UP - logo
VSE knjižnice (vzajemna bibliografsko-kataložna baza podatkov COBIB.SI)
PDF
  • Combined transcriptomics, proteomics and bioinformatics identify drug targets in spinal cord injury
    Tica, Jure ; Bradbury, Elizabeth J. ; Didangelos, Athanasios
    Težka poškodba hrbtenice povzroči ireverzibilno poškodbo tkiva in pogosto tudi ohromelost. Priznanih terapevtskih možnosti trenutno ni na voljo in zelo malo terapevtskih pristopov je trenutno v ... postopku raziskovanja. V tej študiji smo analizirali 4 transkriptomske in 4 proteomske skupine podatkov, zbrane 7 dni in 8 tednov po klinično-relevantni poškodbi hrbtenice, s ciljem identifikacije persistentno diferencialno izraženih beljakovin. Naša kombinirana analiza je ugotovila 40 povišano izraženih genov in 48 znižano izraženih genov. Izražanje teh genov je persistentno spremenjeno 7 dni in 8 tednov po poškodbi hrbtenice na nivoju mRNK-ja in beljakovine. S pomočjo bio-informacijske analize smo identificirali kemične spojine z aktivnostjo do teh diferencialno reguliranih genov. Določili smo tudi beljakovine z raziskano in neraziskano funkcijo v poškodbi hrbtenice. Rezultati so razkrili kopico prezrtih kandidatov za terapijo s pomembno bio-aktivnostjo, vzpostavljeno zmožnostjo terapije z zdravili in hkrati neraziskanimi funkcijami v poškodbi hrbtenice. Pri skupini teh kandidatov je zaznati povišane gene: purine nucleoside phosphorylase (PNP), cathepsins A, H, Z (CTSA, CTSH, CTSZ) in proteasome protease PSMB10; ter znižane gene: ATP citrate lyase (ACLY), malic enzyme (ME1) in sodium-potassium ATPase (ATP1A3). Predstavitev se osredotoča na -omics pristope, uporabljene pri izolaciji diferencialno reguliranih genov in identifikaciji neraziskanih terapevtskih pristopov. Prav tako se osredotoča na uporabljene algoritme podatkovnega rudarjenja in njihovem potencialu dopolnjevanja vseh področij biomedicinske znanosti.
    Vir: International journal of molecular sciences. - ISSN 1661-6596 (Vol. 19, no. 5, 2018, str. 1461-1-1461-19)
    Vrsta gradiva - članek, sestavni del
    Leto - 2018
    Jezik - angleški
    COBISS.SI-ID - 528002329