Optimizacija in uporabnost metode za identifikacijo cianobakterij v okoljskih vzorcih na osnovi DNA
Burger, Evgenija ...
Cvetenje cianobakterij je pogosto povezano z izločanjem toksinov, zato je pomembno, da pravočasno identificiramo morebitne strupene vrste cianobakterij. Cilja našega raziskovanja sta bila priprava ...hitrega, zdravju neškodljivega in učinkovitega protokola za izolacijo DNA iz okoljskih vzorcev oziroma cianobakterijskih celic ter postavitev smernic za identifikacijo posameznih cianobakterijskih vrst na osnovi analize DNA. Optimizirali smo protokol za hrambo okoljskih vzorcev, izolacijo DNA in pomnoževanje regij rRNA 16 S in ITS-1 na kromosomu. Večjo natančnost kot z določitvijo velikosti pomnoženih regij smo pri določanju heterogenosti cianobakterijskih vzorcev dosegli z restrikcijsko analizo PCR-produktov in določitvijo nukleotidnega zaporedja. Iz nabora dostopnih encimov smo kot najbolj uporabne restrikcijske nukleaze identificirali EcoRI, NcoI, EcoRV, KpnI in BclI. Pri določanju nukleotidnih zaporedij smo ugotovili, da so začetni oligonukleotidi, namenjeni za pomnoževanje genomskih regij pri cianobakterijah, pomnožili tudi nekatera kloroplastna zaporedja evkariontskih alg. Pripravili smo zgledne primere restrikcijske analize pomnoženih genomskih regij za identifikacijo dveh cianobakterij. Za vzorec z Blejskega jezera smo ugotovili, da je bilo nukleotidno zaporedje regije ITS-1 identično kot pri sevu Planktothrix rubescens NIVA_CYA18 in še nekaterih drugih. To kaže na minimalne razlike v sicer šibko ohranjeni genomski regiji ITS med različnimi izolati oziroma na svetovno razširjenost med seboj zelo podobnih sevov vrste P. rubescens.
Bibliografsko gradivo je bilo uspešno dodano na polico.
Dodajanje bibliografskega gradiva na polico ni uspelo.
Gradivo je že na polici.
Trajna povezava
URL:
Faktor vpliva
Dostop do baze podatkov JCR je dovoljen samo uporabnikom iz Slovenije. Vaš trenutni IP-naslov ni na seznamu dovoljenih za dostop, zato je potrebna avtentikacija z ustreznim računom AAI.
Leto
Faktor vpliva
Izdaja
Kategorija
Razvrstitev
JCR
SNIP
JCR
SNIP
JCR
SNIP
JCR
SNIP
Izberite knjižnično izkaznico:
Baze podatkov,
v katerih je revija indeksirana
Ime baze podatkov
Področje
Leto
Povezave do osebnih bibliografij avtorjev
Povezave do podatkov o raziskovalcih v sistemu SICRIS
Storitev za pridobivanje naslova trenutno ni dostopna, prosimo, poskusite še enkrat.
S klikom na gumb "V redu" boste potrdili zgoraj izbrano prevzemno mesto in dokončali postopek rezervacije.
S klikom na gumb "V redu" boste potrdili zgoraj izbrano prevzemno mesto in naslov za dostavo ter dokončali postopek rezervacije.
S klikom na gumb "V redu" boste potrdili zgoraj izbrani naslov za dostavo in dokončali postopek rezervacije.
Obvestilo
Trenutno je storitev za avtomatsko prijavo in rezervacijo nedostopna. Gradivo lahko rezervirate sami na portalu Biblos ali ponovno poskusite tukaj kasneje.
Citiranje
Funkcionalnost trenutno ni na voljo. Prosimo, poskusite kasneje.
