-
Stress knowledge map [Elektronski vir] : a knowledge graph resource for systems biology analysis of plant stress responsesBleker, Carissa ...Stress Knowledge Map (SKM; https://skm.nib.si) is a publicly available resource containing two complementary knowledge graphs that describe the current knowledge of biochemical, signaling, and ... regulatory molecular interactions in plants: a highly curated model of plant stress signaling (PSS; 543 reactions) and a large comprehensive knowledge network (488 390 interactions). Both were constructed by domain experts through systematic curation of diverse literature and database resources. SKM provides a single entry point for investigations of plant stress response and related growth trade-offs, as well as interactive explorations of current knowledge. PSS is also formulated as a qualitative and quantitative model for systems biology and thus represents a starting point for a plant digital twin. Here, we describe the features of SKM and show, through two case studies, how it can be used for complex analyses, including systematic hypothesis generation and design of validation experiments, or to gain new insights into experimental observations in plant biology.Vir: Plant communications [Elektronski vir]. - ISSN 2590-3462 (Vol. 5, iss. 6, [art. no.] 100920, 10 Jun. 2024, str. 1-15)Vrsta gradiva - e-članekLeto - 2024Jezik - angleškiCOBISS.SI-ID - 198383363
Avtor
Bleker, Carissa |
Ramšak, Živa, 1985- |
Bittner, Andras |
Podpečan, Vid |
Zagorščak, Maja |
Wurzinger, Bernhard |
Baebler, Špela |
Petek, Marko, biotehnolog, 1983- |
Križnik, Maja, 1989- |
Županič, Anže |
Gruden, Kristina
Teme
SKM |
graf znanja |
mreža znanja |
vstopna točka |
digitalni dvojček rastline |
odzivi rastlin na stres |
signalizacija rastlin |
sistemska biologija |
Stress knowledge map |
knowledge graph |
knowledge network |
entry point |
plant digital twin |
plant stress responses |
plant signaling |
systems biology
![loading ... loading ...](themes/default/img/ajax-loading.gif)
Avtor | Bleker, Carissa ... |
Naslov | Stress knowledge map [Elektronski vir] : a knowledge graph resource for systems biology analysis of plant stress responses |
Datum objave | 2024-06-10 |
COBISS.SI-ID | 198383363 |
Verzija objave v repozitoriju | Založnikova različica |
Licenca objave v repozitoriju | Creative Commons Priznanje avtorstva 4.0 Mednarodna |
Embargo | Takojšnja javna objava |
Projekti, iz katerih je bila financirana objava
Naziv | Akronim | Številka projekta | Financer |
---|---|---|---|
Accelerated Development of multiple-stress tolerAnt PoTato | ADAPT | 862858 |
European Commission |
Odkrivanje strukturnih in dinamičnih lastnosti mehanizmov rastlinskega odgovora z uporabo pristopov sistemske biologije | Z7-1888-2019 |
Javna agencija za znanstvenoraziskovalno in inovacijsko dejavnost Republike Slovenije |
|
Odkrivanje mehanizmov učinkovitosti in specifičnosti imunske signalizacije v krompirju z inovativnim pridobivanjem podatkov in modeliranjem | J4-1777-2019 |
Javna agencija za znanstvenoraziskovalno in inovacijsko dejavnost Republike Slovenije |
|
Biotehnologija in sistemska biologija rastlin | P4-0165-2022 |
Javna agencija za znanstvenoraziskovalno in inovacijsko dejavnost Republike Slovenije |
|
Vzpostavitev metodologij za študij imunosti krompirja na nivoju posameznih celic | N4-0199-2021 |
Javna agencija za znanstvenoraziskovalno in inovacijsko dejavnost Republike Slovenije |
|
Translacijska genomika in dinamično modeliranje za razumevanje odziva rastlin na stres | Z4-50146-2023 |
Javna agencija za znanstvenoraziskovalno in inovacijsko dejavnost Republike Slovenije |
|
Connect and align ELIXIR Nodes to deliver sustainable FAIR life-science data management services | ELIXIR-CONVERGE | 871075 |
European Commission |
Datoteke, ki spadajo k objavi
Stroški objave
Vrsta stroška | Skupni stroški | Plačila |
---|---|---|
APC – strošek objave članka | 2460.00 € |
Vnos na polico
Trajna povezava
- URL:
Faktor vpliva
Dostop do baze podatkov JCR je dovoljen samo uporabnikom iz Slovenije. Vaš trenutni IP-naslov ni na seznamu dovoljenih za dostop, zato je potrebna avtentikacija z ustreznim računom AAI.
Leto | Faktor vpliva | Izdaja | Kategorija | Razvrstitev | ||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
JCR | SNIP | JCR | SNIP | JCR | SNIP | JCR | SNIP |
Baze podatkov, v katerih je revija indeksirana
Ime baze podatkov | Področje | Leto |
---|
Povezave do osebnih bibliografij avtorjev | Povezave do podatkov o raziskovalcih v sistemu SICRIS |
---|---|
Bleker, Carissa | 54569 |
Ramšak, Živa, 1985- | 34502 |
Bittner, Andras | ![]() |
Podpečan, Vid | 29539 |
Zagorščak, Maja | 39320 |
Wurzinger, Bernhard | ![]() |
Baebler, Špela | 19116 |
Petek, Marko, biotehnolog, 1983- | 29617 |
Križnik, Maja, 1989- | 37409 |
Županič, Anže | 27522 |
Gruden, Kristina | 12688 |
Izberite prevzemno mesto:
Prevzem gradiva po pošti
Obvestilo
Gesla v Splošnem geslovniku COBISS
Izbira mesta prevzema
Mesto prevzema | Status gradiva | Rezervacija |
---|
Prosimo, počakajte trenutek.