Résumé
La leptospirose est une zoonose cosmopolite causée par les bactéries du genre
Leptospira
. Si sa répartition est vaste sur le globe, le climat chaud et humide de la zone intertropicale est ...particulièrement propice à son expansion. Dans la plupart des départements et territoires français d’outremer, la leptospirose est considérée comme un problème de santé publique. En Guyane, département français situé au nord-est de la forêt amazonienne, elle est considérée comme rare. L’objectif de cette revue est de faire l’état des lieux des connaissances sur la leptospirose humaine et animale en Guyane française et dans les pays environnants. Une recherche exhaustive a été conduite, à travers la littérature médicale indexée et informelle en français, anglais, espagnol et portugais. Ainsi, respectivement dix et quatre publications ont pu être identifiées sur la leptospirose humaine et animale en Guyane, publiées entre 1940 et 1995, sous formes de cas cliniques ou de séries de cas. Les publications concernant cette maladie dans les autres pays du plateau des Guyanes, Venezuela oriental, Guyana, Suriname, et État brésilien de l’Amapá, étaient également rares voire inexistantes. En revanche, les données récentes du centre national de la leptospirose français ont montré une augmentation récente et brutale du nombre de cas dans le département, probablement en partie due à la mise en place d’outils diagnostiques tels que la sérologie IgM Elisa. Il est en fait probable que la leptospirose soit une maladie négligée dans la région, du fait de l’absence d’outils diagnostiques rapidement disponibles, de la méconnaissance des cliniciens de cette pathologie et de l’existence de nombreux autres pathogènes à présentation clinique similaire (paludisme, arboviroses, fièvre Q, toxoplasmose amazonienne). La mise en place d’études de plus grande ampleur sur la leptospirose animale et humaine est nécessaire et urgente pour connaître le véritable poids de cette maladie dans notre région.
Diagnosis and epidemiology of leptospirosis Picardeau, M.
Médecine et maladies infectieuses,
January 2013, 2013, 2013-Jan, 2013-1-00, 20130101, Letnik:
43, Številka:
1
Journal Article
Leptospirosis is a zoonosis found worldwide, the main reservoir of which is the rat. Human infection generally results from exposure to contaminated river or lake water or animals. Around 600 cases ...are diagnosed per year in France. Half of these cases occur in French overseas territories, where the incidence can be more than 100 times higher than in mainland France. Leptospirosis has been under-diagnosed because of non-specific symptoms, inadequate surveillance system, and lack of readily available quick and simple diagnostic tests. Most cases of leptospirosis are currently detected by PCR amplification of bacterial DNA from the blood during the first week after the onset of symptoms, or by detection of antibodies during the second week of the disease. More than 300 serovars have been identified among leptospires, including serovar Icterohaemorrhagiae, the most frequent in human infections. Leptospirosis remains a major public health issue in many developing countries, one century after discovering the causative agent. Leptospirosis is expected to become more important due to a rapid urbanization in developing countries (slums), global warming, and extreme climatic events (floods).
La leptospirose est une zoonose de répartition mondiale dont le rat constitue le principal réservoir. La leptospirose est généralement liée aux contacts avec l’eau douce ou les animaux. En France, quelques 600 cas annuels sont diagnostiqués, dont la moitié provient des départements et territoires d’Outre-Mer où l’incidence peut être 100 fois plus élevée qu’en Métropole. La leptospirose reste cependant sous-estimée du fait de l’absence de symptômes spécifiques, d’un système de surveillance défaillant et d’un manque de tests de diagnostic rapides et simples à réaliser. Le diagnostic s’effectue principalement par la détection de l’ADN bactérien dans le sang par PCR lors de la première semaine de la maladie ou par la recherche des anticorps à partir de la deuxième semaine. Plus de 300 sérovars sont retrouvés chez les leptospires, parmi lesquels le sérovar Icterohaemorrhagiae est l’un des plus fréquemment rencontrés en clinique humaine. Près d’un siècle après la découverte de l’agent causal de la leptospirose, cette zoonose reste un problème de santé publique majeur dans de nombreux pays en voie de développement, notamment à cause de l’urbanisation grandissante (bidonvilles), le réchauffement climatique et l’apparition plus fréquente de phénomènes climatiques extrêmes (inondations).
