Provider: - Institution: - Data provided by Europeana Collections- Bibliogr. poz. 1-114- Obejmuje też publikacje w jezyku angielskim- Bibliogr. poz. 1-114- Obejmuje też publikacje w jezyku ...angielskim- All metadata published by Europeana are available free of restriction under the Creative Commons CC0 1.0 Universal Public Domain Dedication. However, Europeana requests that you actively acknowledge and give attribution to all metadata sources including Europeana
Amaç: BK virus (BKV) ile ilişkili hemorajik sistit (HS), hematopoetik kök hücre transplantasyonu (HKHT) yapılan hastalarda yaygın görülen bir komplikasyondur. Bu çalışmanın amacı, HKHT yapılan çocuk ...hastalarda BKV enfeksiyonu insidansının araştırılmasıdır. Gereç ve Yöntemler: Çalışmaya Ekim 2015 ile Eylül 2017 tarihleri arasında izlenen, yaşları 16 ay ile 16 yıl arasında olan toplam 51 hasta dahil edilmiştir. Hastalar BKV DNA'nın idrar ve kanda tespiti için kantitatif gerçek-zamanlı polimeraz zincir reaksiyonu (Anaolia Geneworks, Türkiye) testiyle monitörize edilmiştir. Bulgular: Hastaların 46'sına allojenik HKHT ve 5'ine otolog HKHT yapılmıştır. Allojenik nakil yapılan 46 hastanın 26'sında (%56,5) ve otolog nakil yapılan 5 hastanın 1'inde (%20,0) olmak üzere toplam 27 (%52,9) hastanın idrar ve/veya kanında BKV DNA pozitifliği saptanmıştır. Allojenik HKHT yapılan 46 hastanın 12 (%26,1)'sinde preemptif tedavi için gereken idrarda >107 kopya/ml BKV viral yük düzeyi tespit edilmiştir. Preemptif tedavi uygulanan 12 hastanın 9'unda (%75,0) HS gelişmesi önlenirken 3'ünde (%25,0) HS gelişmiş ve tedaviyle iyileşmiştir. HS gelişmeden önceki iki hafta içinde BKV virurisi >109 kopya/ml olarak tespit edilmiş ve HS prediktif tanısı için prognostik bir gösterge olarak kabul edilmiştir. BKV viremisi 1 hastada sistit gelişmesinden önceki iki hafta içinde >104 kopya/ml olarak tespit edilmiştir. Sonuç: Yüksek riskli hastalarda HS prediktif tanısı için BKV enfeksiyonu, özellikle HKHT hastalarında BKV virüri taraması önerilir.
Amaç: Bu çalışmanın amacı yakınmaları ve fizik muayene bulgularının değerlendirilmesi sonrasında koronavirüs hastalığı 2019 (coronavirus disease 2019, COVID-19) ön tanısı konulan hastaların erken ...dönemde çekilen akciğer bilgisayarlı tomografi (BT) bulguları ile polimeraz zincir reaksiyonu (polymerase chain reaction, PCR) testi sonuçları arasındaki uyumluluğun araştırılmasıdır. Gereç ve Yöntemler: Nisan ile Temmuz 2020 tarihleri arasında COVID-19 şüphesi olan, PCR testi ile şiddetli akut solunum yolu sendromu koronavirüsü 2 (severe acute respiratory syndrome coronavirus 2, SARS-CoV-2) varlığı açısından değerlendirilen ve ilk 48 saatte akciğer BT yapılan 114 hasta geriye dönük olarak bu çalışmaya alındı. PCR testi pozitif ve negatif olan hastaların demografik özellikleri, laboratuvar parametreleri ve akciğer BT bulguları karşılaştırıldı. PCR testi negatif saptanıp klinik şüphesi devam eden hastalarda 48 saatlik aralıklar ile yeni PCR örnekleri alındı. Bulgular: PCR pozitif hastalarda interlobüler septal kalınlaşma daha fazla bulundu (p=0,043). PCR pozitif olan 16 (%28,6) ve PCR negatif olan 14 (%24,1) hastada tomografide anlamlı bir bulgu saptanmadı. Her iki grupta da en sık bulgular; bilateral, periferal ve multilober yerleşimli buzlu cam görünümü, konsolidasyon ve interlobuler septal kalınlaşma idi. PCR pozitif olan grupta nötrofil (p
Özet: Bu çalışmada tavuklardan Escherichia coli izolasyonu ve izolatlarda virulens faktörlerinden eaeA geninin Polimeraz Zincir
Reaksiyonu ile saptanması amaçlandı. Tavukların iç organlarından kanlı ...ağara ekim yapılarak şüpheli kolonilere uygulanan bazı
biyokimyasal testler neticesinde numunelerin % 48 (48/100)'inde E. colispp. izolasyonu yapıldı. İzolatlardan ekstrakte edilen DNA'lar
E. coli'de tespit edilen eaeA geni (virulence geni)'nden türetilen bir çift primer kullanılarak PZR'de amplifikasyona tabii tutuldu. PZR
ürünlerinin agarozjelde değerlendirilmesi neticesinde % 48 (48/100)'inde bu virulens geninin mevcut olduğu belirlendi.
