Endofitske bakterije koloniziraju unutrašnjost biljnih tkiva stvarajući pozitivne interakcije sa svojim domaćinom. Glavni cilj ovog istraživanja bio je genotipska i fenotipska karakterizacija ...endofitskih bakterija izoliranih iz korijena, stabiljke i nodula dva različita kultivara soje (AFZG Ana and Gabriela). Izolirano je ukupno 29 endofita iz tri različita tkiva soje. Genotipska karakterizacija uključivala je sekvenciranje rrs gena. Identificirano je pet skupina bakterija različitih rodova: Pseudomonas spp., Sphingomonas spp., Bradyrhizobium spp., Rhizobium spp. i Agrobacterium spp. Većina izolata je Gram negativna, štapićastog oblika, bez mogućnosti stvaranja kapsule. Dokazana je varijabilnost fenotipskih karakteristika izolata, ali i otpornost prema nepovoljnim uvjetima poput povišene temperature, povećanog sadržaja soli te niske i visoke pH vrijednosti. Većina sojeva pokazala je tolerantnost na istraživane antibiotike. Većina katalaza pozitivnih izolata pripadaju rodovima Bradyrhizobium ili Rhizobium, dok su katalaza negativni izolati identificirani kao Pseudomonas, Sphingomonas i Agrobacterium spp. Dokazano je da 85% ispitanih izolata ne reagira na enzim oksidazu, dok oni koji reagiraju pripadaju vrsti Pseudomonas spp. Potrebna je daljnja karakterizacija endofita kako bi se utvrdio njihov utjecaj na razvoj biljke.
The replacement of fruit allergen extracts with component-resolved allergens
seems to be a promising concept. In this regard, the evaluation of allergenic
properties of a particular allergen ...candidate for component-resolved
diagnosis needs to be performed. In this study evaluation of the biochemical
and allergenic properties of cysteine proteinase inhibitor purified from
green kiwifruit (nCPI) was performed. The IgE reactivity was detected both in
vitro (dot blot) and in vivo (skin prick test and basophile activation
assay), while IgG rectivity in both Western blot analysis nd ELISA test.
Biological activity was assesed by examining the growth inhibition of three
plant pathogenic bacterial strains (A.tumefaciens, B. cepacia and, to a
lesser extent, E. carotovora) and two phytopathogenic fungi (A. radicina and
B. cinerea) both in vitro and in vivo. Due to low abundance of nCPI molecule
in kiwifruit the coding sequence of kiwi CPI was efficiently expressed in
Escherichia coli. Molecular identity of rCPI to its natural counterpart has
been clearly demonstrated in structural (mass fingerprint), immunological
(immunoblot and ELISA inhibition) and biological sense (inhibition of papain
proteolytic activity and antifungal activity). Based on the obtained results
it is clear that nCPI is a clinically relevant kiwifruit allergen, and as
such should be involved in the component-resolved diagnosis of kiwifruit
allergy. Standard immunotherapeutic approaches in food allergy are not
adequate due to unacceptably high risk-to-benefit ratio, however
hypoallergenic forms of molecules with reduced IgE binding potential seem to
be promising concept. Diversification of the gene encoding the mature form of
the actinidin was done via error prone PCR, followed by cloning of the
library into the Aga2 yeast surface display expression system. After three
rounds of sorting by FACS, randomly picked colonies were further analyzed by
dot blot and ELISA using pool of 6 kiwifruit allergic patients. Compared to
both natural and recombinant wild type actinidin two of the mutants exhibited
diminished ability to activate basophils. This kind of mutational analysis
could be a useful technique in the development of vaccines for allergy
therapy, since substitution or deletion of amino acids within the IgE binding
epitopes could result in reduction or elimination of the anaphylactic
potential of the molecule.
SA Zamena alergenih ekstrakata pojedinačnim prirodnim i rekombinantnim
alergenima u dijagnostici alergije je obećavajući koncept i naziva se
dijagnostika razdvojena na komponente CRD (engl. component-resolved
diagnosis). U tom smislu, neophodno je proceniti alergeni potencijal svakog
pojedinačnog kandidata za primenu u CRD. U ovoj tezi ocenjivane su
biohemijske i alergene osobine cistein proteaznog inhibitora (nCPI) iz ploda
zelenog kivija. Prečišćeni nCPI pokazao je IgE reaktivnosti in vitro (dot
blot) i in vivo (kožne probe i aktivacija bazofila), dok je IgG reaktivnost
pokazana u Western blotu i ELISA-i. Biološka aktivnost je ocenjena
ispitivanjem antimikrobnog potencijala nCPI naspram tri soja fitopatogenih
bakterija (A. tumefaciens, B. cepacia i u manjem obimu bakterije E.
carotovora) kao i dva izolata fitopatogenih gljiva (A. radicina i B.cinerea),
kako in vitro, tako i in vivo. Zbog slabe zastupljenosti nCPI u plodu kivija
kodirajuća sekvenca nCPI je efikasno eksprimirana u Escherichia coli.
