Invazivne gljivične infekcije uzrokovane vrstama iz roda Candida česte su u kritično oboljelih bolesnika i povezane su sa značajnim morbiditetom i mortalitetom. Pravovremeno postavljanje dijagnoze je ...od presudnog značaja budući da svako odgađanje primjene antifungalnih lijekova utječe na ishod liječenja. Zbog ograničenja klasičnih dijagnostičkih metoda zasnovanih na kultivaciji - njihove sporosti i nedovoljne osjetljivosti, nekultivacijske imunološke i molekularne dijagnostičke metode sve više nalaze svoje mjesto u dijagnostici invazivne kandidijaze. Nekultivacijske metode, kao što je određivanje biomarkera ili lančana reakcija polimeraze (engl. Polymerase Chain Reaction, PCR) imaju veliki dijagnostički potencijal. Primjerice, negativan rezultat PCR testa ili 1,3-β-D-glukana (BDG) ima visoku negativnu prediktivnu vrijednost (NPV) tj. veliku vjerojatnost odsustva bolesti. U svrhu povećanja pouzdanosti pojedine metode preporučuje se kombiniranje različitih metoda kao i tumačenje dobivenih rezultata u skladu s kliničkim, epidemiološkim, laboratorijskim i drugim podatcima.
We examined single nucleotide rs11465553 polymorphism in the interleukin-17F gene causing valine to isoleucine substitution at the position 155 in the third exon of IL17F gene in Serbian patients ...with psoriasis and healthy blood donors. For the first time we found rs11465553 G (valine) and A (isoleucine) allele frequency in healthy Serbian population and in psoriasis patients, but without statistically significant difference between the two groups.
Svrha rada: Željelo se procijeniti stvarne parametre bakterijskog opterećenja u subgingivnom plaku metodom RT-PCR (lančanom reakcijom polimeraze u stvarnom vremenu) u slučaju parodontitisa i
...periimplantitisa te njihovu povezanost s kliničkim parodontološkim pokazateljima. Materijali i metode: Prema postavljenom studijskom dizajnu složeno je pet skupina ispitanika – s blagim/umjerenim parodontitisom, s teškim parodontitisom, s periimplantitisom, zdravim parodontom i zdravim periimplantatnim tkivom. Uzorci subgingivnog plaka uzeti su papirnatim štapićima koji su 30 sekunda bili umetnuti u džep/sulkus. Proveden je standardni test ParodontoScreen za identifikaciju ciljnih oportunističkih patogena (A. actinomycetemcomitans, P. gingivalis, T. forsythia, P. intermedia, T. denticola) RT-PCR metodom. Rezultati: Parametri bakterijskog opterećenja pokazali su značajnu tendenciju porasta pri progresiji parodontitisa i periimplantitisa. Univarijantnom analizom svaka ciljna srednja razina bakterijskog opterećenja statistički je bila povezana s parodontitisom ili periimplantitisom (p < 0,05) kada su parametri bakterijskog opterećenja na zdravim mjestima korišteni kao referentni podatci. Najveće korelacijske vrijednosti ustanovljene su između parametara dubine sondiranja i bakterijskog opterećenja bakterijama A. actinomycetemcomitans (r = 0,37; p < 0,05) i P. gingivalis (r = 0,28; p < 0,05) te također između gubitka kliničkog pričvrstka i bakterijskog opterećenja bakterijama A. actinomycetemcomitans (r = 0,38; p < 0,05) i P. gingivalis (r = 0,24; p < 0,05). Zaključak: Parodontitis i periimplantitis povezani su s istim mikrobnim patogenima, iako su se obrasci distribucije bakterijskog opterećenja i parametri zabilježeni s pomoću RT-PCR-a mogli razlikovati i povezati s individualnim stanjima povezanima s pacijentima i uznapredovalošću patologije.