Abstract: The aim of this study was to isolate Escherichia coli from chickens and to determine the presence of the eaeA gene, a
virulence factor detected in E. coli, in the isolates by polymerase chain reaction (PCR). Different chicken organs were inoculated onto
blood agar and biochemical tests were performed on the suspicious isolates. E. coli was isolated from 48% (48/100) of the samples.
DNA was extracted from these isolates and was amplified by PCR, using a pair of primers derived from the eaeA (virulence) gene.
In the agarose gel examination of PCR products, 48% (48/100) of the isolates were determined to have this virulence factor.
Bu çalışmada Elazığ'daki bir mezbahada kesilen toplam 8222 sığır akciğeri incelendi ve bu akciğerlerin 500 (% 6)'ünde pnömoni saptandı. Beşyüz akciğer örneğinin % 7 koyun kanlı ağarda 24-48 saatlik ...kültürü sonucunda, 36 (% 7,2) Staphylococcus aureus, 30 (% 6) Pastevrella multocida, 30 (% 6) Corynebacterium spp, 29 (% 5,8) Maya, 19 (% 3,8) Streptococcus spp, 18 (% 3,ö) Staphylococcus epidermidis, 13 (% 2,6) Escherichia mil, 11 (% 2,2) Bacillus spp, 10. (% 2) Pseudomonas spp, 9 (% 1,8) Mannheimia haemolytica, 8 (% l ,6) Actinobadllus spp, 6 (% 1,2) Klebsiella spp, 1 (% 0,2) Moraxella spp, l (% 0,2) Proteus spp ve 90 (% 18) miks olmak üzere toplam 311 (% 62,2) bakteri izole ve identifiye edildi. Şüpheli P. muitocida suşlarının 24 (% 80)'ünde fare inokulasyon testi ile pozitif sonuç alındı. Kültür pozitif P. multocida ve M. haemolytica suşlarının tümünün PZR ile de pozitif olduğu bulundu. Ayrıca, toxA geninden hazırlanan primerlerin kullanılmasrile yapılan PZR ile toksyenik P. multocida suşlarının varlığı araştırıldı ve P. multocida suşlarının hiçbirinin toksyenik olmadığı tespit edildi.
Lungs from 8222 cattle slaughtered at an abattoir in Elazığ were examined macroscopically, and pneumonia was detected in 500 (6.1%) lungs. These samples, were inoculated onto blood agar supplemented with 7% sheep blood for isolation of bacterial agents. A polymerase chain reaction (PCR) based upon the use of species-specific primers was carried out on DNA samples extracted from suspected Pasteurella spp. isolates. In addition, a mouse inoculation test was carried out on suspected Pasteurella multocida isolates. A total of 311 (62.2%) bacterial agents were isolated from the lung samples and were identified as 7.2% Staphylococcus aureus, 6% Pasteurella multocida, 6% Corynebacterium spp., 5.8% yeast, 3.8% Streptococcus spp, 3.6% Staphylococcus epidermidis, 2.6% Escherichia coll, 2.2% Bacillus spp., 2% Pseudomonas spp., 1.8% Mannheimia haemolytica, 1.6% Actinobadllus spp., 1.2% Klebsiella spp., 0.2% Moraxella spp., 0.2% Proteus spp., and 18% mixed bacteria.Twenty-four (80%) of the Pasteurella multocida isolates were positive in the mouse inoculation test in cattle. All P. multocida and M. haemolytica strains that were positive by culture were also found to be positive by PCR* However, toxigenic Pasteurella multocida was not detected in any isolates by PCR using primers derived from the toxA gene.
