Cilj: Odrediti haploskupinsku osnovu “non-consensus” kratkih udvojenih sljedova (engl., short tandem repeat, STR) alela DYS458.2 na kromosomu Y i procijeniti njihov filogenetski podustroj i učestalost u reprezentativnim uzorcima sa Srednjega Istoka, Europe i Pakistana. Postupci: Molekularna karakterizacija povezanosti i konstrukcija haplotipova provedena je kombinacijom dvaju pristupa – analizom binarnog polimorfizma koji definira haploskupinu kromosoma Y i analizom do 37 lokusa STR, uključujući i DYS388. Za utvrđivanje povezanosti kromosoma Y koji sadrže slijed DYS458.2, rabljeno je sekvencioniranje DNA lokusa DYS458 i mrežna analiza udaljenosti od medijana. Rezultati Pokazali smo da je novi alel DYS458.2 nastao nezavisno na najmanje dvije osnove binarnih haploskupina, a možda i na trećoj. U svim haploskupinama kromosoma J1 koje su pregledane, uključivši i njegove poznate a malobrojne pod-haploskupine, nađen je fiksan dužinski uzorak parcijalnoga alela. U alternativnom M405 povezanom s R1b3 definiranoj pod-haploskupini nađene su i DYS458.0 i DYS458.2 alelne klase. Pojedinačni kromosom također se mogao svrstati u R1b3-M269*(xM405) klasu. Fizički smještaj djelomične nsercije/delecije u normalnom slijedu tetramera jasno se razlikovao u kontekstu svake haploskupine. Zaključak: Iako neobični aleli DYS458.2 pružaju korisne informacije, prilikom zaključivanja o haploskupinskoj osnovi i uobičajenom nasljeđivanju potrebne su dodatne informacije o drugim vezanim polimorfnim lokusima.