Molekulska identičnost rCPI u odnosu na prirodni molekul pokazana je
strukturnim (maseni otisak prsta) i imunohemijskim (imunoblot i ELISA) i
biološkim (inhibicija proteazne aktivnosti papaina i rasta fitopatogenih
gljiva) testovima. Na osnovu dobijenih rezultata jasno je da je CPI klinički
relevantan alergen i kao takav trebalo bi da bude uključen u dijagnostiku
alergije na kivi razdvojenu na komponente. Standardni imunoterapijski pristup
u tretmanu alergije na hranu nije adekvatan zbog visokog rizika, pa je
primena hipoalergenih molekula koji smanjeno vezuju IgE obećavajući koncept.
Diverzifikacija gena za aktinidin rađena je lančanom reakcijom polimeraze
sklone greškama epPCR (engl. error-prone PCR) koja je praćena kloniranjem
biblioteke u Aga2 ekspresioni sistem za ekspresiju na površini ćelija kvasca.
Nakon tri runde sortiranja, nasumično odabrani klonovi su dalje analizirani
dot blotom i ELI
Zamena alergenih ekstrakata pojedinačnim prirodnim i rekombinantnim
alergenima u dijagnostici alergije je obećavajući koncept i naziva se
dijagnostika razdvojena na komponente CRD (engl. component-resolved
diagnosis). U tom smislu, neophodno je proceniti alergeni potencijal svakog
pojedinačnog kandidata za primenu u CRD. U ovoj tezi ocenjivane su
biohemijske i alergene osobine cistein proteaznog inhibitora (nCPI) iz ploda
zelenog kivija. Prečišćeni nCPI pokazao je IgE reaktivnosti in vitro (dot
blot) i in vivo (kožne probe i aktivacija bazofila), dok je IgG reaktivnost
pokazana u Western blotu i ELISA-i. Biološka aktivnost je ocenjena
ispitivanjem antimikrobnog potencijala nCPI naspram tri soja fitopatogenih
bakterija (A. tumefaciens, B. cepacia i u manjem obimu bakterije E.
carotovora) kao i dva izolata fitopatogenih gljiva (A. radicina i B.cinerea),
kako in vitro, tako i in vivo. Zbog slabe zastupljenosti nCPI u plodu kivija
kodirajuća sekvenca nCPI je efikasno eksprimirana u Escherichia coli.
Molekulska identičnost rCPI u odnosu na prirodni molekul pokazana je
strukturnim (maseni otisak prsta) i imunohemijskim (imunoblot i ELISA) i
biološkim (inhibicija proteazne aktivnosti papaina i rasta fitopatogenih
gljiva) testovima. Na osnovu dobijenih rezultata jasno je da je CPI klinički
relevantan alergen i kao takav trebalo bi da bude uključen u dijagnostiku
alergije na kivi razdvojenu na komponente. Standardni imunoterapijski pristup
u tretmanu alergije na hranu nije adekvatan zbog visokog rizika, pa je
primena hipoalergenih molekula koji smanjeno vezuju IgE obećavajući koncept.
Diverzifikacija gena za aktinidin rađena je lančanom reakcijom polimeraze
sklone greškama epPCR (engl. error-prone PCR) koja je praćena kloniranjem
biblioteke u Aga2 ekspresioni sistem za ekspresiju na površini ćelija kvasca.
Nakon tri runde sortiranja, nasumično odabrani klonovi su dalje analizirani
dot blotom i ELISA testom koristeći serum 6 osoba alergičnih na kivi U
poređenju sa prirodnim i rekombinantnim aktinidinom, dva mutanata su pokazala
smanjenu sposobnost aktivacije bazofila. Ovakav tip mutacione analize mogao
bi da bude korisna tehnika u razvoju vakcina za terapiju alergije, s obzirom
da supstitucija ili delecija aminokiselina u IgE vezujućim epitopima može da
smanji ili eliminiše anafilaktički potencijal molekula.
Smanjenje prirodnih, ograničenih resursa u svijetu potiče ponovnu uporabu otpadih materijala kao i ostataka industrijske prozvodnje. Upotreba ostataka destilacije sirove nafte kao dodatka bitumenu ...nije samo izvor jeftinog aditiva, nego ona znači da otpadni materijal može djelovati kao prirodni poticatelj. U radu je provedena ocjena standardnih i reoloških svojstava uzoraka bitumena dobivenih iz dvije rafinerije s različitim udjelom (1 %, 2 % i 3 %) procesnog ulja. Rezultati su pokazali da se procesno ulje može upotrebljavati kao učinkovit i ekološki prihvatljiv izbor u odnosu na komercijalno skupe dodatke koji se koriste tijekom procesa modifikacije.