Bu çalışmada Pasteurella'ların ve diğer aerobik bakteriyel etkenlerin koyun ve keçilerin pnömonili akciğer örneklerinden izolasyonu ve izole Pasteurella multocida ve Mannheimia haemolytica'mn kültür ...yöntemi ve polimeraz zincir reaksiyonu (PZR) ile identifikasyonu amaçlandı. Ayrıca şüpheli P. multocida izolatlarına fare patojenite testi yapıldı. Akciğer örneklerinin % 7 koyun kanlı ağarda 24-48 saatlik kültürü sonucunda, 350 koyun akciğerinden 15 (96 4,3) P. multocida ve 8 (96 2,3) M. haemolytica izole ve identifiye edildi. Keçilerden toplanan 150 akciğer örneğinden ise 1 (96 0,7) P. multocida ve 6 (96 4,0) M. haemolytica izole ve identifiye edildi. Akciğerlerden P. multocida ve M. haemolytica'nm izolasyon oranlarının karşılaştırılması sonucunda farkın istatistiksel olarak önemli olmadığı belirlendi (koyunlarda P = 0,2 ve keçilerde P = 0,12).
Fare patojenite testi ile koyunlarda 15 P. multocida izolatından 13 (96 86,7)'ü ve keçilerde ise izole edilen bir P. multocida izolatı pozitif bulundu.
P. multocida ve M. haemolytica izolatlarının tümünün PZR ile de pozitif olduğu saptandı. Bununla birlikte, toxA geninden hazırlanan primerlerin kullanılması ile yapılan PZR ile P. multocida izolatlarının hiçbirinde pozitif sonuç elde edilemedi.
Sonuç olarak bu çalışma, P. multocida ve M. haemolytica'nm doğru ve çabuk identifikasyonu için PZR'nin uygulanabilirliğini ortaya koymuştur.
The purpose of this study was to isolate Pasteurella spp and other aerobic bacterial agents from the lungs of sheep and goats with pneumonia and to identify Pasteurella multocida and Mannheimia haemolytica by both culture methods and polymerase chain reaction (PCR). In addition, mouse pathogenecity tests were carried out on suspected P. multocida isolates. In the examination of lung samples collected from sheep, 15 (4.3%) P. multocida and 8 (2.3%) M. haemolytica strains were isolated and identified. The numbers of species identified in the goat samples were 1 (0.7%) for P. multocida and 6 (4%) for M. haemolytica. The differences between the numbers of P. multocida and M. haemolytica strains isolated from the sheep and goat lung samples were not statistically significant (P = 0.2 in sheep and P = 0.12 in goats).
Thirteen (86.7%) P. multocida isolates were positive in the mouse pathogenecity test in sheep. One P. multocida isolate from goats was also positive- in the mouse pathogenecity test. .
All P. multocida and M. haemolytica strains that tested positive by culture also tested positive by PCR. However, no toxigenic P. multocida were detected in any isolates by PCR using primers derived from the toxA gene.
In conclusion, this study showed the feasibilty of PCR for the accurate and rapid identification of P. multocida and M. haemolytica.
