A União Europeia (UE), através da sua iniciativa Natura 2000, estabeleceu a classificação e seleção de áreas protegidas na Europa, a fim de assegurar a conservação da biodiversidade. No entanto, não há parâmetros claros e uniformes para permitir que os países membros tomem as melhores decisões de zoneamento para a conservação da biodiversidade. Por esta razão, uma metodologia baseada na avaliação de critérios de importância para a conservação da biodiversidade é apresentada nesta tese. A metodologia introduzida visa estabelecer critérios relevantes que podem ser analisados através do método estatístico de análise multicritério e interpolação de dados com o método geoestatístico de krigagem. O objetivo é verificar a adequação das áreas designadas para a rede Natura 2000 em Castilla y León, Espanha, e desenvolver uma proposta de zoneamento baseada em valores de importância da biodiversidade quando considerando o uso da terra. A metodologia proposta foi realizada com critérios básicos de conservação da biodiversidade que podem ser adaptados e aplicados em diferentes países membros da UE, contribuindo para uma seleção ótima de áreas protegidas com parâmetros claros e uniformes para o zoneamento.