U razdoblju od 2009-2012. godine, u Hrvatskom zavodu za javno zdravstvo testirana su 192 bolesnika u dobi od 1 do 18 godina na najčešće bakterijske uzročnike atipičnih pneumonija. Etiologija je potvrđena u 70 (36%) bolesnika. Kao najčešći uzročnik dokazana je Mycoplasma (M.) pneumoniae u 49/70% ispitanika. Ostali rjeđi uzročnici bili su Chlamydophila (C.) pneumoniae (11/16%) te Legionella spp. (7/10%). C. burnetii je nađena u 2/3% ispitanika, C. trachomatis u 1/1%, dok C. psittaci nije dokazana. M. pneumoniae je uzrokovala infekcije tijekom cijele godine, većinom u školske djece i adolescenata (45/92%). C. pneumoniae je sporadično bilježena tijekom cijele godine, a obolijevala su djeca svih dobnih skupina. Legionella spp. je uzrokovala infekcije u ljetnim i jesenskim mjesecima. Većina oboljelih (6/86%) bili su adolescenti.