Leptospirosis is a worldwide zoonosis caused by pathogenic bacteria of the genus Leptospira, which also includes free-living saprophyte strains. Many aspects of leptospiral basic biology and ...virulence mechanisms remain unexplored mainly due to the lack of effective genetic tools available for these bacteria. Recently, the type II CRISPR/Cas system from Streptococcus pyogenes has been widely used as an efficient genome engineering tool in bacteria by inducing double-strand breaks (DSBs) in the desired genomic targets caused by an RNA-guided DNA endonuclease called Cas9, and the DSB repair associated machinery. In the present work, plasmids expressing heterologous S. pyogenes Cas9 in L. biflexa cells were generated, and the enzyme could be expressed with no apparent toxicity to leptospiral cells. However, L. biflexa cells were unable to repair RNA-guided Cas9-induced DSBs. Thus, we used a catalytically dead Cas9 (dCas9) to obtain gene silencing rather than disruption, in a strategy called CRISPR interference (CRISPRi). We demonstrated complete gene silencing in L. biflexa cells when both dCas9 and single-guide RNA (sgRNA) targeting the coding strand of the β-galactosidase gene were expressed simultaneously. Furthermore, when the system was applied for silencing the dnaK gene, no colonies were recovered, indicating that DnaK protein is essential in Leptospira. In addition, flagellar motor switch FliG gene silencing resulted in reduced bacterial motility. To the best of our knowledge, this is the first work applying the CRISPRi system in Leptospira and spirochetes in general, expanding the tools available for understanding leptospiral biology.
Leptospira interrogans sensu stricto is responsible for the most frequent and severe cases of human leptospirosis. The epidemiology and clinical features of leptospirosis are usually associated with ...the serovars and serogroups of LEPTOSPIRA: Because of the difficulties associated with serological identification of Leptospira strains, we evaluated a novel PCR-based method for typing L. interrogans serovars. Based upon the genome sequence of L. interrogans serovar Lai type strain 5660, 44 loci were analyzed by PCR for their variability in size due to the presence of variable-number tandem repeats (VNTR). Seven VNTR loci were found to be powerful markers for serovar identification, epidemiology, and phylogenetic studies of L. interrogans. This rapid and easy method should greatly contribute to a better knowledge of the epidemiology of LEPTOSPIRA:
Two gendarmes who participated in canyoning activities on 27 June 2011 on the Caribbean island of Martinique were diagnosed with leptospirosis using quantitative real-time polymerase chain reaction ...(qPCR), 9 and 12 days after the event. Among the 45 participants who were contacted, 41 returned a completed questionnaire, of whom eight met the outbreak case definition. The eight cases sought medical attention and were given antibiotics within the first week after fever onset. No severe manifestations of leptospirosis were reported. In seven of the eight cases, the infection was confirmed by qPCR. Three pathogenic Leptospira species, including L. kmetyi, were identified in four of the cases. None of the evaluated risk factors were statistically associated with having developed leptospirosis. Rapid diagnostic assays, such as qPCR, are particularly appropriate in this setting – sporting events with prolonged fresh-water exposure – for early diagnosis and to help formulate public health recommendations. Participants in such events should be made specifically aware of the risk of leptospirosis, particularly during periods of heavy rainfall and flooding.
We report herein the investigation of a leptospirosis outbreak occurring in triathlon competitors on Réunion Island, Indian Ocean. All participants were contacted by phone or email and answered a ...questionnaire. Detection and molecular characterization of pathogenic Leptospira was conducted in inpatients and in rodents trapped at the vicinity of the event. Of the 160 athletes competing, 101 (63·1%) agreed to participate in the study. Leptospirosis was biologically confirmed for 9/10 suspected cases either by real-time PCR or serological tests (MAT or ELISA). The total attack rate, children's attack rate, swimmers’ attack rate, and the attack rate in adult swimmers were respectively estimated at 8·1% 95% confidence interval (CI) 4·3–14·7, 0%, 12·7% (95% CI 6·8–22·4) and 23·1% (95% CI 12·6–33·8). Leptospirosis cases reported significantly more wounds risk ratio (RR) 4·5, 95% CI 1·6–13, wore complete neoprene suits less often (RR 4·3, 95% CI 1·3–14·5) and were most frequently unlicensed (RR 6·6, 95% CI 2·9–14·8). The epidemiological investigation supported that some measures such as the use of neoprene suits proved efficient in protecting swimmers against infection. PCR detection in rats revealed high Leptospira infection rates. Partial sequencing of the 16S gene and serology on both human and animal samples strongly suggests that rats were the main contaminators and were likely at the origin of the infection in humans.
