Giriş: Hücre içi ve hücre dışı antijenlerin işlenmesiyle elde edilen peptitler, immün yanıtı uyarmak amacıyla T hücrelerine sunulur. Bu sunum major doku uygunluk kompleksi (MHC) molekülleri adı verilen peptit reseptörleri tarafından yapılır. İmmün yanıttaki rolleri benzer olan MHC moleküllerinin özellikle gen düzeyindeki düzenlenme mekanizmaları sınıfına göre belirgin farklar içermektedir. Amaç: Altıncı kromozomun kısa kolunda bulunan MHC genleri tarafından kodlanan MHC sınıf I ve sınıf II molekülleri, T hücresi yanıtını uyaran peptid reseptörleridir. Kaynaklandıkları antijenin tanınmasını sağlayacak olan bu peptitler, MHC moleküllerine yüklenir ve T hücrelerine sunulur. Peptitleri yükleme ve sunma ilkeleri her iki molekül için benzer olsa da, peptit kaynakları ve peptit yükleme mekanizmaları farklıdır. Ek olarak, MHC sınıf I molekülleri tüm çekirdekli hücrelerde ifade edilirken, sınıf II moleküller yalnızca Antijen Sunan Hücrelerde (ASH) ifade edilir. Tüm bu farklılıklar; MHC sınıf I'in MHC sınıf II ile tam olarak aynı transkripsiyonel mekanizmalarla ifade edilmediğini göstermektedir. Yazımızda her iki sınıfın gen ifadelerini karşılaştırıp benzerliklerin ve farklılıkların tartışılması amaçlanmıştır. Tartışma ve Sonuç: Bir çok hastalığın immünolojik temelini oluşturan MHC moleküllerinin transkripsiyonel mekanizmalarının daha iyi anlaşılması, bu moleküllerin hastalıklardaki rolünü daha net ortaya koyacaktır. Derlememizde mevcut bilgiler ışığında MHC genlerinin düzenlenmesi mekanizmalarını MHC sınıfına özgü bir şekilde ele alarak, bu konuda yapılacak olan sonraki araştırmalara katkıda bulunulması amaçlanmıştır.