Genska svojstva virusa goveđe leukemije (BLV) važan su dio znanstvenih istraživanja u mnogim zemljama u svijetu. Prema sekvenciranoj regiji gena - env BLV izolati nalaze se u različitim područjima ...širom svijeta te je dokazano i klasificirano do deset različitih genskih skupina. Kao dio istraživanja pratili smo epizootiološki status BLV-a u Rusiji. Za pokusne životinje (n = 54) odabrane su holštajnsko-frizijska pasmina (uvozna pasmina) i rusko šaro goveda (lokalna pasmina), koje potječu s poljoprivrednih dobara regije Tyumen. Kako bi se otkrile zaražene jedinke, upotrijebljene su serološke metode probira (ELISA, AGID). Također je u svim pokusnim skupinama provedena imunološka procjena životinja. Primijenjena je primarna A-nested-PCR analiza koja je rezultirala fragmentom gena env 444 bp. RFLP. Analizom tog fragmenta u 94 % uzoraka ustanovljen je belgijski tip virusa leukemije, u 4 % uzoraka australijski tip, a u 2 % mješoviti tip. Filogenetskom procjenom genoma env BLV-a u izoliranim uzorcima i imunološkom procjenom zaraženih životinja dobiveni su najnoviji podaci o genskim skupinama BLV-a u Ruskoj Federaciji.
L-cistein sulfinat dekarboksilaza (EC 4.1.1.29) je enzim koji određuje brzinu biosinteze taurina, te katalizira dekarboksilaciju L-cistein sulfinskekiseline u hipotaurin. Identifikacija nove ...L-cistein sulfinat dekarboksilaze koja bi mogla poboljšati biosintetičku učinkovitost taurina vrlo je bitna. Još neistraženi gen za dekarboksilazu, undec1A, identificiran je u prethodnom radu probirom sekvencija DNA iz neuzgojenih mikroorganizama iz tla. Uproteinu Undec1A primjenjena je nasumična mutageneza pomoću sekvencijalne lančane reakcije polimeraze s pogreškama. Mutirani protein Undec1A-1180, izdvojen iz zbirke tako dobivenih različitih mutiranih proteina, imao je 5,62 puta veću specifičnu aktivnost od ishodnogproteina Undec1A pri temperaturi od 35 °C i pH=7,0. Rezultati molekulskog uklapanja potvrđuju da aminokiselinski ostaci Ala235, Val237, Asp239, Ile267, Ala268 i Lys298 u proteinu Undec1A-1180 pomažu pri prepoznavanju i katalizi molekula L-cistein sulfinske kiseline. Ovi bi rezultati mogli poslužiti kao osnova za definiranje svojstava proteina Undec1A-1180.Tehnologija usmjerene evolucije prikladna je za unapređenje biotehnološke primjene gena dobivenih iz metagenoma.
Uzročnik virusnog proljeva goveda (BVDV) jedan je od najčešćih i ekonomski važnih patogena preživača koji uzrokuje znatne financijske gubitke u stočarskoj industriji širom svijeta. Razvoj brzih i ...točnih dijagnostičkih metoda iznimno je važan za kontrolu i iskorjenjivanje zaraze BVDV-om. Cilj ovog istraživanja bio je razviti novu metodu za brzo otkrivanje BVDV-a baziranu na kombinaciji metoda umnožene rekombinazne polimeraze i test-traka za „lateral flow“ analizu. Oblikovane su početnice i probe za umnažanje rekombinazne polimeraze usmjerene na specifični konzervirani 5’-UTR u genomu BVDV-a. Umnažanje se moglo završiti pri konstantnoj temperaturi od 38 °C tijekom 15 minuta i produkt umnažanja je lako vizualiziran na jednostavnoj test-traci za „lateral flow“ analizu unutar 5 minuta. Test je ograničen na 20 kopija po reakciji, pri čemu nije bilo križne reaktivnosti s drugim goveđim zaraznim virusima kao što su infektivni rinotraheitis virusa goveda (IBRV), goveđi enterovirus (BEV), goveđi koronavirus (BcoV), virus goveđe parainfluence tipa 3 (BPIV-3), virus gljivične ephemeralne groznice (BEFV) i goveđi respiratorni sincicijski virus (BRSV). Učinkovitost kombinacije navedenih metoda istražena je i s obzirom na usporedbu osjetljivosti odnosno točnosti koja se dobiva uporabom RT-PCR metode. Od 284 skupna uzorka mlijeka iz spremnika, kombinacijom metoda umnožene rekombinazne polimeraze i test-traka za „lateral flow“ analizu utvrđen je 51 pozitivan uzorak, a RT-PCR 52 pozitivna uzorka. Stopa podudarnosti između navedenih metoda bila je 97,54 % (277/284).
PDF
