Proučevanje vezave zaviralcev Hsp90 v alosterično vezavno mesto izoform Hsp90α in Hsp90β z molekulskim sidranjem = Studying binding modes of Hsp90 inhibitors in the allosteric binding site of Hsp90α and Hsp90β isoforms by molecular docking : magistrski študijski program Industrijska farmacija
Avdičević, Amela
Proteini toplotnega šoka 90 (Hsp90) so šaperoni, katerih glavna naloga je pomagati proteinom zavzeti ustrezno nativno konformacijo, s čimer postanejo funkcionalni. Sodelujejo tudi v drugih celičnih ...procesih, kot so nadzor celičnega cikla, signalizacija, sposobnost preživetja celic, apoptoza in razgradnja proteinov. Pri fizioloških pogojih so v celicah prisotni v nizkih koncentracijah, pod stresnimi pogoji (kot so povišana temperatura, UV sevanje, izpostavljenost mrazu itd.) pa se njihova ekspresija poveča kot odziv na celični stres. Posledično so močno izraženi tudi v rakavih celicah, v katerih stabilizirajo konformacijsko nestabilne in napačno zvite proteine ter jim tako omogočajo preživetje, zato so zaviralci Hsp90 potencialne protirakave učinkovine. V sklopu magistrske naloge smo proučevali vezavo izbranih zaviralcev Hsp90 v alosterično vezavno mesto izoform Hsp90α in Hsp90β s pomočjo molekulskega sidranja, s katerim smo lahko napovedali orientacijo, položaj in konformacijo liganda vezanega v vezavnem mestu proteina ter ocenili njegovo aktivnost in selektivnost med izoformama. Kot izhodišče smo najprej pripravili knjižnico zaviralcev Hsp90 že sintetiziranih in ovrednotenih na Univerzi v Ljubljani, Fakulteti za farmacijo. Spojinam smo nato izračunali fizikalno-kemijske lastnosti. Na podlagi slednjih ter že znanih vrednosti antiproliferativnega delovanja zaviralcev v rakavih celičnih linijah (MCF-7, Sk-Br3 in SK-N-MC) smo izbrali spojine, ki bi se lahko pokazale kot optimalne za nadaljnje delo. Sledila je validacija programov za sidranje, s katero smo preverili, katerega od računalniških programov (Glide, Autodock 4.2 in AutodockVina) je najbolje uporabiti za sidranje spojin. Tako smo izbrane spojine TZZ-103, TZZ-122, TZZ-151, TMT-11, TJD-54, TMM-7b in TMM-17 sidrali z računalniškim programom Glide, za katerega smo ugotovili, da je najustreznejši in na osnovi dobljenih rezultatov ocenili vezavno konformacijo in selektivnost zaviralcev za posamezno izoformo. Kot selektivne so se izkazale spojine TZZ-151, TMT-11 ter TMM-7b, vendar bi to bilo potrebno potrditi tudi eksperimentalno. Rezultati magistrske naloge so pomemben korak k razumevanju vezave alosteričnih zaviralcev Hsp90 in njihove selektivnosti med izoformama Hsp90α in Hsp90β.
Type of material - master's thesis
; adult, serious
Publication and manufacture - Ljubljana : [A. Avdičević], 2023
Knjižnica mind 615.4 AVDIČEVIĆ AMELA Proučevanje 0000000274 IN: 0017660
Knjižnica mind 615.4 AVDIČEVIĆ AMELA Proučevanje 274 IN: 0017660
available - reading room
Shelf entry
Adding material to shelf was successful.
Adding material to shelf failed.
It was not necessary to add the material to the shelf.
Bibliographic material was successfully added on shelf.
Adding bibliographical material on shelf was not successful.
Material is already on the shelf.
Permalink
URL:
Impact factor
Access to the JCR database is permitted only to users from Slovenia. Your current IP address is not on the list of IP addresses with access permission, and authentication with the relevant AAI accout is required.
Year
Impact factor
Edition
Category
Classification
JCR
SNIP
JCR
SNIP
JCR
SNIP
JCR
SNIP
Select the library membership card:
DRS,
in which the journal is indexed
Database name
Field
Year
Links to authors' personal bibliographies
Links to information on researchers in the SICRIS system
Subject headings in COBISS General List of Subject Headings
Select pickup location
The material from the parent unit is free. If the material is delivered to the pickup location from another unit, the library may charge you for this service.
