(UL)
-
Vrednotenje učinkov himernih molekul za razgradnjo O-GlcNAc transferaze na celično linijo diseminiranega plazmocitoma = Biological evaluation of chimeric degraders of O-GlcNAc transferase on a multiple myeloma cell line : magistrski študijski program Laboratorijska biomedicinaSimonič, SaraEncim O-GlcNAc transferaza (OGT) je ključen encim v procesu N-acetilglukozaminacije, kar pomeni, da je vključen tudi v številne celične procese. Njegovo deregulacijo povezujejo s številnimi obolenji, ... zato predstavlja morebitno tarčo kot prijemališče za zdravljenje. Za ta namen potrebujemo učinkovito molekulsko orodje, ki bi nam omogočilo proučevanje vloge OGT. V zadnjih letih v ospredje prihajajo himerne molekule, znane tudi kot molekule PROTAC, ki ne zavirajo delovanja tarčnih proteinov, temveč vodijo v njihovo razgradnjo, saj za svoje delovanje izkoriščajo ubikvitin-proteasomski sistem. V sklopu magistrske naloge smo vrednotili biološki učinek dvanajstih himernih razgrajevalcev encima OGT, sintetiziranih na Katedri za farmacevtsko kemijo (UL FFA). Pri načrtovanju molekul PROTAC so kot ligand za OGT uporabili zaviralec OSMI-4 ter različne ligande za E3 ligaze (VHL, CRBN in IAP). Kot celični model smo uporabili celično linijo MM.1S, saj izraža tako tarčni protein OGT kot tudi vse tri ligaze. V prvem delu smo preverjali morebitni vpliv molekul PROTAC na razgradnjo encima OGT. Z metodo prenosa western smo ovrednotili nivo OGT proteina in ugotovili, da pri koncentraciji 1 µM nobena izmed molekul PROTAC ne povzroči vidne razgradnje encima. Ker so himerni razgrajevalci molekulsko velike spojine, smo v nadaljevanju preverili ali odsotnost učinka ni morebiti posledica slabe celične permeabilnosti. Ugotovili smo, da molekule, osnovane na ligandih za ligazo IAP ter CRBN, prehajajo membrano, saj smo potrdili avtorazgradnjo cIAP-1 ter razgradnjo CRBN neosubstrata IKZF1. Znano je, da zaviranje OGT vodi v kompenzatorne mehanizme, ki povzročijo višji novo encima, zato smo nadalje preverili ali je odsotnost razgradnje OGT posledica povratne zanke. S tem namenom smo v celicah zavrli de novo sintezo proteinov z dodatkom cikloheksimida ter jih nato izpostavili himernemu zaviralcu 12. Ugotovili smo, da PROTAC 12 tudi v prisotnosti cikloheksimida ni povzročil vidne razgradnje OGT. Prav tako smo preverjali morebiten vpliv PROTAC 12 na izločanje izbranih vnetnih dejavnikov. Tudi v tem primeru nismo opazili vidnega vpliva na celični fenotip. Rezultati torej kažejo, da nobena od dvanajstih spojin ne vodi v razgradnjo encima OGT, zato bodo potrebne nadaljnje modifikacije molekul PROTAC ali optimizacije eksperimentalnih modelov, da bi s tem dosegli uspešno razgradnjo encima OGT ter z njimi nato podrobneje raziskali vpliv encima v celični homeostazi.Vrsta gradiva - magistrsko delo ; neleposlovje za odrasleZaložništvo in izdelava - Ljubljana : [S. Simonič], 2024Jezik - slovenskiCOBISS.SI-ID - 197244931
Avtor
Simonič, Sara
Drugi avtorji
Gobec, Martina, 1983-
Teme
Klinična kemija |
O-GlcNAc transferaza |
celična linija MM.1S |
himerni razgrajevalci |
povratne zanke |
reverzna transkripcija
![loading ... loading ...](themes/default/img/ajax-loading.gif)
Knjižnica | Signatura – lokacija, inventarna št. ... | Status izvoda |
---|---|---|
Fakulteta za farmacijo, Ljubljana | Knjižnica mlab 616 SIMONIČ SARA Vrednotenje 369 IN: 0018163 |
prosto - za čitalnico |
![loading ... loading ...](themes/default/img/ajax-loading.gif)
![loading ... loading ...](themes/default/img/ajax-loading.gif)
![loading ... loading ...](themes/default/img/ajax-loading.gif)
Vnos na polico
Trajna povezava
- URL:
Faktor vpliva
Dostop do baze podatkov JCR je dovoljen samo uporabnikom iz Slovenije. Vaš trenutni IP-naslov ni na seznamu dovoljenih za dostop, zato je potrebna avtentikacija z ustreznim računom AAI.
Leto | Faktor vpliva | Izdaja | Kategorija | Razvrstitev | ||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
JCR | SNIP | JCR | SNIP | JCR | SNIP | JCR | SNIP |
Baze podatkov, v katerih je revija indeksirana
Ime baze podatkov | Področje | Leto |
---|
Povezave do osebnih bibliografij avtorjev | Povezave do podatkov o raziskovalcih v sistemu SICRIS |
---|---|
Simonič, Sara | ![]() |
Gobec, Martina, 1983- | 32034 |
Vir: Osebne bibliografije
in: SICRIS
Izberite prevzemno mesto:
Prevzem gradiva po pošti
Naslov za dostavo:
Med podatki člana manjka naslov.
Storitev za pridobivanje naslova trenutno ni dostopna, prosimo, poskusite še enkrat.
S klikom na gumb "V redu" boste potrdili zgoraj izbrano prevzemno mesto in dokončali postopek rezervacije.
S klikom na gumb "V redu" boste potrdili zgoraj izbrano prevzemno mesto in naslov za dostavo ter dokončali postopek rezervacije.
S klikom na gumb "V redu" boste potrdili zgoraj izbrani naslov za dostavo in dokončali postopek rezervacije.
Obvestilo
Trenutno je storitev za avtomatsko prijavo in rezervacijo nedostopna. Gradivo lahko rezervirate sami na portalu Biblos ali ponovno poskusite tukaj kasneje.
Gesla v Splošnem geslovniku COBISS
Izbira mesta prevzema
Gradivo iz matične enote je brezplačno. Če je gradivo na mesto prevzema dostavljeno iz drugih enot, lahko knjižnica to storitev zaračuna.
Mesto prevzema | Status gradiva | Rezervacija |
---|
Rezervacija v teku
Prosimo, počakajte trenutek.
Rezervacija je uspela.
Rezervacija ni uspela.
Rezervacija...
Članska izkaznica:
Mesto prevzema: