(UL)
-
Vrednotenje metode za določanje prisotnosti virusa SARS-CoV-2 na osnovi obratne transkripcije in multiple verižne reakcije s polimerazo v različno odvzetih vzorcih sline = Evaluation of multiplex reverse transcriptase - polymerase chain reaction for detection of SARS-CoV-2 virus in differently collected saliva samples : enoviti magistrski študij farmacijePusser, KatarinaDecembra 2019 so se v Wuhanu na Kitajskem prvič začele pojavljati okužbe z novim koronavirusom SARS-CoV-2, ki so se kmalu sunkovito razširile po svetu. Kužnost virusa je visoka, saj ena okužena oseba ... v povprečju okuži dve do tri zdrave osebe. Za namene diagnosticiranja okužbe poznamo več metod, med katerimi ostajajo zlati standard molekularni testi, ki temeljijo na RT-PCR metodi. Vzorci so najpogosteje pridobljeni iz enostavno dostopnih območij, kot je nosno-žrelni bris. Ti brisi so neprijetni za odvzem in predstavljajo veliko tveganje za prenos okužbe na zdravstveno osebje, zato se za namene množičnega testiranja raziskujejo dodatne možnosti vzorčenja. Slina predstavlja potencialni alternativni vzorec za detekcijo okužbe, zato se ji na področju razvijanja testov v zadnjem času namenja veliko pozornosti. Vzorčenje sline je neinvazivno, ugodnejše in predstavlja manjše tveganje za prenos okužbe na osebje. V namene proučevanja sline smo vzpostavili multiplo RT-qPCR metodo. Določili smo analizno občutljivost 3 kopij virusne RNA/reakcijo oz. 3000 kopij/mL. Naša metoda tako ustreza intervalu zaznavnosti odobrenih metod s strani Evropske komisije in je dovolj občutljiva, da zazna virus v slini pred pojavom simptomov. Metodo smo ovrednotili z različno odvzetimi vzorci sline. Primerjali smo vzorce pridobljene s slinjenjem, rejonsko in najlonsko palčko. Rezultate testiranja vzorcev smo primerjali z vzorci nosno-žrelnega brisa, ki jih je preiskovancem odvzelo zdravstveno osebje za namene splošnega testiranja na virus. Potrdili smo, da način odvzema vzorca sline vpliva na diagnostično občutljivost, ne vpliva pa na diagnostično specifičnost testa. Najboljše rezultate daje odvzem vzorca s slinjenjem s skupno občutljivostjo 85 % pri Cp < 30. Vzorci, pridobljeni s slinjenjem, imajo prav tako najboljše ujemanje z rezultati vzorcev nosno-žrelnega brisa, uradno potrjene metode iz NLZOH (90 % pri Cp < 30). Zbiranje sline s slinjenjem je torej primeren način pridobivanja vzorca. Nato smo primerjali klinično-diagnostične lastnosti naše metode za vzorce slinjenja s primerljivimi metodami, izvedenimi na Kemijskem inštitutu (KI) in Nacionalnem inštitutu za biologijo (NIB). Preverjali smo vpliv reakcijskega volumna na rezultate testiranja, saj smo na Fakulteti za farmacijo izvedli multiplo RT-qPCR z manjšimi reakcijskimi volumni kot na KI in NIB. S primerjavo smo potrdili, da je uporaba večjih volumnov primernejša. Pri manjših volumnih smo dobili več lažno negativnih rezultatov, kar se kaže v slabši občutljivosti.Type of material - master's thesis ; adult, seriousPublication and manufacture - Ljubljana : [K. Pusser], 2021Language - slovenianCOBISS.SI-ID - 91838979
Author
Pusser, Katarina
Other authors
Šmid, Alenka, farmacevtka |
Benčina, Mojca, 1968-
Topics
Korona virusi |
COVID-19 |
SARS-CoV-2 |
RT-qPCR |
diagnostična metoda |
virusni proteini |
verižna reakcija s polimerazo
![loading ... loading ...](themes/default/img/ajax-loading.gif)
Library | Call number – location, accession no. ... | Copy status |
---|---|---|
Faculty of Pharmacy, Lj. | Knjižnica emšf 616 PUSSER KATARINA Vrednotenje 1042 IN: 0017156 |
available - reading room |
![loading ... loading ...](themes/default/img/ajax-loading.gif)
![loading ... loading ...](themes/default/img/ajax-loading.gif)
![loading ... loading ...](themes/default/img/ajax-loading.gif)
Shelf entry
Permalink
- URL:
Impact factor
Access to the JCR database is permitted only to users from Slovenia. Your current IP address is not on the list of IP addresses with access permission, and authentication with the relevant AAI accout is required.
Year | Impact factor | Edition | Category | Classification | ||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
JCR | SNIP | JCR | SNIP | JCR | SNIP | JCR | SNIP |
Select the library membership card:
If the library membership card is not in the list,
add a new one.
DRS, in which the journal is indexed
Database name | Field | Year |
---|
Links to authors' personal bibliographies | Links to information on researchers in the SICRIS system |
---|---|
Pusser, Katarina | ![]() |
Šmid, Alenka, farmacevtka | 29982 |
Benčina, Mojca, 1968- | 14360 |
Source: Personal bibliographies
and: SICRIS
Select pickup location:
Material pickup by post
Delivery address:
Address is missing from the member's data.
The address retrieval service is currently unavailable, please try again.
By clicking the "OK" button, you will confirm the pickup location selected above and complete the reservation process.
By clicking the "OK" button, you will confirm the above pickup location and delivery address, and complete the reservation process.
By clicking the "OK" button, you will confirm the address selected above and complete the reservation process.
Notification
Automatic login and reservation service currently not available. You can reserve the material on the Biblos portal or try again here later.
Subject headings in COBISS General List of Subject Headings
Select pickup location
The material from the parent unit is free. If the material is delivered to the pickup location from another unit, the library may charge you for this service.
Pickup location | Material status | Reservation |
---|
Reservation in progress
Please wait a moment.
Reservation was successful.
Reservation failed.
Reservation...
Membership card:
Pickup location: