Introdução: A presença de morcegos nas áreas urbanas é cada vez mais comum, gerando reclamações aos órgãos de controle de zoonoses. Método: foi efetuado levantamento das reclamações ao Centro de Controle de Zoonoses de Niterói, RJ, no período 2014-2015. Resultados: houve aumento na quantidade de reclamações entre 2014 e 2015. A região Praias da Baía teve o maior número de reclamações. Houve melhora no prazo entre a reclamação e a primeira tentativa de visita zoossanitária e entre a reclamação e a efetivação da primeira visita, mas esses ainda são excessivamente longos. Nas regiões mais próximas a visita zoossanitária foi mais rápida e na região mais distante, mais demorada. Apesar do relato de um caso em humano, a espoliação predominou nos animais. O principal motivo para reclamação foi a utilização do forro dos telhados como abrigo. Conclusão: A situação encontrada é preocupante pois acidentes envolvendo morcegos são graves e passíveis de transmissão de zoonoses.