Para determinar a qualidade fisiológica de lotes de sementes o teste de condutividade elétrica tem se mostrado eficiente devido sua rapidez e facilidade na execução. Devido à escassez de informações na literatura referentes à metodologia do teste de condutividade elétrica para sementes de linhaça, neste trabalho o objetivo foi avaliar o teste de condutividade elétrica, considerando, lotes, número de sementes e volumes de água, buscando estabelecer a metodologia mais adequada para a estratificação de lotes. Inicialmente, determinou-se, o teor de água, germinação, primeira contagem de germinação, emergência de plântulas, índice de velocidade de emergência, comprimento, massa fresca e seca de plântulas. O teste de condutividade elétrica foi realizado com 25 e 50 sementes embebidas em 25, 50 e 75 mL de água deionizada nas temperaturas de 25 e 30 °C, com leituras 24 horas de embebição. O teste de condutividade elétrica conduzido com quatro repetições de 25 sementes puras embebidas em 75 mL de água deionizada, na temperatura de 30 ºC, permitiu a separação dos lotes, mostrando-se promissor na avaliação da qualidade das sementes de linhaça.