ocenjevanje diferenciacije populacij (Fst in Rhost) zelo visoke, našli pa smo tudi veliko število alelov, ki so bili značilni le za eno populacijo, kar kaže na veliko genetsko diferenciacijo populacij. Ti rezultati potrjujejo informativnost 15 mikrosatelitnih lokusov za razlikovanje geografsko ločenih populacij lipana. V populacijsko analizo smo vključili tudi sekvenčno analizo dveh regij mtDNA: 5'-konec gena za citokrom b in 5'-konec kontrolne regije. Na osnovi variabilnih mest, ki so v obeh regijah vključevala tako tranzicije kot transverzije, smo v kontrolni regiji lahko določili osem in v regiji gena za citokrom b sedem različnih haplotipov, katerih razporeditev po populacijah je bila geografsko vezana. Variabilnost kontrolne regije je bila le malo nižja od variabilnosti regije gena za citokrom b; parne sekvenčne divergence med haplotipi so bile od 0,25 pa do 3,92%. Za lipana iz soškega in padskega porečja je bil značilen poseben haplotip v kontrolni regiji in v regiji gena za citokrom b, tako da predstavlja samostojno evolucijsko vejo in nima direktnega skupnega prednika z ostalimi haplotipi. Populacija lipana v soškem porečju se od donavske razlikuje tudi na ravni mikrosatelitov, saj smo kar na 12 od 15 analiziranih lokusov našli za populacijo iz soškega porečja značilne alele. Populacija lipana soškega porečja pa je zaradi vlaganja pripadnikov donavskih populacij zelo ogrožena. Stopnjo introgresije smo na osnovi analize mikrosatelitov ocenili na 60-70%. Kljub temu pa smo z genetskimi analizami potrdili izjemen položaj soške populacije lipana, ki zanesljivo predstavlja evolucijsko signifikantno enoto, ki je tudi formalna enota za ohranjanje ogroženih populacij. Za ohranjanje posameznih ogroženih populacij je treba to polimorfnost upoštevati; za ločevanje med populacijami pa lahko kot zanesljivo molekularno orodje uporabimo mikrosatelite, pa tudi mtDNA, ki je primerna predvsem za filogenetske analize.
Vrsta gradiva - disertacija
Založništvo in izdelava - Ljubljana : [S. Sušnik], 2001
Bibliografsko gradivo je bilo uspešno dodano na polico.
Dodajanje bibliografskega gradiva na polico ni uspelo.
Gradivo je že na polici.
Trajna povezava
URL:
Faktor vpliva
Dostop do baze podatkov JCR je dovoljen samo uporabnikom iz Slovenije. Vaš trenutni IP-naslov ni na seznamu dovoljenih za dostop, zato je potrebna avtentikacija z ustreznim računom AAI.
Leto
Faktor vpliva
Izdaja
Kategorija
Razvrstitev
JCR
SNIP
JCR
SNIP
JCR
SNIP
JCR
SNIP
Izberite knjižnično izkaznico:
Baze podatkov,
v katerih je revija indeksirana
Ime baze podatkov
Področje
Leto
Povezave do osebnih bibliografij avtorjev
Povezave do podatkov o raziskovalcih v sistemu SICRIS
Storitev za pridobivanje naslova trenutno ni dostopna, prosimo, poskusite še enkrat.
S klikom na gumb "V redu" boste potrdili zgoraj izbrano prevzemno mesto in dokončali postopek rezervacije.
S klikom na gumb "V redu" boste potrdili zgoraj izbrano prevzemno mesto in naslov za dostavo ter dokončali postopek rezervacije.
S klikom na gumb "V redu" boste potrdili zgoraj izbrani naslov za dostavo in dokončali postopek rezervacije.
Obvestilo
Trenutno je storitev za avtomatsko prijavo in rezervacijo nedostopna. Gradivo lahko rezervirate sami na portalu Biblos ali ponovno poskusite tukaj kasneje.
Citiranje
Funkcionalnost trenutno ni na voljo. Prosimo, poskusite kasneje.
