Svaki projekt je izložen raznim vrstama rizika tijekom njegove provedbe koji utječu na uspješnost same provedbe, ali i vjerojatnost ostvarivanja planiranih ciljeva u zadanom vremenskom roku. Pomno analiziranje rizika i kreiranje timova koji imaju dovoljno znanja i iskustva za pravilno provođenje projektnih aktivnosti od presudne su važnosti za uspješnu provedbu projekta. Europski strukturni i investicijski fondovi (ESI) nude mogućnost financiranja projektnih aktivnosti sektoru malih i srednjih poduzeća. Cilj ovoga rada je identificirati najčešće rizike i pogreške vezane uz provedbu projekata u malim i srednjim poduzećima, te dati preporuke za njihovo minimiziranje. Kako bi se dobio uvid u pogreške koje najčešće čine vlasnici malih i srednjih poduzeća u procesu provedbe projekta, provedeno je istraživanje na 52 ispitanika (projektni menadžeri, djelatnici Središnje agencije za financiranje i ugovaranje programa i projekta EU, te djelatnici resornih ministarstava). Istraživanjem su detektirane najveće i najčešće pogreške, ali i izazovi s kojima se susreću vlasnici malih i srednjih poduzeća. Ispitanici iz sektora malih i srednjih poduzeća naveli su i najveće izazove s kojima se susreću tijekom pripreme, ugovaranja i provedbe projekata Europske unije (EU projekata). Rezultati istraživanja upućuju na nužnost jačanja kapaciteta prijavitelja projekata, ali i jače suradnje između prijavitelja i nadzornih tijela.