Utvrđeno je da soj bakterije Bacillus tequilensis BT21, izoliran iz morskog sedimenta, može proizvesti izvanstaničnu ksilanazu. Gen xynBT21 za kodiranje ksilanaze kloniran je i eksprimiran u ...bakteriji Escherichia coli, gdje je kodirao protein molekularne mase od 23,3 kDa, koji sadržava 213 aminokiselinskih ostataka. Optimalna aktivnost pročišćene rekombinantne ksilanaze postignuta je pri temperaturi od 60 °C i pH=6. Enzim je bio izuzetno stabilan pri alkalnim pH vrijednostima. Pri pH=7 aktivnost mu je bila 100 % tijekom 24 sata, dok se tijekom inkubacije pri pH=8 i 9 aktivnost enzima povećala. Ksilanaza iz B. tequilensis imala je alkalnu pI vrijednost od 9,4; a pripada obitelji glikozilnih hidrolaza 11. Ispitano je djelovanje ksilanaze XynBT21 na ksilan iz bukve i ksilooligosaharide. Njihovom hidrolizom dobivena je pretežno ksilobioza (X2) uz manju količinu ksiloze (X1), zbog čega je zaključeno da je XynBT21 vjerojatno endoksilanaza. Enzimskom hidrolizom pšeničnih mekinja potvrđeno je da ksilanaza može proizvesti ksilobiozu na toj podlozi. Ksilooligosaharidi, osobito ksilobioza, imaju snažna bifidogena svojstva, pa se sve češće primjenjuju kao prebiotici. Ovo je prvi rad koji opisuje primjenu nove ksilanaze iz morske bakterije B. tequilensis BT21 za oslobađanje ksilobioze iz pšeničnih mekinja.
Within the project of distinguishing marble monuments
of Noricum and Pannonia, 32 marble monument
samples were taken from the Museum of Slavonia, a Dalj
marble stella was taken from the Town museum ...of Sremski
Karlovci, and several marble monument samples were taken
from the Archaelogical museum of Zagreb originating
from Osijek and its surrounding area. The paper analyses
the results of monument material provenance.
Mursa is one of those Pannonian towns that do not
possess a stone deposit in their immediate neighbourhood
and especially not of high quality as white marble. In stone
supply, the town depended on the river as an only rational
transport way for heavy loads and the Drava was the ideal
river for this purpose because it flows from the area that
was abundant with white marble. One of the largest ancient
white marble quarries, Gummern near Villach in Austria,
was opened on its very bank. Nowadays it has been clearly
determined due to various analyses that since the beginning
of the 1st century until Traian times, the only quarry of
supraregional significance was just Gummern. Only after
establishing the Traian colony of Poetovio in the early 2nd
century, Gummern was adjoined by the smaller quarries of
Pohorje in the inter-provincial trade which until then were
used for the Poetovio needs only. The position of Mursa
facilitated a supply from another, southeast route directly
from the Mediterranean Sea upstream the Danube to the
Drava. Still, it was possible only after Traian had opened
the Iron gate of the Đerdap. The supply of high-grade neogenic
solid limestone, of which the most stone monuments
in Mursa were built, went most probably from Aquincum
the Danube downstream.
Our analyses have confirmed that the most of the marble
and marble products arrived to Mursa by the Drava via
Poetovio from Gummern or Pohorje. The Mediterranean
marble in Mursa, unlike Sirmium, appears only by exception.
Marble products came mainly to Mursa as already
finished or semi-manufactured product and only in exceptional
cases we can talk of products of local origin. The monuments
that are made of limestone, confirm that such production
existed taking imported marble shapes as a model.
The processes bound to production and trade of stone
monuments in Pannonia are confirmed to have not been
comprehensible concerning marble monuments without
considering stone-carving workshops of Noricum but for
Mursa, besides those active in Poetovio, and those bound
to Virunum.
Na kvalitetu otiska u suvremenoj grafičkoj tehnologiji utječe velik broj čimbenika. Stoga ih je potrebno kontrolirati na temelju standardnih vrijednosti kako bismo dobili predvidljiv i ponovljiv ...rezultat. Da bi se mogli ostvariti ujednačeni otisci visoke kvalitete, u reprodukcijski proces je potrebno ukomponirati upravljanje bojama (eng. color management) s dobrom kalibracijom i izrađenim ICC profilima tiskarskih strojeva. U ovom radu analiziran je reprodukcijski proces na osnovi ISO specifikacija.
