In order to investigate further the interest of using the Chilean gene pool in potato breeding programmes, the genetic diversity and population structure of a collection of Solanum tuberosum L. ...genotypes including 350 worldwide varieties or breeders' lines (referred to as the modern group) and 30 Chiloé Island landraces were examined using simple sequence repeat markers. The close genetic proximity of the Chiloé Island landraces to the modern group was confirmed using several structure analysis methods: principal coordinate analysis; hierarchical clustering analysis; analysis of molecular variance; Bayesian model-based clustering analysis. The latter analysis, in particular, revealed no clear genetic structure between the modern group and the Chiloé Island landraces. The Chiloé Island germplasm appears to represent an interesting gene pool that could be exploited in potato breeding programmes using an association mapping approach.
BrACySol BRC conserves 12,000 accessions of Solanum tuberosum and related species. The preservation of these clones is essential for research on this species. To secure the long-term preservation of ...certain of these clones, we have opted for apex cryopreservation and the droplet vitrification method using the Plant Vitrification solution 2 (PVS2). Regarding Solanum tuberosum, we have obtained satisfactory results with an average regeneration rate of 89%. This rate allows us to use this method routinely for this species. Regarding the related species, the rate can vary according to certain genotypes within the same species. Nonetheless, this method has allowed us to validate the cryopreservation of clones belonging to 21 of the 23 species tested.
Le CRB BrACySol conserve 12 000 accessions de Solanum tuberosum et espèces apparentées. La préservation de ces clones est essentielle pour la recherche sur cette espèce. Pour sécuriser, à long terme, la conservation de certains de ces clones, nous avons opté pour la cryoconservation d’apex. Nous avons choisi la méthode de vitrification en goutte en utilisant la solution PVS2 (Plant Vitrification solution 2). Pour Solanum tuberosum, nous avons obtenu des résultats satisfaisants avec un taux de régénération moyen de 89 %. Ce taux nous permet d’utiliser cette méthode en routine pour cette espèce. Pour les espèces apparentées, le taux peut varier, selon les génotypes, au sein d’une même espèce. Mais cette méthode nous a permis de valider la cryoconservation de clones appartenant à 21 des 23 espèces testées.
Sub-project 5 of BIOEXPLOIT aims to design durable disease resistance through marker-assisted breeding by converting existing markers for high-throughput application, developing and validating ...high-throughput marker technologies and pyramiding major R genes and/or quantitative trait loci into elite material. Activities include (1) the fine mapping of the quantitative trait locus PiXspg which accounts for a large proportion of the variation in late blight resistance, (2) converting SNP-based markers and an AFLP marker to easy-to-use-markers, (3) testing of progenies with combined sources of late blight resistance for presence of R genes and agronomic features, (4) backcrossing new sources of resistance to S. tuberosum and molecular screening of breeding materials with marker GP94 linked with gene Rpi-phu1 conferring late blight resistance, (5) evaluating potato clones with enhanced resistance against Phytophthora infestans under field conditions of Toluca (México), and (6) developing populations and marker-assisted breeding for disease resistance.
The fruit, vegetable and potato (FLP) sectors are characterised by a high structural diversity linked to the many species and varieties cultivated and to very varied production and marketing ...structures. The very strong competition imposed by the long distribution and import-export channels has gradually led, for reasons of economic rationality, to a specialisation of the production basins and part of the farms with standardisation of production means and products, but also the disappearance of many small farms. Overall, these changes have resulted in an erosion of surfaces and a decrease in the volumes produced for the majority of sectors with the exception of potatoes and certain nuts. Nevertheless, the dynamism of certain "product" sectors has led to a revival of competitiveness and/or a better Plénet D. et al. 80 Innovations Agronomiques 68 (2018), 79-105 development of the offer thanks to approaches relating to the development of high-tech systems, the reduction in the use of synthetic products, segmentation and commercial differentiation, and the creation of quality signs. In addition, the renewal of short and local circuits has recently made it possible to develop a very diversified network of farms in all regions. The emergence of high expectations for organic farming products and for healthy and sustainable agro-food systems offers new opportunities today. To benefit from them, the FLP sectors will have to develop coherent strategies to strengthen complementarities and synergies between different production, processing and marketing systems. These diversity enhancement strategies will contribute to increasing the economic and environmentalrobustness of the FLP sectors.
Les filières fruits, légumes et pomme de terre (FLP) se caractérisent par une diversité structurelle importante liée aux nombreuses espèces et variétés cultivées et à des structures de production et de commercialisation très variées. La très forte concurrence imposée par les circuits longs de la grande distribution et de l’import-export a progressivement entrainé pour des raisons de rationalité économique une spécialisation des bassins de production et d’une partie des exploitations avec une standardisation des moyens de production et des produits, mais aussi la disparition de nombreuses petites exploitations. Globalement, ces évolutions se sont traduites par une érosion des surfaces et une diminution des volumes produits pour la majorité des filières à l’exception de la pomme de terre et de certains fruits à coque. Néanmoins, le dynamisme de certaines filières « produit » a entrainé un regain de compétitivité et/ou une meilleure valorisation de l’offre grâce à des démarches portant sur le développement de systèmes à haute technicité, la réduction d’utilisation des produits de synthèse, la segmentation et la différenciation commerciale, et la création de signes de qualité. Par ailleurs, le renouveau des circuits courts et de proximité permet depuis peu de développer dans toutes les régions un tissu d’exploitations très diversifiées. L’émergence d’une forte attente pour les produits de l’agriculture biologique et pour des systèmes agro-alimentaires sains et durables offre aujourd’hui de nouvelles opportunités. Pour en bénéficier, les filières FLP devront élaborer des stratégies cohérentes afin de renforcer les complémentarités et les synergies entre différents systèmes de production, de transformation et de commercialisation. Ces stratégies de valorisation de la diversité contribueront à accroitre la robustesse économique et environnementale des filières FLP.
Developing a core collection consists in selecting, in a more or less large collection, a small panel of genotypes representing the genetic diversity available in the initial collection, with minimum ...redundancy. This study presents the development of a core collection of 48 genotypes representative of the genetic diversity of a panel of 350 tetraploid varieties of potato (Solanum tuberosum L.). It was built using microsatellite marker genotyping data (SSR) and M strategy which maximizes allelic diversity. This core collection forms a panel of major interest that has been exploited up till now in the framework of two research projects: on the one hand to assess the possibility of exploiting the SNP SolCAP array to characterize the genetic resources maintained in BRC BrACySol, and on the other hand, to assess the structural and morphological variability of potato starch grains.
Le développement d’une core collection consiste à sélectionner, au sein d’une collection ayant un effectif plus ou moins important, un petit panel de génotypes qui représente la diversité génétique disponible dans la collection de départ, avec un minimum de redondance. Cette étude présente le développement d’une core collection de 48 génotypes, représentative de la diversité génétique d’un panel de 350 variétés tétraploïdes de pomme de terre (Solanum tuberosum L.). Elle a été établie en utilisant des données de génotypage par marqueurs microsatellites (SSR) et la stratégie M qui maximise la diversité allélique. Cette core collection constitue un panel d’un grand intérêt qui a été exploité jusqu’à présent dans le cadre de deux projets de recherche : d’une part, pour évaluer la possibilité d’exploiter la puce SNP SolCAP pour caractériser les ressources génétiques maintenues au sein du CRB BrACySol, et, d’autre part, pour évaluer la variabilité structurale et morphologique des grains d’amidon de pomme de terre
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