Razvoj računalniškega grafičnega vmesnika v programu PyMOL za strukturno in na osnovi-liganda podprto načrtovanje zdravil = Development of a computer graphical interface within the PyMOL programme for structure and ligand-based drug design : enoviti magistrski študij farmacija : Uniform Master's Programme Pharmacy
Jurić, Vito
Vtičniki za in silico razvoj zdravil LiSiCA GUI, ProBiS H2O in ProBiS H2O MD so vtičniki za program PyMOL. PyMOL je eno najbolj razširjenih orodij za 3D molekularno vizualizacijo. Z zadnjimi ...nadgradnjami programa PyMOL so se spremenile zahteve za vtičnike, kot so sprememba zahtevanega programskega jezika iz Python 2 v Python 3 in sprememba osnove za grafični uporabniški vmesnik iz Tcl/Tk v PyQt. Te spremembe v zahtevah pomenijo, da vtičnikov LiSiCA GUI, ProBiS H2O in ProBiS H2O MD ni več mogoče zagnati in uporabljati. Odločili smo se, da jih prepišemo v skladu z zahtevami programa PyMOL in jim dodamo nove funkcije, kjer je to smiselno. Z LiSiCA GUI vtičnikom se tako lahko spet izvaja in silico 2D in 3D rešetanje na podlagi Tanimotovega indeksa; z vtičnikom ProBiS H2O je ponovno omogočena analiza ohranjenih vod na strukturi analiziranega proteina glede na strukture podobnih proteinov; z vtičnikom ProBiS H2O MD pa je usposobljena analiza ohranjenih vod na strukturi analiziranega proteina glede na spreminjane 3D strukture tekom trajektorije, dobljene z molekulsko dinamiko tega proteina. Za poenotenje vtičnikov LiSiCA GUI, ProBiS H2O in ProBiS H2O MD smo razvili tudi nov vtičnik InsilabGUI, ki vsebuje te vtičnike, kar olajša in poenostavi njihovo namestitev in medsebojno uporabo za in silico razvoj.
Type of material - master's thesis
; adult, serious
Publication and manufacture - Ljubljana : [V. Jurić], 2021
Knjižnica emšf 0000000000 JURIĆ VITO Razvoj 0000001020 IN: 0017134
Knjižnica emšf 0 JURIĆ VITO Razvoj 1020 IN: 0017134
available - reading room
Shelf entry
Adding material to shelf was successful.
Adding material to shelf failed.
It was not necessary to add the material to the shelf.
Bibliographic material was successfully added on shelf.
Adding bibliographical material on shelf was not successful.
Material is already on the shelf.
Permalink
URL:
Impact factor
Access to the JCR database is permitted only to users from Slovenia. Your current IP address is not on the list of IP addresses with access permission, and authentication with the relevant AAI accout is required.
Year
Impact factor
Edition
Category
Classification
JCR
SNIP
JCR
SNIP
JCR
SNIP
JCR
SNIP
Select the library membership card:
DRS,
in which the journal is indexed
Database name
Field
Year
Links to authors' personal bibliographies
Links to information on researchers in the SICRIS system
Subject headings in COBISS General List of Subject Headings
Select pickup location
The material from the parent unit is free. If the material is delivered to the pickup location from another unit, the library may charge you for this service.
