The text is a compendium of modern research techniques that enable the identification, separation and sequencing of proteins. They serve in the analysis of protein structure and also in the study of ...the relationship between protein structure and their biological function, including within metabolic processes. The richly illustrated publication is supplemented with additional materials.
Svrha: Željelo se pronaći optimalne uvjete i metode za identifikaciju maksimalnog broja proteina u uzorcima tkiva gingive pacijentice s agresivnim parodontitisom. Pritom smo se koristili tehnologijom ...Label-free kvantifikacije, tekućinske kromatografije i spektrometrije masa (LC –MS/MS), te usporedili proteom zdravih i bolesnih uzoraka tkiva gingive. Materijali i metode: Četiri uzorka gingivnog tkiva (dva zdrava i dva bolesna) uzeta su od pacijentice, inače nepušačice, koja boluje od teškog oblika generaliziranog agresivnog parodontitisa. Proteini tkivnog lizata razdvojeni su 1D gel-elektroforezom nakon koje je slijedila digestija u gelu te mjerenje proteina nanoljestvicom
HPLC-sistema preko nanoelektro spreja, ionizacijskog izvora i spektrometra mase. Dobiveni podaci obrađeni su u programu MaxQuant. Rezultati: Label-free kvantifikacija i LC-MS/MS analiza,
zajedno s pripremom uzoraka, 1D gel-elektroforezom i digestijom u gelu pokazali su se kao učinkovita metoda za analizu proteoma gingivnog tkiva. Ukupan broj identificiranih i kvantificiranih proteina iznosio je 2429. Proteini koji su pokazali pojačanu ekspresiju u tkivu zahvaćenom agresivnim parodontitisom bili su: imunoglobulinski gama-1 lanac regije C, imunoglobulinski kapa lanac regije C i imunoglobulinski gama-3 lanac regije C (Ig gamma-1 chain C region, Ig kappa chain C region i Ig gamma-3 chain C region), a desmoplakin, aneksini, proteini S100-A8/A9 i keratini pokazali su sniženu ekspresiju. Zaključak: Ovo eksperimentalno istraživanje omogućuje novi uvid u proteomski profil zdravog i bolesnog gingivnog tkiva, što bi moglo pridonijeti napretku u dijagnostici i prognozi te boljem razumijevanju patogeneze agresivnog parodontitisa. Tehnologija LCMS/ MS pokazala se učinkovitom kad je riječ o proteomskoj analizi gingivnog tkiva.
Patogenezu složene i heterogene bolesti kao što je to rak dojke nije moguće u potpunosti
razjasniti klasičnim metodološkim pristupima koji su se koristi li posljednjih desetljeća
u molekularnoj ...medicini. Osobito je važno otkriti nove biljege koji bi pomogli u ranoj detekciji
bolesti te služili za razvoj ciljane terapije. Dosadašnji rezultati iz područja istraživanja raka
dojke u kombinaciji s globalnim metodama istraživanja statusa ekspresije gena i proteina
pokazali su kako je u patogenezu raka dojke uključen ljudski hormon rasta (hGH) te mehanizmi
autokrine regulacije preko proteina Pax-5. Također je identi fi ciran čitav niz novih potencijalnih
biomarkera kao što su to HOXA1, CHOP SH3GLB1, kazein kinaze, p53, aneksin XI, CDC25C, eIF-
4E i MAP kinaze 7, 14-3-3e, galekti n-1, aneksin-5, aneksin-1, LDH-B, GST-pi, akti n, vimenti n,
HSP70, CK18, moezin, SH3GLB1, SUB1, SND1 i TRIM28, osteoponti n i osteonekti n
PDF
