UP - logo
E-viri
Celotno besedilo
Odprti dostop
  • Filogenetska analiza i mole...
    Kumar, Aditya; Singh, Arbind; Kumar Verma, Amit; Sagar Maurya, Prem; Prajapati, M. R.; Kumar, Amit; Sarkar, T. K.

    Veterinarski arhiv 93, Številka: 5
    Paper

    Ekonomski gubici koje u Indiji uzrokuju krpelji i bolesti koje se prenose krpeljima procjenjuju se na oko 498,7 milijuna američkih dolara. Među tim je bolestima i anaplazmoza, koja uzrokuje znatnu smrtnost i pobol među životinjama, što vodi do velikih gubitaka u proizvodnji. S obzirom na oskudne podatke o molekularnoj karakterizaciji, filogenetskoj i matriksnoj analizi bakterije Anaplasma spp. u goveda, cilj je ovog rada bio dobiti znanstvene informacije iz navedenih područja istraživanja na terenskim izolatima Anaplasma spp. koja inficira mliječna goveda u zapadnom dijelu savezne države Uttar Pradesh u Indiji. Prikupljeni su uzorci krvi od 200 goveda koja su pokazivala kliničke znakove anaplozmoze. Za detekciju bakterije učinjena je analiza razmaza krvi i molekularna potvrda PCR-om. Karakterizacija izolata na molekularnoj razini provedena je sekvenciranjem gena 16S rRNA i njegovom bioinformatičkom analizom upotrebom MEGA verzije X. Mikroskopskim je pregledom Anaplasma spp. otkrivena u 106 uzoraka (53%), dok je PCR analizom gena 16S rRNA pozitivno bilo 176 uzoraka (88%). Sekvenciranje gena 16S rRNA i bioinformatička analiza slijedova otkrili su postojanje triju različitih populacija bakterije Anaplasma spp., i to Anaplasma marginale i dviju drugih anaplazmi genetski povezanih s vrstama Anaplasma capra i Anaplasma ovis koje cirkuliraju u krvi zaraženih goveda. Svi su terenski izolati bakterija A. marginale i A. ovis iz države Uttar Pradesh svrstani u jednu filogenetsku kladu zajedno s izolatima iz Irana, Brazila, Tajlanda i Izraela, dok su izolati A. capra iz Indije svrstani u kladu s A. capra iz Japana, Kine i Južne Koreje. Prema autorovim je saznanjima ovo prvo izvješće o vrsti Anaplasma capra i Anaplasma ovis u goveda u Indiji što upućuje na potencijal goveda da budu rezervoari ovih patogena. To pak upućuje na potrebu za daljnjim istraživanjima bakterije Anaplasma spp. s obzirom na njezinu emergenciju i zoonotski potencijal.