-
The influence of storage conditions and DNA extraction protocol on the results of molecular analysis of the European spruce bark beetle (Ips typographus L.) = Vpliv postopkov shranjevanja in ekstrakcije celokupne DNA na rezultate molekularne analize osmerozobega smrekovega lubadarja (Ips typographus L.)Devetak, Zina ...Za uspeh molekularne identifikacije podlubnikov je ključna zadostna količina kakovostnega ekstrakta DNA. Pri raziskavi vrste smo se osredotočili na vpliv različnih postopkov shranjevanja osebkov Ips ... typographus(L.) in različnih protokolov ekstrakcije DNA na količino in kakovost DNA, namenjene za uporabo v molekularni diagnostiki. Odrasle hrošče smo zamrznili pri -20 °C na dva načina, v etanolu in na suho. Ekstrakcije smo opravili po štirih različnih postopkih. Primerjali smo količino pridobljene DNA. Kakovost ekstrahirane DNA smo ocenili s polimerazno verižno reakcijo in sekvenciranjem po Sangerju. Način shranjevanja ni statistično značilno vplival na količino pridobljene DNA. DNA višje kakovosti smo pridobili iz hroščev, ki so bili zamrznjeni v etanolu. Le dva postopka ekstrakcije DNA sta dala DNA, uporabno za sekvenciranje. V količini pridobljene DNA se pri sekvenciranju uspešna postopka nista pomembno razlikovala. Določili smo optimalno kombinacijo postopkov shranjevanja v etanolu pri -20 °C in ekstrakcije celokupne DNA z ekstrakcijskim kitom Nucleospin Insect DNA proizvajalca Macherey Nagel, ki omogoča časovno učinkovito identifikacijo.Source: Acta Silvae et Ligni. - ISSN 2335-3112 ([Št.] 132, 2023, str. 29-38)Type of material - article, component partPublish date - 2023Language - englishCOBISS.SI-ID - 180304131
Author
Devetak, Zina |
Kavčič, Andreja, biologinja |
De Groot, Maarten, entomolog |
Piškur, Barbara, 1979-
Topics
zgodnje zaznavanje |
shranjevanje osebkov |
ekstrakcijski postopek |
polimerazna verižna reakcija |
PCR |
sekvenciranje po Sangerju |
molekularna diagnostika |
early detection |
specimen storage |
total DNA extraction |
PCR |
polymerase chain reaction |
Sanger sequencing |
molecular diagnostics
Author | Devetak, Zina ... |
Title | The influence of storage conditions and DNA extraction protocol on the results of molecular analysis of the European spruce bark beetle (Ips typographus L.) = Vpliv postopkov shranjevanja in ekstrakcije celokupne DNA na rezultate molekularne analize osmerozobega smrekovega lubadarja (Ips typographus L.) |
Publication date | 2023-12-31 |
COBISS.SI-ID | 180304131 |
Publication version in repository | Publisher's version |
Publication licence | Creative Commons Attribution-ShareAlike 4.0 International |
Embargo | Immediate publication for public |
Project(s) from which the publication was funded
Title | Acronym | Project ID | Funder |
---|---|---|---|
Gozdna biologija, ekologija in tehnologija | P4-0107-2020 |
Javna agencija za znanstvenoraziskovalno in inovacijsko dejavnost Republike Slovenije |
|
Administration of the Republic of Slovenia for Food Safety, VeterinarySector and Plant Protection | C2337-21-000016 | ||
Administra-tion of the Republic of Slovenia for Food Safety, VeterinarySector and Plant Protection | C2337-22-000020 | ||
Javna gozdarska služba | JGS | JGS |
Ministrstvo za kmetijstvo, gozdarstvo in prehrano |
Files that belong to the publication
Link |
---|
https://dirros.openscience.si/IzpisGradiva.php?id=18084 |
Shelf entry
Permalink
- URL:
Impact factor
Access to the JCR database is permitted only to users from Slovenia. Your current IP address is not on the list of IP addresses with access permission, and authentication with the relevant AAI accout is required.
Year | Impact factor | Edition | Category | Classification | ||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
JCR | SNIP | JCR | SNIP | JCR | SNIP | JCR | SNIP |
Select the library membership card:
DRS, in which the journal is indexed
Database name | Field | Year |
---|
Links to authors' personal bibliographies | Links to information on researchers in the SICRIS system |
---|---|
Devetak, Zina | 32514 |
Kavčič, Andreja, biologinja | 33222 |
De Groot, Maarten, entomolog | 29092 |
Piškur, Barbara, 1979- | 25448 |
Select pickup location:
Material pickup by post
Notification
Subject headings in COBISS General List of Subject Headings
Select pickup location
Pickup location | Material status | Reservation |
---|
Please wait a moment.