Amaç: Servikal İntraepitelyal neoplazi tanısı konulan hastaların serviks biopsilerinde PCR yöntemi ile HPV 16 ve 18 suşlarının ve bölgemizde hangisinin daha fazla servikal İntraepitelyal neoplazi ...etkeni olduğunun araştırılması. Çalışmanın Yapıldığı Yer: Fırat üniversitesi Tıp Fakültesi Kadın Hastalıkları ve Doğum ABD, Devlet Hastanesi Kadın Doğum Bölümü, Elazığ. Materyal ve Metod: Aralık 1997-Ekim 2001 tarihleri arasında Fırat üniversitesi tıp fakültesi araştırma hastanesi ve Elazığ devlet hastanesi kadın doğum bölümüne başvuran hastalardan servikal smear sonucu class 3 gelen hastalara kolposkopiyi takiben şüpheli alanlardan biopsi alındı. Servikal biopsi örneklerinde histopatolojik olarak servikal İntraepitelyal neoplazi tanısı konulan vakalardan 40 vaka ile (Gl= Servikal İntraepitelyal neoplazi=Çalışma), total abdominal histerektomi materyallerinde normal servikal bulgu tanısı konulan 40 vaka (G2=Normal serviks=Kontrol) prospektif çalışma programına alındı. Vakaların parafın bloğa gömülü serviks biopsi doku örneklerinden 5-10 $\mu$m kalınlığında 80 parafin blok örneği alındı. Bu örneklerde PCR yöntemi kullanılarak HPV 16 ve 18 suşlarının genomları araştırıldı. Nominal veriler için %2, ordinal veriler için Mann Whitney U testi kullanıldı. p<0.05 anlamlı kabul edildi. HPV 16 ve 18 genomları için Relatif risk (RR; %95 CI) hesaplandı. Bulgular: Servikal İntraepitelyal neoplazi vakalarında HPV 16 genomu 13 vakada (%33), HPV 18 genomu ise 2 vakada (%5), kontrol grubunda ise HPV 16 genomu 2 vakada (%5), HPV 18 genomu l vakada (%2.5) saptandı. HPV 16 genomu anlamlı olarak servikal İntraepitelyal neoplazi grubunda yüksek (p=0.003, x2 test), RR=6.5, (%95 CI=1.5-30) bulundu. HPV 18 genomu ise benzer (p>0.05, Fisher exact test), RR=2, (%95 CI=0.2-21) bulundu. Sonuç: Bölgemizdeki servikal İntraepitelyal neoplazi vakalarında HPV 16 suşu 6.5 kat daha fazla etkin rol oynamaktadır.
Objective: To investigate HPV 16 and HPV 18 sushes in the cervical biopsies of patients diagnosed as cervical intraepithelial neoplasia by using PCR method and to find out which of the two is a more frequent agent of cervical intraepithelial neoplasia in our region. Instution: Fırat University, School of Medicine, Obstetrics and Gynecology Department, State Hospital's Obstetrics Department, Elazığ. Material and Method: Of the patients who were admitted to the Fırat University School of Medicine research hospital and Elazığ State Hospital's Obstetrics department between December 1997 and October 2001, those who were class 3 according to cervical smear were examined by colposcope and after that, biopsies were taken from suspected sites. 40 cases who were diagnosed as cervical intraepithelial neoplasia after the histopathologic investigation of cervical biopsy samples (Gl= cervical intra-epithelial neoplasia = study group) and 40 cases who were diagnosed as having normal cervical findings in their total abdominal hysterectomy materials (G2= normal cervix = control group) were included in a prospective study program. 80 paraffin block samples of 5-10 $\um$m thickness were taken from the cases' cervix biopsy tissue samples embedded in paraffin block. The genomes of HPV 16 and HPV 18 sushes were investigated by using PCR method in these samples. X2 was used for nominal data and Mann Whitney U Test for ordinal data. P < 0.05 was regarded significant. Relative risk for HPV 16 and HPV 18 genomes were calculated (RR; 95% CI). Results: In the cervical intraepithelial neoplasia cases, HPV genome was found in 13 cases (33%) and HPV 18 genome in 2 cases (5%), while in the control group HPV 16 genome was identified in 2 cases (5%) and HPV 18 in 1 case (2.5%). HPV 16 genome was found to be significantly higher in cervical intraepithelial neoplasia cases (p = 0.003, x2 test) and RR was found equal to 6.5 (95% Cl = 1.5-30). HPV 18 genome was found similar and RR was equal to 2 (95% Cl = 0.2-21). Conclusion: HPV 16 genome plays a 6.5 times more effective role in cervical intraepithelial neoplasia cases in our region.
PDF