Tijekom vremena zabilježena je pojava korozionih produkata u eksploataciji cjevovoda termoelektrane. Za određivanje uzroka upotrijebljena je metoda rendgenske difrakcije i pretražne elektronske ...mikroskopije. Za istraživanje su korišteni uzorci u obliku praha ili pločica. Pripremljeni uzorci su mjereni tehnikom filma (Debye Schererr kamera) ili brojenja na uređaju za difraktometriju tipa Philips (uz upotrebu CoKα zračenja), te pretražnom elektronskom mikroskopijom i mikroanalizom tipa Joel. Upotrebom metode vanjskog standarda određena je debljina filma. Dobiveni rezultati analize matematički su obrađeni.
Cilj ovog istraživanja bio je molekularnim metodama odrediti virulenciju i filogenetska obilježja virusa newcastleske bolesti (NB) dokazanog u čvorka (Sturnus vulgaris) u Makedoniji. Pokazalo se da ...nukleotidni slijed na mjestu cijepanja gena F daje aminokiselinski sastav specifičan za virulentne sojeve virusa NB s fenilalaninom na poziciji 117 i uzastopnim bazičnim aminokiselinama između pozicija 112 i 116, tj. 112RRQKR*FIG119. Filogenetska analiza područja od 374 bp fuzijskog (F) gena pokazala je da izdvojeni soj pripada podtipu VIId skupine II virusa NB, a srodan je virulentnim sojevima dokazanima u domaće peradi u Makedoniji 2005. i 2006. kao i s virusima izdvojenima iz peradi i divljih ptica u Srbiji i Bugarskoj 2006. i 2007. Epizootiološki podatci upućuju na zaključak da su čvorci vjerojatno bili zaraženi kao posljedica pojave NB u domaće peradi te nisu imali nikakvu ulogu na pojavu i širenje virusa na domaću perad. Ovo je prvo izvješće o dokazu, molekularnim i filogenetskim obilježjima virulentnog virusa NB u divljih ptica u Makedoniji.
Cilj istraživanja bio je ispitati neka fizikalna, mehanička, toplinska i morfološka svojstva polipropilenskih kompozita s drvnim brašnom ili celuloznim vlaknima kao punilom. Polipropilen kao ...polimerna matrica te drvno brašno ili celulozna vlakna kao punilo za ojačanje upotrijebljeni su za izradu kompozita uz pomoć jednostrukoga vijčastog ekstrudera. Istraživanjem su određena fizikalna svojstva kompozita, npr. gustoća, te mehanička svojstva kao što su čvrstoća pri savijanju i modul savitljivosti, vlačna čvrstoća i modul elastičnosti te savojna žilavost. Usto je termogravimetrijskom analizom (TGA/DTA) ispitano toplinsko ponašanje kompozita, a skeniranjem elektronskim mikroskopom (SEM) napravljena je morfološka karakterizacija uzorka. Utvrđeno je da se dodatkom punila gustoća kompozita povećava. Rezultati ispitivanja mehaničkih svojstava pokazali su da su čvrstoća pri savijanju i vlačna čvrstoća kompozita s drvnim brašnom veće od čvrstoće kompozita s celuloznim vlaknima, dok su vrijednosti modula savitljivosti, modula elastičnosti i savojne žilavosti veće za kompozite s celuloznim vlaknima nego za kompozite s drvnim brašnom kao punilom. SEM slike pokazuju da se čestice drvnog brašna i celulozna vlakna raspršuju na različite lokacije u polipropilenskoj matrici. Prema rezultatima TGA analize, utvrđeno je da je toplinska degradacija kompozita s drvnim brašnom ili celuloznim vlaknima kao punilom manja od degradacije kompozita s čistim polimerom.
Uporabom naftnih (uljnih) škriljevaca nastaje obilje ostataka naftnog škriljevca, koji ne samo da mogu izravno uzrokovati ozbiljno onečišćenje okoliša, već i dovesti do gubitka resursa. U ovom radu ...provedena je usporedba metode izluživanja kiselinom i metode otapanja lužinom kako bi se dobili optimalni uvjeti za obradu i dobivanje bijele čađe, koji su određeni na sljedeći način: maseni udjel NaOH je 8 %, vrijeme otapanja u lužini je 5 h i temperatura reakcije 100 °C. Potom su analizirane karakteristike dobivene bijele čađe pomoću XRD-a, SEM-a i IR spektroskopije. Rezultati su pokazali da proizveden silicijev dioksid ima veličinu čestica 20 – 30 nm i čistoću od 98,4 %. Priprava visokokvalitetne bijele čađe dobar je način za postizanje dovoljnog i razumnog korištenja ostataka naftnog škriljevca, koje može imati brojne ekološke i društvene koristi.