-
Razvoj in karakterizacija funkcijskih markerjev za genetske študije oljke (Olea europaea L.) : doktorska disertacija ; Development and characterisation of functional markers for genetic studies of olive (Olea europaea L.) : doctoral dissertationBaruca Arbeiter, AlenkaRazvili smo nov set genskih mikrosatelitskih markerjev za genetske študije oljke (Olea europaea L.). Za identifikacijo mikrosatelitov smo pregledali 98.924 zaporedij EST razvijajočega plodu oljke. V ... 923 zaporedjih EST, ki so vsebovala mikrosatelite, smo odkrili skupno 984 mikrosatelitov, med katerimi so prevladovali dinukleotidi in sledili so jim trinukleotidi. Med dinukleotidi je prevladoval mikrosatelitski motiv GA in med trinukleotidi motiv GAA. Za izdelavo začetnih oligonukleotidov smo izbrali 110 anotiranih zaporedij EST-SSR, izmed katerih je bilo 46 polimorfnih. S sekvenčno reakcijo in poravnavo alelov EST-SSR oljke smo potrdili pomnoževanje predvidenih mikrosatelitskih motivov in odkrili visoko stopnjo ohranjenosti robnih območij analiziranih mikrosatelitskih lokusov. Sposobnost genskih markerjev SSR za odkrivanje genetske raznolikosti je primerljiva s predhodno razvitimi genomskimi mikrosateliti. Povprečno število alelov na lokus je bilo 4,5, vrednosti dejanske in pričakovane heterozigotnosti ter informacijska vrednost polimorfizma pa so znašale 0,649, 0,604 in 0,539. Na podlagi rezultatov genotipizacije z markerji EST-SSR oz. SSR in na osnovi Jaccardovih koeficientov podobnosti se je jasno razlikovalo vseh 24 oljčnih sort. Genetska raznolikost znotraj sort "Ascolana tenera" in "Santa Caterina" se je jasno pokazala le z genomskimi mikrosateliti. Za analizo starševstva smo uporabili 7 visoko polimorfnih markerjev EST-SSR. Izvedba starševskega testa s tremi različnimi računalniškimi programi (FAMOZ, CERVUS, PARENTE) je pokazala, da je "Istrska belica" navzkrižno kompatibilna z različnimi oljčnimi sortami. Vrednosti indeksa samonekompatibilnosti med 0,2 in 1,0 so "Istrsko belico" uvrstile med delno samonekompatibilne sorte.Type of material - dissertation ; adult, seriousPublication and manufacture - Ljubljana : [A. Baruca Arbeiter], 2017Language - slovenianCOBISS.SI-ID - 18040409
Link(s):
Digitalna knjižnica Slovenije - dLib.siDostop z namenskih računalnikov v prostorih NUK
Repository of the University of Ljubljana – RUL
Author
Baruca Arbeiter, Alenka
Other authors
Bandelj, Dunja
Topics
Olea europaea L. |
oljka |
markerji EST-SSR |
anotacija |
polimorfizem |
genetska raznolikost |
starševski test |
Olea europaea L. |
olive |
EST-SSR markers |
annotation |
polymorphism |
genetic diversity |
paternity test
Reserve material at the desired pickup location.
Pickup location |
Material status | Reservation |
---|---|---|
BF, Central Biotechnical Library, Lj. |
available - outside loan, loan period: 30 days
|
Call number – location, accession no. ... |
Copy status |
---|---|
Skladišče DR II 0000009938 IN: 02017057938 Skladišče DR II 9938 IN: 02017057938 |
available - outside loan, loan period: 30 days
|
Shelf entry
Permalink
- URL:
Impact factor
Access to the JCR database is permitted only to users from Slovenia. Your current IP address is not on the list of IP addresses with access permission, and authentication with the relevant AAI accout is required.
Year | Impact factor | Edition | Category | Classification | ||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
JCR | SNIP | JCR | SNIP | JCR | SNIP | JCR | SNIP |
Select the library membership card:
DRS, in which the journal is indexed
Database name | Field | Year |
---|
Links to authors' personal bibliographies | Links to information on researchers in the SICRIS system |
---|---|
Baruca Arbeiter, Alenka | 32571 |
Bandelj, Dunja | 20038 |
Select pickup location:
Material pickup by post
Notification
Subject headings in COBISS General List of Subject Headings
Select pickup location
Pickup location | Material status | Reservation |
---|
Please wait a moment.
Izposojeno gradivo lahko kadarkoli vrnete tudi v nabiralnik pred knjižnico.