Several species of the genus Fusarium can cause apple fruit to rot while stored. Since Fusarium taxonomy is very complex and has constantly been revised and updated over the last years, the aim of this study was to identify Fusarium species from rotten apples, based on combined morphological characteristics and molecular data. We identified 32 Fusarium isolates from rotten apple fruit of cultivars Golden Delicious, Jonagold, Idared, and Pink Lady, stored in Ultra Low Oxygen (ULO) conditions. Fusarium rot was detected in 9.4 % to 33.2 % of naturally infected apples, depending on the cultivar. The symptoms were similar in all four cultivars: a soft circular brown necrosis of different extent, with or without visible sporulation. Fusarium species were identified by the morphology of cultures grown on potato-dextrose agar (PDA) and carnation leaf agar (CLA). Twenty one isolates were identified as Fusarium avenaceum and confirmed as such with polymerase chain reaction (PCR) using specific primer pair FA-ITSF and FA-ITSR. F. pseudograminearum,F. semitectum, F. crookwellense, and F. compactum were identified by morphological characteristics. F.avenaceum can produce several mycotoxins and its dominance in Fusarium rot points to the risk of mycotoxin contamination of apple fruit juices and other products for human consumption. Pathogenicity tests showed typical symptoms of Fusarium rot in most of the inoculated wounded apple fruits. In this respect Fusarium avenaceum, as the dominant cause of Fusarium rot in stored apple fruits is a typical wound parasite. Fuzarijsku trulež ploda jabuke može uzrokovati veći broj vrsta roda Fusarium. Budući da je taksonomija roda Fusarium vrlo kompleksna te je podložna neprestanim promjenama posljednjih godina, cilj ovog rada bio je identificirati vrste roda Fusarium, izolirane sa zaraženih plodova jabuke na temelju morfoloških karakteristika i molekularnih analiza. Skupljena su ukupno 32 izolata roda Fusarium sa zaraženih plodova jabuke kultivara Golden Delicious, Jonagold, Idared i Pink Lady, nakon skladištenja u ULO („Ultra Low Oxygen“) uvjetima. Fuzarijska je trulež zabilježena na 9,4 % do 33,2 % plodova zahvaćenih skladišnim bolestima. Simptomi fuzarijske truleži bili su slični kod sva četiri kultivara, a javljali su se u obliku smeđe, mekane nekroze koja se postepeno širi, uz pojavu ili bez pojave vidljive sporulacije na površini ploda. Vrste su identificirane na temelju morfoloških karakteristika na krumpirsko-dekstroznom agaru (KDA) i agaru s listićem karanfila (LKA). Ukupno je 21 izolat determiniran kao vrsta Fusarium avenaceum, što je potvrđeno i lančanom reakcijom polimerazom (PCR) uz uporabu specifičnog para početnica FA-ITSF i FA-ITSR. Vrste F.pseudograminearum, F. semitectum, F. crookwellense i F. compactum identificirane su na temelju morfologije. Istraživanjem je utvrđeno da je F. avenaceum, vrsta koja je potencijalni proizvođač nekoliko mikotoksina, dominantan uzročnik fuzarijske truleži ploda jabuke nakon skladištenja. Visok postotak zaraze fuzarijskom truleži može izazvati kontaminaciju sokova jabuke i ostalih proizvoda mikotoksinima, sekundarnim metabolitima vrsta Fusarium štetnih za ljudsko zdravlje. Testovi patogenosti pokazali su da većina izolata uzrokuje pojavu tipičnih simptoma fuzarijske truleži nakon inokulacije na oštećeni plod. Navedeno upućuje na činjenicu da je F. avenaceum, kao dominantan uzročnik fuzarijske truleži ploda jabuke tipičan parazit rana