La leptospirose est la maladie bactérienne zoonotique la plus répandue à travers le monde en raison du grand nombre de mammifères réservoirs, qu’ils soient sauvages ou domestiques. Cette pathologie ...serait responsable de plus de 1 million de cas sévères avec environ 60 000 décès par an. Elle reste une maladie largement sous-estimée du fait de l’absence de symptômes spécifiques dans la phase primaire de la maladie et d’un manque de sensibilisation au sein de la communauté médicale, en particulier dans les régions non endémiques. L’incidence moyenne sur une période de plus de vingt ans est de 0,5 cas pour 100 000 habitants en France Métropolitaine. En revanche, elle est endémique dans les départements d’outre-mer avec une incidence pouvant être 50 fois plus élevée.
La leptospirose n’étant pas une maladie à déclaration obligatoire, sa surveillance au niveau national est une surveillance passive basée sur :
– l’activité diagnostic du centre national de référence avec le recueil, si possible, des données cliniques, biologiques et épidémiologiques ;
– l’analyse des données des laboratoires privés Biomnis et Cerba (effectuant les deux tiers des analyses), sans recueil de données autres que la demande de diagnostic biologique de leptospirose ;
– des collaborations entre différents partenaires (laboratoires hospitaliers, Santé publique France, Agences régionales de santé, Écoles nationales vétérinaires).
Le diagnostic biologique s’effectue par la détection de l’ADN bactérien par PCR et par sérologie (Elisa IgM, test de micro-agglutination).
Au cours de ces deux dernières années (2014–2015), un doublement du nombre de cas en France métropolitaine a été constaté, avec plus de 600 cas par an soit une incidence de 1 cas pour 100 000 habitants. Malgré le manque de données disponibles, l’exposition et les facteurs de risques sont principalement associés à des activités récréatives en espace naturel. Cependant, de nouvelles sources de contamination directe semblent apparaître comme le contact avec des nouveaux animaux de compagnies.
Cette augmentation importante de cas humains a également été constatée dans d’autres pays européens. Actuellement, les raisons de cette émergence ne sont pas clairement identifiées et sont probablement multiples (meilleure performance des tests de diagnostic, changement climatique, surpopulation de rongeurs, augmentation de l’activité de loisirs en espace naturel). La surveillance de la leptospirose en France est basée sur une surveillance passive et, de ce fait, non exhaustive. La sensibilisation des professionnels de santé reste donc essentielle. Il est également important de renforcer les études sur la leptospirose afin de mieux décrire l’épidémiologie de cette maladie dite négligée, et de minimiser l’impact que cela pourrait avoir dans le futur.
Leptospira spp. offer many advantages as model bacteria for the study of spirochaetes. However, homologous recombination between introduced DNA and the corresponding chromosomal loci has never been ...demonstrated. A unique feature of spirochaetes is the presence of endoflagella between the outer membrane sheath and the cell cylinder. We chose the flaB flagellin gene, constituting the flagellar core, as a target for gene inactivation in the saprophyte Leptospira biflexa. The amino acid sequence of the FlaB protein of L. biflexa was most similar to those of spirochaetes Brachyspira hyodysenteriae (agent of swine dysentery), Leptospira interrogans (agent of leptospirosis) and Treponema pallidum (agent of syphilis). A suicide vector containing the L. biflexa flaB gene disrupted by a kanamycin marker was UV irradiated or alkali denatured before electroporation. This methodology allowed the selection of many kanamycin‐resistant colonies resulting from single and double cross‐over events at the flaB locus. The double recombinant mutants are non‐motile, as visualized in both liquid and semi‐solid media. In addition, a flaB mutant selected for further analysis was shown to be deficient in endoflagella by electron microscopy. However, most of the transformants had resulted from a single homologous recombination event, giving rise to the integration of the suicide vector. We evaluated the effect of the sacB and rpsL genes in L. biflexa as potential counterselectable markers for allelic exchange, and then used the rpsL system for the positive selection of flaB double recombinants in a streptomycin‐resistant strain. Like the flaB mutant studied above, the Strr double cross‐over mutant was non‐motile and deficient in endoflagella. Our results demonstrate that FlaB is involved in flagella assembly and motility. They also show the feasibility of performing allelic replacement in Leptospira spp. by homologous recombination.